MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_015722	TCAG	2	8	1175452	1175459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27503	NC_015722	CTT	2	6	1175504	1175509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27504	NC_015722	TAA	2	6	1175526	1175531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27505	NC_015722	GATTTT	2	12	1175533	1175544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27506	NC_015722	AGC	2	6	1175557	1175562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27507	NC_015722	CAG	2	6	1175567	1175572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27508	NC_015722	GAT	2	6	1175588	1175593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27509	NC_015722	CAT	2	6	1175594	1175599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27510	NC_015722	TCA	2	6	1175611	1175616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27511	NC_015722	TTG	2	6	1175634	1175639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27512	NC_015722	TTC	2	6	1175682	1175687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27513	NC_015722	CCACT	2	10	1175753	1175762	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27514	NC_015722	TA	3	6	1175814	1175819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27515	NC_015722	AAT	2	6	1175828	1175833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27518	NC_015722	GATT	2	8	1175950	1175957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27519	NC_015722	T	6	6	1175980	1175985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27520	NC_015722	AATC	2	8	1176057	1176064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27521	NC_015722	AT	3	6	1176093	1176098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27522	NC_015722	GCC	2	6	1176124	1176129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27523	NC_015722	T	7	7	1176152	1176158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27524	NC_015722	CGG	2	6	1176219	1176224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27529	NC_015722	CAA	2	6	1176538	1176543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27532	NC_015722	TTTG	2	8	1176691	1176698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27533	NC_015722	T	6	6	1176718	1176723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27535	NC_015722	CT	3	6	1176782	1176787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27548	NC_015722	CTT	2	6	1177462	1177467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320518
27549	NC_015722	TTA	2	6	1177476	1177481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320518
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27554	NC_015722	TA	4	8	1177636	1177643	50 %	50 %	0 %	0 %	339320518
27555	NC_015722	AAG	2	6	1177656	1177661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320518
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27559	NC_015722	TA	3	6	1177729	1177734	50 %	50 %	0 %	0 %	339320518
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27593	NC_015722	CTC	2	6	1179075	1179080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27596	NC_015722	CT	3	6	1179209	1179214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27597	NC_015722	TCAT	2	8	1179258	1179265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27598	NC_015722	TTA	2	6	1179282	1179287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27606	NC_015722	G	8	8	1179541	1179548	0 %	0 %	100 %	0 %	339320519
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27608	NC_015722	GCGG	2	8	1179574	1179581	0 %	0 %	75 %	25 %	339320519
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27621	NC_015722	AT	3	6	1180061	1180066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27622	NC_015722	TCT	2	6	1180111	1180116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27624	NC_015722	T	6	6	1180151	1180156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.