MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_015722	CTG	2	6	1091691	1091696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25503	NC_015722	AGGG	2	8	1091734	1091741	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_015722	GTG	2	6	1091783	1091788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_015722	ATA	2	6	1091803	1091808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25506	NC_015722	CAAC	2	8	1091871	1091878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25507	NC_015722	G	7	7	1091894	1091900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25508	NC_015722	CAA	2	6	1091930	1091935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320426
25509	NC_015722	TTG	2	6	1091954	1091959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320426
25510	NC_015722	GCT	2	6	1091991	1091996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320426
25511	NC_015722	AT	3	6	1092001	1092006	50 %	50 %	0 %	0 %	339320426
25512	NC_015722	ACCA	2	8	1092011	1092018	50 %	0 %	0 %	50 %	339320426
25513	NC_015722	CTA	2	6	1092025	1092030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320426
25514	NC_015722	TA	3	6	1092111	1092116	50 %	50 %	0 %	0 %	339320426
25515	NC_015722	GGTAA	2	10	1092118	1092127	40 %	20 %	40 %	0 %	339320426
25516	NC_015722	ATT	2	6	1092334	1092339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320427
25517	NC_015722	A	6	6	1092349	1092354	100 %	0 %	0 %	0 %	339320427
25518	NC_015722	CTT	2	6	1092363	1092368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25519	NC_015722	AGC	2	6	1092410	1092415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25520	NC_015722	TTGC	2	8	1092440	1092447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25521	NC_015722	TA	3	6	1092540	1092545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_015722	ATT	2	6	1092577	1092582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_015722	TTCC	2	8	1092603	1092610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25524	NC_015722	AT	3	6	1092618	1092623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25525	NC_015722	TAC	2	6	1092651	1092656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25526	NC_015722	ATT	2	6	1092775	1092780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320428
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25531	NC_015722	GTTT	2	8	1093047	1093054	0 %	75 %	25 %	0 %	339320429
25532	NC_015722	AATTTC	2	12	1093075	1093086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339320429
25533	NC_015722	CCA	2	6	1093169	1093174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339320429
25534	NC_015722	ATT	2	6	1093193	1093198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320429
25535	NC_015722	ATT	2	6	1093216	1093221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320429
25536	NC_015722	ATA	2	6	1093233	1093238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320429
25537	NC_015722	T	6	6	1093280	1093285	0 %	100 %	0 %	0 %	339320429
25538	NC_015722	GAT	2	6	1093348	1093353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320429
25539	NC_015722	TTA	2	6	1093358	1093363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320429
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25541	NC_015722	ATTA	2	8	1093467	1093474	50 %	50 %	0 %	0 %	339320430
25542	NC_015722	AT	3	6	1093520	1093525	50 %	50 %	0 %	0 %	339320430
25543	NC_015722	TTC	2	6	1093561	1093566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320430
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25545	NC_015722	T	6	6	1093587	1093592	0 %	100 %	0 %	0 %	339320430
25546	NC_015722	GT	3	6	1093593	1093598	0 %	50 %	50 %	0 %	339320430
25547	NC_015722	TAG	2	6	1093600	1093605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320430
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25549	NC_015722	T	6	6	1093683	1093688	0 %	100 %	0 %	0 %	339320430
25550	NC_015722	AT	3	6	1093745	1093750	50 %	50 %	0 %	0 %	339320430
25551	NC_015722	T	8	8	1093850	1093857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_015722	GCA	2	6	1093966	1093971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25553	NC_015722	T	7	7	1094038	1094044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_015722	TA	3	6	1094056	1094061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25555	NC_015722	TAA	2	6	1094102	1094107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25556	NC_015722	ATT	2	6	1094118	1094123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25557	NC_015722	TG	3	6	1094150	1094155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25558	NC_015722	GT	3	6	1094156	1094161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25559	NC_015722	ACA	2	6	1094179	1094184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25560	NC_015722	TTTAG	2	10	1094191	1094200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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25563	NC_015722	AG	3	6	1094395	1094400	50 %	0 %	50 %	0 %	339320431
25564	NC_015722	TTACC	2	10	1094409	1094418	20 %	40 %	0 %	40 %	339320431
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25571	NC_015722	A	6	6	1094623	1094628	100 %	0 %	0 %	0 %	339320431
25572	NC_015722	ACT	2	6	1094639	1094644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320431
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25583	NC_015722	TGA	2	6	1095516	1095521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25588	NC_015722	AAG	2	6	1095628	1095633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25589	NC_015722	AT	3	6	1095710	1095715	50 %	50 %	0 %	0 %	339320432
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25592	NC_015722	TTA	2	6	1095832	1095837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320432
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25594	NC_015722	AG	3	6	1095912	1095917	50 %	0 %	50 %	0 %	339320432
25595	NC_015722	A	6	6	1095954	1095959	100 %	0 %	0 %	0 %	339320432
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25598	NC_015722	A	6	6	1096067	1096072	100 %	0 %	0 %	0 %	339320432
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25601	NC_015722	T	8	8	1096186	1096193	0 %	100 %	0 %	0 %	339320432
25602	NC_015722	ATGGC	2	10	1096223	1096232	20 %	20 %	40 %	20 %	339320432
25603	NC_015722	TAAT	2	8	1096292	1096299	50 %	50 %	0 %	0 %	339320432
25604	NC_015722	T	7	7	1096356	1096362	0 %	100 %	0 %	0 %	339320432
25605	NC_015722	ATA	2	6	1096373	1096378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320432
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25607	NC_015722	T	7	7	1096485	1096491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25608	NC_015722	GCTTGC	2	12	1096500	1096511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320433
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25613	NC_015722	GCTT	2	8	1096670	1096677	0 %	50 %	25 %	25 %	339320434
25614	NC_015722	AT	3	6	1096678	1096683	50 %	50 %	0 %	0 %	339320434
25615	NC_015722	AG	3	6	1096685	1096690	50 %	0 %	50 %	0 %	339320434
25616	NC_015722	TCA	2	6	1096713	1096718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320434
25617	NC_015722	CTC	2	6	1096746	1096751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25618	NC_015722	TAGA	2	8	1096822	1096829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25619	NC_015722	TTC	2	6	1096912	1096917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25620	NC_015722	CTAG	2	8	1096926	1096933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25621	NC_015722	TTTGT	2	10	1096982	1096991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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25864	NC_015722	AGTA	2	8	1107125	1107132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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