MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015722	GCA	2	6	281551	281556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319611
6502	NC_015722	GTA	2	6	281576	281581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6503	NC_015722	CCT	2	6	281582	281587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319611
6504	NC_015722	TAC	2	6	281704	281709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319611
6505	NC_015722	G	6	6	281747	281752	0 %	0 %	100 %	0 %	339319611
6506	NC_015722	GCT	2	6	281765	281770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319611
6507	NC_015722	CAG	2	6	281802	281807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319611
6508	NC_015722	TTG	2	6	281808	281813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319611
6509	NC_015722	AAG	2	6	281838	281843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319611
6510	NC_015722	TTG	2	6	281913	281918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319611
6511	NC_015722	GCT	2	6	281939	281944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319611
6512	NC_015722	CAA	2	6	281964	281969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319611
6513	NC_015722	T	6	6	282008	282013	0 %	100 %	0 %	0 %	339319611
6514	NC_015722	TTG	2	6	282078	282083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319611
6515	NC_015722	ATTAGA	2	12	282148	282159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339319611
6516	NC_015722	GGCT	2	8	282216	282223	0 %	25 %	50 %	25 %	339319611
6517	NC_015722	TAAA	2	8	282261	282268	75 %	25 %	0 %	0 %	339319611
6518	NC_015722	GTA	2	6	282335	282340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6519	NC_015722	GT	3	6	282379	282384	0 %	50 %	50 %	0 %	339319611
6520	NC_015722	GAT	2	6	282385	282390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6521	NC_015722	TTGC	2	8	282401	282408	0 %	50 %	25 %	25 %	339319611
6522	NC_015722	AGT	2	6	282434	282439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6523	NC_015722	CTT	2	6	282456	282461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319611
6524	NC_015722	GTT	2	6	282479	282484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319611
6525	NC_015722	ATA	2	6	282618	282623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319611
6526	NC_015722	GA	3	6	282808	282813	50 %	0 %	50 %	0 %	339319611
6527	NC_015722	AAAT	2	8	282834	282841	75 %	25 %	0 %	0 %	339319611
6528	NC_015722	TAAA	2	8	282849	282856	75 %	25 %	0 %	0 %	339319611
6529	NC_015722	AT	3	6	282870	282875	50 %	50 %	0 %	0 %	339319611
6530	NC_015722	CCA	2	6	282986	282991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339319611
6531	NC_015722	TAA	2	6	283006	283011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319611
6532	NC_015722	ACAAT	2	10	283014	283023	60 %	20 %	0 %	20 %	339319611
6533	NC_015722	GCGAG	2	10	283181	283190	20 %	0 %	60 %	20 %	339319611
6534	NC_015722	TGA	2	6	283203	283208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6535	NC_015722	AAAT	2	8	283240	283247	75 %	25 %	0 %	0 %	339319611
6536	NC_015722	ACG	2	6	283311	283316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319611
6537	NC_015722	AGA	2	6	283333	283338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319611
6538	NC_015722	TTC	2	6	283384	283389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319611
6539	NC_015722	GA	3	6	283390	283395	50 %	0 %	50 %	0 %	339319611
6540	NC_015722	GGC	2	6	283399	283404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319611
6541	NC_015722	TTGG	2	8	283475	283482	0 %	50 %	50 %	0 %	339319611
6542	NC_015722	TTG	2	6	283536	283541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319611
6543	NC_015722	TGA	2	6	283543	283548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6544	NC_015722	ATT	2	6	283577	283582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319611
6545	NC_015722	A	6	6	283589	283594	100 %	0 %	0 %	0 %	339319611
6546	NC_015722	A	6	6	283610	283615	100 %	0 %	0 %	0 %	339319611
6547	NC_015722	AAT	2	6	283619	283624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319611
6548	NC_015722	GATTT	2	10	283640	283649	20 %	60 %	20 %	0 %	339319611
6549	NC_015722	TACA	2	8	283679	283686	50 %	25 %	0 %	25 %	339319611
6550	NC_015722	TGG	2	6	283690	283695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319611
6551	NC_015722	AGT	2	6	283728	283733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319611
6552	NC_015722	ACA	2	6	283801	283806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_015722	AAGG	2	8	283807	283814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_015722	GGC	2	6	283824	283829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319612
6555	NC_015722	GCA	2	6	283861	283866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319612
6556	NC_015722	GTA	2	6	283906	283911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319612
6557	NC_015722	G	10	10	283913	283922	0 %	0 %	100 %	0 %	339319612
6558	NC_015722	T	6	6	284012	284017	0 %	100 %	0 %	0 %	339319612
6559	NC_015722	C	6	6	284032	284037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6560	NC_015722	TAA	2	6	284062	284067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_015722	GCA	2	6	284155	284160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_015722	AGC	2	6	284193	284198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_015722	G	8	8	284223	284230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_015722	GAT	2	6	284311	284316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_015722	TC	4	8	284402	284409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_015722	AG	3	6	284410	284415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015722	TTG	2	6	284448	284453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015722	CTG	2	6	284489	284494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_015722	TGC	2	6	284498	284503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_015722	AAAC	2	8	284510	284517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_015722	CAA	2	6	284531	284536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_015722	TAA	2	6	284576	284581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_015722	GA	3	6	284651	284656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_015722	GAT	2	6	284689	284694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319613
6575	NC_015722	GGT	2	6	284750	284755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319613
6576	NC_015722	TCA	2	6	284793	284798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_015722	A	6	6	284826	284831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_015722	TGA	2	6	284890	284895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_015722	CTC	2	6	284911	284916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_015722	TGA	2	6	284919	284924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_015722	ATG	2	6	284929	284934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_015722	GAGCA	2	10	284937	284946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6583	NC_015722	AGA	2	6	284976	284981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_015722	AAT	2	6	284982	284987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015722	TATC	2	8	284999	285006	25 %	50 %	0 %	25 %	339319614
6586	NC_015722	GTTT	2	8	285083	285090	0 %	75 %	25 %	0 %	339319614
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6589	NC_015722	CAT	2	6	285225	285230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319614
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6591	NC_015722	GAT	2	6	285248	285253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319614
6592	NC_015722	CTG	2	6	285288	285293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319614
6593	NC_015722	AGG	2	6	285299	285304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319614
6594	NC_015722	GTT	2	6	285329	285334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319614
6595	NC_015722	TGTC	2	8	285428	285435	0 %	50 %	25 %	25 %	339319615
6596	NC_015722	AAAT	2	8	285453	285460	75 %	25 %	0 %	0 %	339319615
6597	NC_015722	C	6	6	285482	285487	0 %	0 %	0 %	100 %	339319615
6598	NC_015722	CAA	2	6	285492	285497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319615
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6600	NC_015722	T	7	7	285519	285525	0 %	100 %	0 %	0 %	339319615
6601	NC_015722	CTA	2	6	285526	285531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319615
6602	NC_015722	TCT	2	6	285569	285574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319616
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6605	NC_015722	GTT	2	6	285781	285786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319616
6606	NC_015722	ATTT	2	8	285903	285910	25 %	75 %	0 %	0 %	339319616
6607	NC_015722	AAT	2	6	285982	285987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319616
6608	NC_015722	GAG	2	6	286031	286036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319616
6609	NC_015722	ATG	2	6	286059	286064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319616
6610	NC_015722	A	6	6	286110	286115	100 %	0 %	0 %	0 %	339319616
6611	NC_015722	CAC	2	6	286143	286148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339319616
6612	NC_015722	AGCT	2	8	286182	286189	25 %	25 %	25 %	25 %	339319616
6613	NC_015722	A	6	6	286221	286226	100 %	0 %	0 %	0 %	339319616
6614	NC_015722	GTA	2	6	286268	286273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319616
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6617	NC_015722	CAACTA	2	12	286325	286336	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	339319616
6618	NC_015722	AT	3	6	286339	286344	50 %	50 %	0 %	0 %	339319616
6619	NC_015722	CTT	2	6	286349	286354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319617
6620	NC_015722	A	7	7	286357	286363	100 %	0 %	0 %	0 %	339319617
6621	NC_015722	ATA	2	6	286376	286381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319617
6622	NC_015722	T	6	6	286388	286393	0 %	100 %	0 %	0 %	339319617
6623	NC_015722	TAA	2	6	286469	286474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319617
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