MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015688	AAT	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015688	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015688	ATAA	2	8	92	99	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015688	TA	3	6	106	111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015688	TAT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015688	GA	3	6	164	169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015688	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015688	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015688	AATT	2	8	312	319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015688	T	6	6	345	350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015688	TA	4	8	375	382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015688	TACA	2	8	401	408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015688	T	6	6	452	457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015688	ATAA	2	8	506	513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015688	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015688	CTC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015688	CATA	2	8	556	563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015688	A	7	7	573	579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015688	ATT	2	6	583	588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015688	A	7	7	602	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015688	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015688	A	7	7	669	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015688	ATT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015688	TAG	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015688	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015688	TTGG	2	8	791	798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015688	TAAT	2	8	814	821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015688	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015688	A	6	6	879	884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015688	ATA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015688	TAT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015688	ATT	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738948
34	NC_015688	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
35	NC_015688	ATTGT	2	10	1146	1155	20 %	60 %	20 %	0 %	337738949
36	NC_015688	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738949
37	NC_015688	ATC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738949
38	NC_015688	CAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738949
39	NC_015688	TA	3	6	1280	1285	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
40	NC_015688	AT	3	6	1323	1328	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
41	NC_015688	ATG	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738949
42	NC_015688	TCT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
43	NC_015688	TA	3	6	1476	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
44	NC_015688	TCAAAT	2	12	1522	1533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337738949
45	NC_015688	ATTT	2	8	1547	1554	25 %	75 %	0 %	0 %	337738949
46	NC_015688	ATTA	2	8	1572	1579	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
47	NC_015688	CATA	2	8	1598	1605	50 %	25 %	0 %	25 %	337738949
48	NC_015688	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
49	NC_015688	TCT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
50	NC_015688	ATCT	2	8	1650	1657	25 %	50 %	0 %	25 %	337738949
51	NC_015688	TA	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
52	NC_015688	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	337738949
53	NC_015688	AT	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
54	NC_015688	AT	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
55	NC_015688	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738949
56	NC_015688	T	6	6	1902	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	337738949
57	NC_015688	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
58	NC_015688	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
59	NC_015688	GTTG	2	8	2020	2027	0 %	50 %	50 %	0 %	337738949
60	NC_015688	AGTA	2	8	2043	2050	50 %	25 %	25 %	0 %	337738949
61	NC_015688	TCT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
62	NC_015688	TTC	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
63	NC_015688	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
64	NC_015688	ACTA	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015688	ACA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015688	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015688	TTAAT	2	10	2416	2425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015688	TAT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015688	AGG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015688	TAT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015688	ATG	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015688	AATT	2	8	2573	2580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015688	ATAA	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015688	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015688	A	6	6	2698	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015688	TTAA	2	8	2744	2751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015688	ATA	3	9	2769	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015688	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
79	NC_015688	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
80	NC_015688	ACC	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
81	NC_015688	CCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
82	NC_015688	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738950
83	NC_015688	T	6	6	2942	2947	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
84	NC_015688	TTTTA	2	10	2958	2967	20 %	80 %	0 %	0 %	337738950
85	NC_015688	AAG	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
86	NC_015688	GAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738950
87	NC_015688	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738950
88	NC_015688	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
89	NC_015688	T	6	6	3214	3219	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
90	NC_015688	TGC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738950
91	NC_015688	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
92	NC_015688	T	6	6	3328	3333	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
93	NC_015688	AT	3	6	3334	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	337738950
94	NC_015688	ACC	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015688	AAT	2	6	3367	3372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015688	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015688	ATG	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015688	AT	4	8	3407	3414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015688	TAT	3	9	3428	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015688	AT	3	6	3445	3450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015688	GA	3	6	3464	3469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015688	TGT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015688	TAA	3	9	3502	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015688	GTA	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015688	AT	3	6	3607	3612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015688	AAT	2	6	3655	3660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015688	TA	3	6	3662	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015688	TAA	3	9	3673	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015688	T	7	7	3699	3705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015688	TAT	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015688	TAATAT	2	12	3717	3728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015688	TTC	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015688	TAT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015688	TAG	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015688	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015688	T	8	8	3818	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015688	TA	3	6	3892	3897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015688	ATG	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015688	ATT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
120	NC_015688	A	7	7	3931	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
121	NC_015688	TTTTA	2	10	3938	3947	20 %	80 %	0 %	0 %	337738951
122	NC_015688	TATATG	2	12	3961	3972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337738951
123	NC_015688	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
124	NC_015688	TAA	3	9	4111	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
125	NC_015688	GTATA	2	10	4129	4138	40 %	40 %	20 %	0 %	337738951
126	NC_015688	ATA	2	6	4149	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
127	NC_015688	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
128	NC_015688	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
129	NC_015688	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	337738951
130	NC_015688	ATT	3	9	4290	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
131	NC_015688	ACAAA	2	10	4327	4336	80 %	0 %	0 %	20 %	337738951
132	NC_015688	ACT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
133	NC_015688	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
134	NC_015688	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
135	NC_015688	AAT	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
136	NC_015688	TAA	2	6	4453	4458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
137	NC_015688	TAC	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
138	NC_015688	A	6	6	4488	4493	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
139	NC_015688	TGA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
140	NC_015688	TGA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
141	NC_015688	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
142	NC_015688	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
143	NC_015688	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
144	NC_015688	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
145	NC_015688	AT	3	6	4713	4718	50 %	50 %	0 %	0 %	337738951
146	NC_015688	AAAT	2	8	4776	4783	75 %	25 %	0 %	0 %	337738951
147	NC_015688	AAT	3	9	4781	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
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291	NC_015688	ATA	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015688	AT	3	6	9683	9688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015688	TA	4	8	9697	9704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015688	TAATA	2	10	9706	9715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015688	A	7	7	9715	9721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015688	CCAA	2	8	9791	9798	50 %	0 %	0 %	50 %	337738956
297	NC_015688	TAA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
298	NC_015688	CTT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
299	NC_015688	AGT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738956
300	NC_015688	CTT	2	6	9948	9953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
301	NC_015688	CTT	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
302	NC_015688	TAT	3	9	10003	10011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
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305	NC_015688	TTA	2	6	10271	10276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
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307	NC_015688	TA	3	6	10308	10313	50 %	50 %	0 %	0 %	337738956
308	NC_015688	TAT	2	6	10321	10326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
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310	NC_015688	AT	3	6	10408	10413	50 %	50 %	0 %	0 %	337738956
311	NC_015688	AAC	2	6	10459	10464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_015688	TTA	2	6	10529	10534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_015688	TA	4	8	10556	10563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_015688	A	7	7	10587	10593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_015688	TAAA	2	8	10625	10632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_015688	TTA	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_015688	AT	3	6	10728	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_015688	TAC	2	6	10757	10762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
319	NC_015688	ATT	2	6	10773	10778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015688	ATTAA	2	10	10826	10835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015688	TGGC	2	8	10912	10919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
322	NC_015688	TAA	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015688	ATTT	2	8	10959	10966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015688	GAA	2	6	10985	10990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015688	AAGAT	2	10	11053	11062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
326	NC_015688	T	6	6	11072	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_015688	ATACT	2	10	11086	11095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
328	NC_015688	AAT	2	6	11109	11114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.