MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015686	ATG	2	6	140619	140624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735159
3502	NC_015686	GCA	2	6	140631	140636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735159
3503	NC_015686	TAA	2	6	140653	140658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735159
3504	NC_015686	CTG	2	6	140665	140670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735159
3505	NC_015686	CCT	2	6	140694	140699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_015686	TAT	2	6	140706	140711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015686	ATA	2	6	140801	140806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015686	TACATT	2	12	140832	140843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3509	NC_015686	T	7	7	140842	140848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015686	T	7	7	140860	140866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015686	TAC	2	6	140897	140902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015686	AGG	2	6	140921	140926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_015686	TTA	2	6	140960	140965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735160
3514	NC_015686	ATT	2	6	141081	141086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735160
3515	NC_015686	CAA	2	6	141094	141099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735160
3516	NC_015686	TAT	2	6	141127	141132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735160
3517	NC_015686	TTC	2	6	141142	141147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735160
3518	NC_015686	ATTA	2	8	141149	141156	50 %	50 %	0 %	0 %	337735160
3519	NC_015686	AACT	2	8	141241	141248	50 %	25 %	0 %	25 %	337735160
3520	NC_015686	AT	4	8	141311	141318	50 %	50 %	0 %	0 %	337735160
3521	NC_015686	A	6	6	141324	141329	100 %	0 %	0 %	0 %	337735160
3522	NC_015686	ATA	2	6	141384	141389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735160
3523	NC_015686	TA	3	6	141416	141421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015686	AT	3	6	141482	141487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015686	TAA	2	6	141488	141493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015686	AGA	2	6	141514	141519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015686	AAT	2	6	141520	141525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_015686	ATA	2	6	141581	141586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015686	ATTA	2	8	141595	141602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_015686	AGAA	2	8	141630	141637	75 %	0 %	25 %	0 %	337735161
3531	NC_015686	ATT	2	6	141642	141647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735161
3532	NC_015686	AAC	2	6	141698	141703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735161
3533	NC_015686	TATT	2	8	141768	141775	25 %	75 %	0 %	0 %	337735161
3534	NC_015686	TTATT	2	10	141910	141919	20 %	80 %	0 %	0 %	337735161
3535	NC_015686	AGA	2	6	141995	142000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735161
3536	NC_015686	AGG	2	6	142067	142072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735161
3537	NC_015686	T	6	6	142074	142079	0 %	100 %	0 %	0 %	337735161
3538	NC_015686	CCTT	2	8	142118	142125	0 %	50 %	0 %	50 %	337735161
3539	NC_015686	CTT	2	6	142146	142151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735161
3540	NC_015686	A	7	7	142153	142159	100 %	0 %	0 %	0 %	337735161
3541	NC_015686	A	7	7	142177	142183	100 %	0 %	0 %	0 %	337735161
3542	NC_015686	TTC	2	6	142280	142285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735161
3543	NC_015686	ATA	2	6	142293	142298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735161
3544	NC_015686	TTGT	2	8	142326	142333	0 %	75 %	25 %	0 %	337735161
3545	NC_015686	A	6	6	142348	142353	100 %	0 %	0 %	0 %	337735161
3546	NC_015686	ATA	2	6	142413	142418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735161
3547	NC_015686	TA	3	6	142466	142471	50 %	50 %	0 %	0 %	337735161
3548	NC_015686	TCT	2	6	142548	142553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735161
3549	NC_015686	TATT	2	8	142600	142607	25 %	75 %	0 %	0 %	337735161
3550	NC_015686	AGTA	2	8	142625	142632	50 %	25 %	25 %	0 %	337735161
3551	NC_015686	T	6	6	142639	142644	0 %	100 %	0 %	0 %	337735161
3552	NC_015686	TA	3	6	142682	142687	50 %	50 %	0 %	0 %	337735161
3553	NC_015686	TTGGCT	2	12	142699	142710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337735161
3554	NC_015686	GGA	2	6	142713	142718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735161
3555	NC_015686	AG	3	6	142768	142773	50 %	0 %	50 %	0 %	337735161
3556	NC_015686	TGC	2	6	142775	142780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735161
3557	NC_015686	T	6	6	142992	142997	0 %	100 %	0 %	0 %	337735161
3558	NC_015686	TAT	2	6	143027	143032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735161
3559	NC_015686	AAG	2	6	143061	143066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735161
3560	NC_015686	CT	3	6	143146	143151	0 %	50 %	0 %	50 %	337735162
3561	NC_015686	T	7	7	143194	143200	0 %	100 %	0 %	0 %	337735162
3562	NC_015686	GTA	2	6	143218	143223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735162
3563	NC_015686	A	6	6	143261	143266	100 %	0 %	0 %	0 %	337735162
3564	NC_015686	T	7	7	143300	143306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015686	TATTT	2	10	143319	143328	20 %	80 %	0 %	0 %	337735163
3566	NC_015686	TGA	2	6	143339	143344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735163
3567	NC_015686	CT	4	8	143354	143361	0 %	50 %	0 %	50 %	337735163
3568	NC_015686	TCT	2	6	143422	143427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735163
3569	NC_015686	ATC	2	6	143469	143474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735163
3570	NC_015686	TAA	2	6	143537	143542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735163
3571	NC_015686	ATA	2	6	143551	143556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735163
3572	NC_015686	AGT	2	6	143653	143658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735163
3573	NC_015686	CAAT	2	8	143743	143750	50 %	25 %	0 %	25 %	337735163
3574	NC_015686	TCC	2	6	143808	143813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735163
3575	NC_015686	ATTG	2	8	143815	143822	25 %	50 %	25 %	0 %	337735163
3576	NC_015686	T	6	6	143865	143870	0 %	100 %	0 %	0 %	337735163
3577	NC_015686	TCC	2	6	143887	143892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735163
3578	NC_015686	T	6	6	143911	143916	0 %	100 %	0 %	0 %	337735163
3579	NC_015686	TAC	2	6	143973	143978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735163
3580	NC_015686	A	6	6	144024	144029	100 %	0 %	0 %	0 %	337735163
3581	NC_015686	TA	3	6	144057	144062	50 %	50 %	0 %	0 %	337735163
3582	NC_015686	ATT	2	6	144109	144114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735163
3583	NC_015686	TAAAT	2	10	144136	144145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_015686	ATT	2	6	144201	144206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735164
3585	NC_015686	A	6	6	144216	144221	100 %	0 %	0 %	0 %	337735164
3586	NC_015686	TCT	2	6	144338	144343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735164
3587	NC_015686	ACC	2	6	144349	144354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735164
3588	NC_015686	ATA	2	6	144355	144360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735164
3589	NC_015686	TA	3	6	144366	144371	50 %	50 %	0 %	0 %	337735164
3590	NC_015686	TAT	2	6	144427	144432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735164
3591	NC_015686	TCA	2	6	144524	144529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735164
3592	NC_015686	TATT	2	8	144530	144537	25 %	75 %	0 %	0 %	337735164
3593	NC_015686	TTA	2	6	144548	144553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735164
3594	NC_015686	TCC	2	6	144583	144588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735164
3595	NC_015686	TCCC	2	8	144619	144626	0 %	25 %	0 %	75 %	337735164
3596	NC_015686	GTC	2	6	144634	144639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735164
3597	NC_015686	GCT	2	6	144656	144661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735164
3598	NC_015686	ATA	2	6	144725	144730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735164
3599	NC_015686	AG	3	6	144731	144736	50 %	0 %	50 %	0 %	337735164
3600	NC_015686	TTG	2	6	144802	144807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735164
3601	NC_015686	GTAA	2	8	144852	144859	50 %	25 %	25 %	0 %	337735164
3602	NC_015686	TAATTG	2	12	144884	144895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735164
3603	NC_015686	T	6	6	144945	144950	0 %	100 %	0 %	0 %	337735164
3604	NC_015686	AT	3	6	144978	144983	50 %	50 %	0 %	0 %	337735164
3605	NC_015686	TA	3	6	145036	145041	50 %	50 %	0 %	0 %	337735164
3606	NC_015686	TGA	2	6	145066	145071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735164
3607	NC_015686	TAA	2	6	145081	145086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735164
3608	NC_015686	CT	3	6	145091	145096	0 %	50 %	0 %	50 %	337735164
3609	NC_015686	TAA	2	6	145142	145147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735164
3610	NC_015686	AT	3	6	145207	145212	50 %	50 %	0 %	0 %	337735165
3611	NC_015686	ATA	2	6	145220	145225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735165
3612	NC_015686	TA	4	8	145260	145267	50 %	50 %	0 %	0 %	337735165
3613	NC_015686	A	6	6	145297	145302	100 %	0 %	0 %	0 %	337735165
3614	NC_015686	CTT	2	6	145345	145350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735165
3615	NC_015686	A	7	7	145414	145420	100 %	0 %	0 %	0 %	337735165
3616	NC_015686	AT	3	6	145455	145460	50 %	50 %	0 %	0 %	337735165
3617	NC_015686	AGG	2	6	145485	145490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735165
3618	NC_015686	ACT	2	6	145498	145503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735165
3619	NC_015686	GCATTA	2	12	145526	145537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337735165
3620	NC_015686	ATT	2	6	145552	145557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735165
3621	NC_015686	AAC	2	6	145635	145640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735165
3622	NC_015686	CCG	2	6	145658	145663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337735165
3623	NC_015686	TCT	2	6	145678	145683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735165
3624	NC_015686	ATT	2	6	145687	145692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735165
3625	NC_015686	T	6	6	145703	145708	0 %	100 %	0 %	0 %	337735165
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3627	NC_015686	T	7	7	145835	145841	0 %	100 %	0 %	0 %	337735165
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