MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015686	TAT	2	6	119357	119362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015686	TA	4	8	119389	119396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015686	A	6	6	119408	119413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015686	TA	3	6	119437	119442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015686	AAT	2	6	119570	119575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735144
3006	NC_015686	TAT	2	6	119771	119776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735144
3007	NC_015686	CTT	2	6	119826	119831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735144
3008	NC_015686	TA	3	6	119856	119861	50 %	50 %	0 %	0 %	337735144
3009	NC_015686	GAA	2	6	119941	119946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735144
3010	NC_015686	CTTG	2	8	119980	119987	0 %	50 %	25 %	25 %	337735144
3011	NC_015686	CCACTG	2	12	120075	120086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337735144
3012	NC_015686	TCA	3	9	120115	120123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3013	NC_015686	CTG	2	6	120149	120154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735144
3014	NC_015686	TAT	2	6	120161	120166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735144
3015	NC_015686	AT	4	8	120165	120172	50 %	50 %	0 %	0 %	337735144
3016	NC_015686	CAT	2	6	120299	120304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3017	NC_015686	CA	3	6	120309	120314	50 %	0 %	0 %	50 %	337735144
3018	NC_015686	TGA	2	6	120319	120324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735144
3019	NC_015686	CAT	2	6	120332	120337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3020	NC_015686	TA	3	6	120438	120443	50 %	50 %	0 %	0 %	337735144
3021	NC_015686	CAT	2	6	120476	120481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3022	NC_015686	ACC	2	6	120489	120494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735144
3023	NC_015686	TCC	2	6	120516	120521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735144
3024	NC_015686	AGTT	2	8	120546	120553	25 %	50 %	25 %	0 %	337735144
3025	NC_015686	TTACA	2	10	120557	120566	40 %	40 %	0 %	20 %	337735144
3026	NC_015686	AAAGA	2	10	120603	120612	80 %	0 %	20 %	0 %	337735144
3027	NC_015686	CAT	2	6	120617	120622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3028	NC_015686	ACC	2	6	120660	120665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735144
3029	NC_015686	TACA	2	8	120689	120696	50 %	25 %	0 %	25 %	337735144
3030	NC_015686	AG	3	6	120715	120720	50 %	0 %	50 %	0 %	337735144
3031	NC_015686	CTA	2	6	120800	120805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735144
3032	NC_015686	AGGC	2	8	120915	120922	25 %	0 %	50 %	25 %	337735144
3033	NC_015686	ATA	2	6	120954	120959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735144
3034	NC_015686	TAA	2	6	120974	120979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735144
3035	NC_015686	CATA	2	8	121001	121008	50 %	25 %	0 %	25 %	337735144
3036	NC_015686	TGC	2	6	121071	121076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735144
3037	NC_015686	CATA	2	8	121083	121090	50 %	25 %	0 %	25 %	337735144
3038	NC_015686	T	8	8	121133	121140	0 %	100 %	0 %	0 %	337735144
3039	NC_015686	ATA	2	6	121144	121149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735144
3040	NC_015686	ACTC	2	8	121154	121161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_015686	CCA	2	6	121233	121238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735145
3042	NC_015686	TAAA	2	8	121247	121254	75 %	25 %	0 %	0 %	337735145
3043	NC_015686	TCC	2	6	121263	121268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735145
3044	NC_015686	TTACA	2	10	121310	121319	40 %	40 %	0 %	20 %	337735145
3045	NC_015686	ACC	2	6	121344	121349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735145
3046	NC_015686	TCC	2	6	121416	121421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735145
3047	NC_015686	CTTTTA	2	12	121481	121492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337735145
3048	NC_015686	TACA	2	8	121514	121521	50 %	25 %	0 %	25 %	337735145
3049	NC_015686	GTC	2	6	121633	121638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735145
3050	NC_015686	AC	3	6	121689	121694	50 %	0 %	0 %	50 %	337735145
3051	NC_015686	GAT	2	6	121778	121783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735145
3052	NC_015686	AT	3	6	121867	121872	50 %	50 %	0 %	0 %	337735145
3053	NC_015686	CTT	2	6	121937	121942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735145
3054	NC_015686	CTA	2	6	121957	121962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735145
3055	NC_015686	CTG	2	6	121988	121993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735145
3056	NC_015686	ATA	2	6	122055	122060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735145
3057	NC_015686	ATAA	2	8	122081	122088	75 %	25 %	0 %	0 %	337735145
3058	NC_015686	CAT	2	6	122096	122101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735145
3059	NC_015686	CAA	2	6	122168	122173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735145
3060	NC_015686	CCA	2	6	122218	122223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735145
3061	NC_015686	T	6	6	122225	122230	0 %	100 %	0 %	0 %	337735145
3062	NC_015686	ATA	2	6	122244	122249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735145
3063	NC_015686	TCA	2	6	122413	122418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735145
3064	NC_015686	TA	3	6	122447	122452	50 %	50 %	0 %	0 %	337735145
3065	NC_015686	AGT	2	6	122469	122474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735145
3066	NC_015686	ACT	2	6	122488	122493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735145
3067	NC_015686	TA	3	6	122553	122558	50 %	50 %	0 %	0 %	337735145
3068	NC_015686	T	6	6	122565	122570	0 %	100 %	0 %	0 %	337735145
3069	NC_015686	CCT	2	6	122581	122586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_015686	A	7	7	122623	122629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015686	AT	3	6	122775	122780	50 %	50 %	0 %	0 %	337735146
3072	NC_015686	TTG	2	6	122834	122839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735146
3073	NC_015686	CAT	2	6	122860	122865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735146
3074	NC_015686	GCT	2	6	123042	123047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735146
3075	NC_015686	TAT	2	6	123062	123067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735146
3076	NC_015686	ATTA	2	8	123077	123084	50 %	50 %	0 %	0 %	337735146
3077	NC_015686	CTG	2	6	123116	123121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735146
3078	NC_015686	AAG	2	6	123181	123186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735146
3079	NC_015686	ACA	2	6	123210	123215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735146
3080	NC_015686	CAA	2	6	123217	123222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735146
3081	NC_015686	GCT	2	6	123316	123321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735146
3082	NC_015686	AGT	2	6	123472	123477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735146
3083	NC_015686	ATT	2	6	123485	123490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735146
3084	NC_015686	TG	3	6	123529	123534	0 %	50 %	50 %	0 %	337735146
3085	NC_015686	T	7	7	123649	123655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015686	GCC	2	6	123691	123696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_015686	TTGT	2	8	123745	123752	0 %	75 %	25 %	0 %	337735147
3088	NC_015686	CAT	2	6	123926	123931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735147
3089	NC_015686	TA	3	6	123954	123959	50 %	50 %	0 %	0 %	337735147
3090	NC_015686	TAT	2	6	124004	124009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735147
3091	NC_015686	ACCAT	2	10	124050	124059	40 %	20 %	0 %	40 %	337735147
3092	NC_015686	ACC	2	6	124067	124072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735147
3093	NC_015686	CCA	3	9	124134	124142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735147
3094	NC_015686	TCC	2	6	124329	124334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735147
3095	NC_015686	ATT	3	9	124509	124517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735147
3096	NC_015686	GTTC	2	8	124535	124542	0 %	50 %	25 %	25 %	337735147
3097	NC_015686	T	7	7	124582	124588	0 %	100 %	0 %	0 %	337735147
3098	NC_015686	GATT	2	8	124589	124596	25 %	50 %	25 %	0 %	337735147
3099	NC_015686	TCAT	2	8	124621	124628	25 %	50 %	0 %	25 %	337735147
3100	NC_015686	AT	3	6	124658	124663	50 %	50 %	0 %	0 %	337735147
3101	NC_015686	GGT	2	6	124689	124694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735147
3102	NC_015686	AGC	2	6	124722	124727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735147
3103	NC_015686	GTG	2	6	124790	124795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735147
3104	NC_015686	CAA	2	6	124796	124801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735147
3105	NC_015686	AGT	2	6	124902	124907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735147
3106	NC_015686	TGC	2	6	124908	124913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735147
3107	NC_015686	GTT	2	6	124954	124959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735147
3108	NC_015686	TAC	2	6	124970	124975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735147
3109	NC_015686	TAA	2	6	124976	124981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735147
3110	NC_015686	T	7	7	124985	124991	0 %	100 %	0 %	0 %	337735147
3111	NC_015686	CCTTCT	2	12	125002	125013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_015686	AAT	2	6	125028	125033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015686	T	7	7	125063	125069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015686	GTT	2	6	125088	125093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735148
3115	NC_015686	TCC	2	6	125127	125132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735148
3116	NC_015686	ACAT	2	8	125145	125152	50 %	25 %	0 %	25 %	337735148
3117	NC_015686	CAG	2	6	125162	125167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735148
3118	NC_015686	ATC	2	6	125181	125186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735148
3119	NC_015686	TAC	2	6	125204	125209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735148
3120	NC_015686	AGA	2	6	125241	125246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735148
3121	NC_015686	T	6	6	125359	125364	0 %	100 %	0 %	0 %	337735148
3122	NC_015686	CCTGAA	2	12	125419	125430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337735148
3123	NC_015686	TAT	2	6	125462	125467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735148
3124	NC_015686	GTA	2	6	125508	125513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735148
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3230	NC_015686	T	7	7	130918	130924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_015686	TTA	2	6	130928	130933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_015686	TA	3	6	130932	130937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_015686	TA	4	8	130951	130958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_015686	ATT	2	6	131052	131057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_015686	AGG	2	6	131073	131078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_015686	ATTA	2	8	131093	131100	50 %	50 %	0 %	0 %	337735151
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3240	NC_015686	AGTA	2	8	131252	131259	50 %	25 %	25 %	0 %	337735151
3241	NC_015686	ATT	2	6	131289	131294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735151
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3244	NC_015686	T	8	8	131398	131405	0 %	100 %	0 %	0 %	337735151
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