MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015470	GAA	2	6	190210	190215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
4002	NC_015470	TC	3	6	190220	190225	0 %	50 %	0 %	50 %	332287133
4003	NC_015470	CAG	2	6	190240	190245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287133
4004	NC_015470	GCCTTG	2	12	190271	190282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287133
4005	NC_015470	TTA	2	6	190308	190313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287133
4006	NC_015470	CGG	2	6	190320	190325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287133
4007	NC_015470	TCT	2	6	190356	190361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4008	NC_015470	CAC	2	6	190394	190399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287133
4009	NC_015470	AAG	2	6	190534	190539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
4010	NC_015470	CTT	2	6	190591	190596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4011	NC_015470	TTAT	2	8	190675	190682	25 %	75 %	0 %	0 %	332287133
4012	NC_015470	TTC	3	9	190690	190698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4013	NC_015470	ATG	2	6	190738	190743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
4014	NC_015470	GAT	2	6	190797	190802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
4015	NC_015470	GT	3	6	190827	190832	0 %	50 %	50 %	0 %	332287133
4016	NC_015470	GGT	2	6	190882	190887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287133
4017	NC_015470	GCA	2	6	190943	190948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287133
4018	NC_015470	TTC	2	6	191013	191018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4019	NC_015470	GATAA	2	10	191020	191029	60 %	20 %	20 %	0 %	332287133
4020	NC_015470	ATTT	2	8	191032	191039	25 %	75 %	0 %	0 %	332287133
4021	NC_015470	CTAT	2	8	191107	191114	25 %	50 %	0 %	25 %	332287133
4022	NC_015470	TGA	2	6	191117	191122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
4023	NC_015470	TCT	2	6	191152	191157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4024	NC_015470	TAA	2	6	191211	191216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287133
4025	NC_015470	ACA	2	6	191223	191228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287133
4026	NC_015470	TTA	2	6	191254	191259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287133
4027	NC_015470	TCT	2	6	191334	191339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4028	NC_015470	CTT	3	9	191370	191378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4029	NC_015470	A	6	6	191381	191386	100 %	0 %	0 %	0 %	332287133
4030	NC_015470	ATA	2	6	191444	191449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287133
4031	NC_015470	TCA	2	6	191453	191458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
4032	NC_015470	ATT	2	6	191493	191498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287133
4033	NC_015470	TTAA	2	8	191515	191522	50 %	50 %	0 %	0 %	332287133
4034	NC_015470	A	6	6	191534	191539	100 %	0 %	0 %	0 %	332287133
4035	NC_015470	GAA	2	6	191546	191551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
4036	NC_015470	CAA	2	6	191567	191572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287133
4037	NC_015470	ATT	3	9	191592	191600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287133
4038	NC_015470	TGG	2	6	191604	191609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287133
4039	NC_015470	TCA	2	6	191633	191638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
4040	NC_015470	ATC	2	6	191667	191672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
4041	NC_015470	CTT	2	6	191692	191697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
4042	NC_015470	GAAA	2	8	191719	191726	75 %	0 %	25 %	0 %	332287133
4043	NC_015470	ACA	2	6	191727	191732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287133
4044	NC_015470	TTG	2	6	191747	191752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015470	AGAT	2	8	191790	191797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015470	ACG	2	6	191813	191818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015470	TTC	2	6	191845	191850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287134
4048	NC_015470	AT	3	6	191870	191875	50 %	50 %	0 %	0 %	332287134
4049	NC_015470	TCT	2	6	191900	191905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287134
4050	NC_015470	TGC	2	6	191935	191940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287134
4051	NC_015470	GTG	2	6	192081	192086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287134
4052	NC_015470	CTT	2	6	192140	192145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287134
4053	NC_015470	T	6	6	192187	192192	0 %	100 %	0 %	0 %	332287134
4054	NC_015470	GAAG	2	8	192244	192251	50 %	0 %	50 %	0 %	332287134
4055	NC_015470	AAG	2	6	192300	192305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287134
4056	NC_015470	ATC	2	6	192348	192353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287134
4057	NC_015470	GTG	2	6	192468	192473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287134
4058	NC_015470	TTA	2	6	192527	192532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287134
4059	NC_015470	GA	3	6	192579	192584	50 %	0 %	50 %	0 %	332287134
4060	NC_015470	T	6	6	192657	192662	0 %	100 %	0 %	0 %	332287134
4061	NC_015470	TTG	2	6	192767	192772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287134
4062	NC_015470	TGA	2	6	192796	192801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287134
4063	NC_015470	A	6	6	192840	192845	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
4064	NC_015470	ATG	2	6	192864	192869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287134
4065	NC_015470	A	6	6	192873	192878	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
4066	NC_015470	A	6	6	192883	192888	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
4067	NC_015470	AGC	2	6	192910	192915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287134
4068	NC_015470	TAT	2	6	192958	192963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287134
4069	NC_015470	TAA	2	6	192988	192993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287134
4070	NC_015470	ATT	2	6	193004	193009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287134
4071	NC_015470	AGGG	2	8	193017	193024	25 %	0 %	75 %	0 %	332287134
4072	NC_015470	GGA	2	6	193109	193114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287134
4073	NC_015470	GCA	2	6	193124	193129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287134
4074	NC_015470	TTCA	2	8	193175	193182	25 %	50 %	0 %	25 %	332287134
4075	NC_015470	A	6	6	193201	193206	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
4076	NC_015470	CCCTT	2	10	193224	193233	0 %	40 %	0 %	60 %	332287134
4077	NC_015470	TGA	2	6	193252	193257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287134
4078	NC_015470	CT	3	6	193274	193279	0 %	50 %	0 %	50 %	332287134
4079	NC_015470	TTA	2	6	193364	193369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287134
4080	NC_015470	ATC	2	6	193377	193382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287134
4081	NC_015470	GAAA	2	8	193406	193413	75 %	0 %	25 %	0 %	332287134
4082	NC_015470	CAC	2	6	193497	193502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287134
4083	NC_015470	GGA	2	6	193523	193528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287134
4084	NC_015470	TCAT	2	8	193530	193537	25 %	50 %	0 %	25 %	332287134
4085	NC_015470	TTC	2	6	193560	193565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287134
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4087	NC_015470	T	6	6	193650	193655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015470	CT	3	6	193715	193720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_015470	GTTT	2	8	193723	193730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015470	TTA	2	6	193793	193798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015470	GTT	2	6	193875	193880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015470	TTTTA	2	10	193925	193934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015470	TTC	2	6	193941	193946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_015470	T	8	8	194008	194015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015470	TTC	2	6	194131	194136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287135
4096	NC_015470	AGTTA	2	10	194215	194224	40 %	40 %	20 %	0 %	332287135
4097	NC_015470	TTATT	2	10	194235	194244	20 %	80 %	0 %	0 %	332287135
4098	NC_015470	CTG	2	6	194301	194306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287135
4099	NC_015470	TTA	2	6	194348	194353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287135
4100	NC_015470	AGG	2	6	194355	194360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287135
4101	NC_015470	ATG	2	6	194391	194396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287135
4102	NC_015470	ATG	2	6	194433	194438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287135
4103	NC_015470	ATTT	2	8	194439	194446	25 %	75 %	0 %	0 %	332287135
4104	NC_015470	TGA	3	9	194551	194559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287135
4105	NC_015470	ACAATC	2	12	194581	194592	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332287135
4106	NC_015470	TAG	2	6	194629	194634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287135
4107	NC_015470	CAAAGG	2	12	194712	194723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332287135
4108	NC_015470	ATT	2	6	194726	194731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287135
4109	NC_015470	GA	3	6	194797	194802	50 %	0 %	50 %	0 %	332287135
4110	NC_015470	TGT	2	6	194818	194823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287135
4111	NC_015470	TCA	2	6	194849	194854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287135
4112	NC_015470	GTT	2	6	194899	194904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287135
4113	NC_015470	ATT	2	6	194956	194961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287135
4114	NC_015470	AC	3	6	194963	194968	50 %	0 %	0 %	50 %	332287135
4115	NC_015470	AAT	2	6	195017	195022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287135
4116	NC_015470	TTC	2	6	195060	195065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287135
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4118	NC_015470	CAT	2	6	195101	195106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287135
4119	NC_015470	ACA	2	6	195133	195138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287135
4120	NC_015470	TTG	2	6	195141	195146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287135
4121	NC_015470	ACA	2	6	195192	195197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287135
4122	NC_015470	TGT	2	6	195282	195287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_015470	AGT	2	6	195336	195341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_015470	AGA	2	6	200347	200352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287139
4254	NC_015470	CAA	2	6	200370	200375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287139
4255	NC_015470	GCT	2	6	200384	200389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287139
4256	NC_015470	CTG	2	6	200401	200406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287139
4257	NC_015470	GA	3	6	200445	200450	50 %	0 %	50 %	0 %	332287139
4258	NC_015470	GTT	2	6	200507	200512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287139
4259	NC_015470	AACT	2	8	200518	200525	50 %	25 %	0 %	25 %	332287139
4260	NC_015470	CTT	2	6	200544	200549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287139
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4263	NC_015470	AGA	2	6	200677	200682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287139
4264	NC_015470	TCT	2	6	200732	200737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287139
4265	NC_015470	CAA	2	6	200745	200750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287139
4266	NC_015470	AGT	2	6	200773	200778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287139
4267	NC_015470	GAG	2	6	200862	200867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287139
4268	NC_015470	TTCT	2	8	200874	200881	0 %	75 %	0 %	25 %	332287139
4269	NC_015470	AC	3	6	200919	200924	50 %	0 %	0 %	50 %	332287139
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4271	NC_015470	T	6	6	201003	201008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_015470	CCT	2	6	201043	201048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4273	NC_015470	ATTAA	2	10	201064	201073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_015470	TAAT	2	8	201080	201087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4275	NC_015470	ATC	2	6	201277	201282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_015470	GTA	2	6	201337	201342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287140
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4279	NC_015470	TTGGT	2	10	201440	201449	0 %	60 %	40 %	0 %	332287140
4280	NC_015470	GT	3	6	201469	201474	0 %	50 %	50 %	0 %	332287140
4281	NC_015470	CAA	2	6	201527	201532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287140
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4283	NC_015470	CAT	2	6	201617	201622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287140
4284	NC_015470	AGG	2	6	201665	201670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_015470	CCT	2	6	201678	201683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287141
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4290	NC_015470	TCT	2	6	201894	201899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287141
4291	NC_015470	GTA	2	6	201917	201922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287141
4292	NC_015470	TCAT	2	8	201969	201976	25 %	50 %	0 %	25 %	332287141
4293	NC_015470	A	6	6	202133	202138	100 %	0 %	0 %	0 %	332287141
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4328	NC_015470	GAA	2	6	203707	203712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4329	NC_015470	TTCT	2	8	203750	203757	0 %	75 %	0 %	25 %	332287142
4330	NC_015470	A	6	6	203782	203787	100 %	0 %	0 %	0 %	332287142
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4332	NC_015470	AAT	2	6	203815	203820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287142
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4339	NC_015470	TTG	2	6	204114	204119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4342	NC_015470	T	6	6	204171	204176	0 %	100 %	0 %	0 %	332287143
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4358	NC_015470	AGA	2	6	204822	204827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287143
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4361	NC_015470	TAATG	2	10	205032	205041	40 %	40 %	20 %	0 %	332287143
4362	NC_015470	TCT	2	6	205089	205094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4363	NC_015470	AAT	2	6	205156	205161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_015470	T	7	7	205161	205167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_015470	GAT	2	6	205176	205181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_015470	TCT	2	6	205195	205200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_015470	CAAA	2	8	205216	205223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4368	NC_015470	TAG	2	6	205253	205258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_015470	AGAA	2	8	205333	205340	75 %	0 %	25 %	0 %	332287144
4370	NC_015470	ACG	2	6	205368	205373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287144
4371	NC_015470	AAAGAC	2	12	205392	205403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332287144
4372	NC_015470	AAG	2	6	205463	205468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287144
4373	NC_015470	TGG	2	6	205482	205487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287144
4374	NC_015470	GCT	2	6	205594	205599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287144
4375	NC_015470	TTTA	2	8	205662	205669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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