MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015470	CAA	2	6	166100	166105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287113
3502	NC_015470	ATG	2	6	166122	166127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287113
3503	NC_015470	AAC	2	6	166147	166152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287113
3504	NC_015470	TGT	2	6	166231	166236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287113
3505	NC_015470	CGAG	2	8	166240	166247	25 %	0 %	50 %	25 %	332287113
3506	NC_015470	GAA	2	6	166259	166264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287113
3507	NC_015470	GAT	2	6	166327	166332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287113
3508	NC_015470	GTG	2	6	166383	166388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287113
3509	NC_015470	GAG	2	6	166403	166408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287113
3510	NC_015470	AAATG	2	10	166438	166447	60 %	20 %	20 %	0 %	332287113
3511	NC_015470	CTT	2	6	166598	166603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287113
3512	NC_015470	AAGAGA	2	12	166638	166649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287113
3513	NC_015470	GAA	2	6	166712	166717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287113
3514	NC_015470	AAT	2	6	166739	166744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287113
3515	NC_015470	TCT	2	6	166756	166761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287113
3516	NC_015470	AGC	2	6	166851	166856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287113
3517	NC_015470	G	6	6	166936	166941	0 %	0 %	100 %	0 %	332287113
3518	NC_015470	TGA	2	6	167008	167013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287113
3519	NC_015470	AAC	2	6	167034	167039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287113
3520	NC_015470	TTGC	2	8	167041	167048	0 %	50 %	25 %	25 %	332287113
3521	NC_015470	TTC	2	6	167057	167062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287113
3522	NC_015470	AC	3	6	167277	167282	50 %	0 %	0 %	50 %	332287113
3523	NC_015470	TC	3	6	167301	167306	0 %	50 %	0 %	50 %	332287113
3524	NC_015470	GGA	2	6	167333	167338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287113
3525	NC_015470	GAA	2	6	167360	167365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287113
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3529	NC_015470	AAG	2	6	167548	167553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287113
3530	NC_015470	TCT	2	6	167618	167623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287113
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3532	NC_015470	TGT	2	6	167828	167833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287114
3533	NC_015470	A	6	6	167835	167840	100 %	0 %	0 %	0 %	332287114
3534	NC_015470	GT	3	6	167910	167915	0 %	50 %	50 %	0 %	332287114
3535	NC_015470	GCA	2	6	167949	167954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287114
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3537	NC_015470	TAC	2	6	167972	167977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287114
3538	NC_015470	ATTC	2	8	167981	167988	25 %	50 %	0 %	25 %	332287114
3539	NC_015470	ATA	2	6	168061	168066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287114
3540	NC_015470	GAA	2	6	168078	168083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287114
3541	NC_015470	A	8	8	168082	168089	100 %	0 %	0 %	0 %	332287114
3542	NC_015470	TGA	2	6	168204	168209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287114
3543	NC_015470	GGGGA	2	10	168213	168222	20 %	0 %	80 %	0 %	332287114
3544	NC_015470	TTC	2	6	168224	168229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287114
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3547	NC_015470	T	6	6	168444	168449	0 %	100 %	0 %	0 %	332287114
3548	NC_015470	GAAG	2	8	168477	168484	50 %	0 %	50 %	0 %	332287114
3549	NC_015470	AAAG	2	8	168515	168522	75 %	0 %	25 %	0 %	332287114
3550	NC_015470	A	6	6	168531	168536	100 %	0 %	0 %	0 %	332287114
3551	NC_015470	TG	3	6	168690	168695	0 %	50 %	50 %	0 %	332287114
3552	NC_015470	GAA	2	6	168729	168734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015470	GTT	2	6	168749	168754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287115
3554	NC_015470	T	7	7	168774	168780	0 %	100 %	0 %	0 %	332287115
3555	NC_015470	TGA	2	6	168821	168826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287115
3556	NC_015470	AGA	2	6	168931	168936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287115
3557	NC_015470	T	7	7	168938	168944	0 %	100 %	0 %	0 %	332287115
3558	NC_015470	CTG	2	6	168945	168950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287115
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3560	NC_015470	T	9	9	169030	169038	0 %	100 %	0 %	0 %	332287115
3561	NC_015470	A	8	8	169101	169108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015470	TTA	2	6	169121	169126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015470	A	6	6	169135	169140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015470	A	6	6	169146	169151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015470	TTTTC	2	10	169262	169271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_015470	TAA	2	6	169272	169277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015470	TTG	2	6	169329	169334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287116
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3577	NC_015470	AG	3	6	169731	169736	50 %	0 %	50 %	0 %	332287116
3578	NC_015470	CTGTT	2	10	169741	169750	0 %	60 %	20 %	20 %	332287116
3579	NC_015470	AATGA	2	10	169776	169785	60 %	20 %	20 %	0 %	332287116
3580	NC_015470	TTG	2	6	169804	169809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287116
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3582	NC_015470	ATA	3	9	169959	169967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_015470	TAA	2	6	169983	169988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_015470	GTT	2	6	170020	170025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015470	TAGT	2	8	170085	170092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_015470	TAC	2	6	170195	170200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3589	NC_015470	T	6	6	170335	170340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015470	TTCC	2	8	170397	170404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_015470	AGA	2	6	170419	170424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_015470	T	6	6	170425	170430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015470	AGT	2	6	170464	170469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_015470	GGT	2	6	170629	170634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015470	TAT	2	6	170707	170712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015470	TAT	2	6	170759	170764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287117
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3605	NC_015470	AAG	2	6	171093	171098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287117
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3610	NC_015470	T	8	8	171327	171334	0 %	100 %	0 %	0 %	332287117
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3614	NC_015470	TCT	2	6	171592	171597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287118
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3626	NC_015470	AGA	2	6	172305	172310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287119
3627	NC_015470	GA	4	8	172473	172480	50 %	0 %	50 %	0 %	332287119
3628	NC_015470	CAGG	2	8	172488	172495	25 %	0 %	50 %	25 %	332287119
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3631	NC_015470	T	6	6	172975	172980	0 %	100 %	0 %	0 %	332287119
3632	NC_015470	TAAAGA	2	12	173143	173154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332287119
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3634	NC_015470	AG	3	6	173219	173224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_015470	ATTTT	2	10	173235	173244	20 %	80 %	0 %	0 %	332287120
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3652	NC_015470	AGT	2	6	173774	173779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3653	NC_015470	AGA	2	6	173888	173893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_015470	AGA	2	6	173906	173911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3655	NC_015470	CGCAT	2	10	173952	173961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3667	NC_015470	A	6	6	174717	174722	100 %	0 %	0 %	0 %	332287121
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4000	NC_015470	AGCG	2	8	190113	190120	25 %	0 %	50 %	25 %	332287133

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