MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015470	AAC	2	6	660544	660549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287518
14002	NC_015470	ATCAG	2	10	660607	660616	40 %	20 %	20 %	20 %	332287518
14003	NC_015470	TGA	2	6	660669	660674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287518
14004	NC_015470	CTC	2	6	660685	660690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287518
14005	NC_015470	CT	3	6	660797	660802	0 %	50 %	0 %	50 %	332287518
14006	NC_015470	CTT	2	6	660876	660881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287518
14007	NC_015470	CTT	2	6	660914	660919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287518
14008	NC_015470	TTC	2	6	660923	660928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287518
14009	NC_015470	CAGA	2	8	660944	660951	50 %	0 %	25 %	25 %	332287518
14010	NC_015470	CTT	2	6	660957	660962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287518
14011	NC_015470	TCA	2	6	660976	660981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_015470	ACA	2	6	661035	661040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_015470	ATT	2	6	661061	661066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_015470	TAT	2	6	661074	661079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_015470	AAT	2	6	661083	661088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_015470	GCT	2	6	661105	661110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_015470	GTC	2	6	661236	661241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_015470	A	6	6	661253	661258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_015470	AG	3	6	661270	661275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_015470	TA	3	6	661326	661331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_015470	AAATAC	2	12	661337	661348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14022	NC_015470	ATA	2	6	661388	661393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287519
14023	NC_015470	TGA	2	6	661497	661502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287519
14024	NC_015470	ATT	2	6	661531	661536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287519
14025	NC_015470	GT	3	6	661595	661600	0 %	50 %	50 %	0 %	332287519
14026	NC_015470	AAT	2	6	661659	661664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287519
14027	NC_015470	TCA	2	6	661733	661738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287519
14028	NC_015470	AGA	2	6	661762	661767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287519
14029	NC_015470	TGC	2	6	661776	661781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287519
14030	NC_015470	AACTG	2	10	661811	661820	40 %	20 %	20 %	20 %	332287519
14031	NC_015470	A	6	6	661837	661842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_015470	AAT	2	6	661854	661859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_015470	TTA	2	6	661877	661882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_015470	TAA	2	6	661899	661904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_015470	CAATCT	2	12	661923	661934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_015470	TAG	2	6	661937	661942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_015470	CATT	2	8	661952	661959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14038	NC_015470	TAA	2	6	661990	661995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287520
14039	NC_015470	TAA	2	6	662002	662007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287520
14040	NC_015470	CAA	2	6	662025	662030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287520
14041	NC_015470	TTCCG	2	10	662048	662057	0 %	40 %	20 %	40 %	332287520
14042	NC_015470	A	6	6	662156	662161	100 %	0 %	0 %	0 %	332287520
14043	NC_015470	GAT	2	6	662272	662277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287520
14044	NC_015470	TTAGGG	2	12	662285	662296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332287520
14045	NC_015470	TTC	2	6	662301	662306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287520
14046	NC_015470	AT	3	6	662337	662342	50 %	50 %	0 %	0 %	332287520
14047	NC_015470	GAA	2	6	662347	662352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287520
14048	NC_015470	CTG	3	9	662362	662370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287520
14049	NC_015470	CAA	2	6	662409	662414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287520
14050	NC_015470	GAT	2	6	662429	662434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287520
14051	NC_015470	CCA	2	6	662463	662468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287520
14052	NC_015470	ATT	2	6	662599	662604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287520
14053	NC_015470	GAA	2	6	662636	662641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287520
14054	NC_015470	TC	3	6	662658	662663	0 %	50 %	0 %	50 %	332287520
14055	NC_015470	TAG	2	6	662676	662681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287520
14056	NC_015470	GAGTA	2	10	662707	662716	40 %	20 %	40 %	0 %	332287520
14057	NC_015470	ACT	2	6	662720	662725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287520
14058	NC_015470	CTT	2	6	662739	662744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287520
14059	NC_015470	TAT	2	6	662845	662850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_015470	TGA	2	6	662853	662858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_015470	AAGAG	2	10	662871	662880	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_015470	TAA	2	6	662985	662990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287521
14063	NC_015470	AAAT	2	8	662997	663004	75 %	25 %	0 %	0 %	332287521
14064	NC_015470	GAT	2	6	663085	663090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287521
14065	NC_015470	ATA	2	6	663196	663201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_015470	AC	3	6	663209	663214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_015470	TAA	2	6	663226	663231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_015470	GTA	2	6	663238	663243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_015470	CAA	2	6	663266	663271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_015470	TCC	2	6	663324	663329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287522
14071	NC_015470	GATAA	2	10	663392	663401	60 %	20 %	20 %	0 %	332287522
14072	NC_015470	CAA	2	6	663406	663411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287522
14073	NC_015470	T	8	8	663465	663472	0 %	100 %	0 %	0 %	332287522
14074	NC_015470	TCAG	2	8	663558	663565	25 %	25 %	25 %	25 %	332287522
14075	NC_015470	GAG	2	6	663580	663585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287522
14076	NC_015470	CTC	2	6	663602	663607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287522
14077	NC_015470	ATG	2	6	663674	663679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287522
14078	NC_015470	AC	3	6	663682	663687	50 %	0 %	0 %	50 %	332287522
14079	NC_015470	CTT	2	6	663773	663778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287522
14080	NC_015470	T	6	6	663777	663782	0 %	100 %	0 %	0 %	332287522
14081	NC_015470	A	6	6	663969	663974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_015470	TCTTA	2	10	664019	664028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14083	NC_015470	CA	3	6	664036	664041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14084	NC_015470	AAATA	2	10	664050	664059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_015470	A	7	7	664059	664065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_015470	T	6	6	664082	664087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_015470	AAG	2	6	664093	664098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_015470	CT	4	8	664104	664111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14089	NC_015470	A	6	6	664153	664158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_015470	TCATTC	2	12	664172	664183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_015470	AGAA	2	8	664189	664196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_015470	T	7	7	664266	664272	0 %	100 %	0 %	0 %	332287523
14093	NC_015470	ATT	2	6	664302	664307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287523
14094	NC_015470	GCAT	2	8	664396	664403	25 %	25 %	25 %	25 %	332287523
14095	NC_015470	TTCT	2	8	664404	664411	0 %	75 %	0 %	25 %	332287523
14096	NC_015470	TTTGG	2	10	664427	664436	0 %	60 %	40 %	0 %	332287523
14097	NC_015470	TC	3	6	664457	664462	0 %	50 %	0 %	50 %	332287523
14098	NC_015470	TGT	2	6	664536	664541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287523
14099	NC_015470	TCC	2	6	664548	664553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287523
14100	NC_015470	TCT	2	6	664615	664620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287523
14101	NC_015470	GGA	2	6	664621	664626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287523
14102	NC_015470	GCT	2	6	664633	664638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287523
14103	NC_015470	TTA	2	6	664654	664659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287523
14104	NC_015470	AGT	2	6	664711	664716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287523
14105	NC_015470	CTT	2	6	664728	664733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287523
14106	NC_015470	ATG	3	9	664744	664752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287523
14107	NC_015470	TTG	2	6	664769	664774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287523
14108	NC_015470	CT	4	8	664777	664784	0 %	50 %	0 %	50 %	332287523
14109	NC_015470	GGA	2	6	664789	664794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287523
14110	NC_015470	CGT	2	6	664798	664803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287523
14111	NC_015470	GTC	2	6	664822	664827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287523
14112	NC_015470	CCA	2	6	664853	664858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287523
14113	NC_015470	CAA	2	6	664888	664893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287523
14114	NC_015470	GTTT	2	8	664947	664954	0 %	75 %	25 %	0 %	332287523
14115	NC_015470	A	6	6	665008	665013	100 %	0 %	0 %	0 %	332287523
14116	NC_015470	TC	3	6	665032	665037	0 %	50 %	0 %	50 %	332287523
14117	NC_015470	TAC	2	6	665050	665055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287523
14118	NC_015470	GAA	2	6	665074	665079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287523
14119	NC_015470	GCAA	2	8	665108	665115	50 %	0 %	25 %	25 %	332287523
14120	NC_015470	TTTCC	2	10	665129	665138	0 %	60 %	0 %	40 %	332287523
14121	NC_015470	TCT	2	6	665145	665150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287523
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14123	NC_015470	ATT	2	6	665248	665253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287523
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14125	NC_015470	CAG	2	6	665318	665323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287523
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