MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015470	CAC	2	6	612212	612217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287484
13002	NC_015470	CCA	2	6	612267	612272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287484
13003	NC_015470	GAC	2	6	612299	612304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287484
13004	NC_015470	CTA	2	6	612331	612336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287484
13005	NC_015470	TCA	2	6	612351	612356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287484
13006	NC_015470	TCT	2	6	612430	612435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_015470	GAA	2	6	612537	612542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287485
13008	NC_015470	TCC	2	6	612585	612590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287485
13009	NC_015470	CT	3	6	612653	612658	0 %	50 %	0 %	50 %	332287485
13010	NC_015470	CAA	2	6	612853	612858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287485
13011	NC_015470	CTT	2	6	612887	612892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287485
13012	NC_015470	T	6	6	612898	612903	0 %	100 %	0 %	0 %	332287485
13013	NC_015470	TAAA	2	8	612934	612941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_015470	GCT	2	6	612947	612952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_015470	GTGGTT	2	12	612995	613006	0 %	50 %	50 %	0 %	332287486
13016	NC_015470	TTC	2	6	613248	613253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287486
13017	NC_015470	GTG	2	6	613277	613282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287486
13018	NC_015470	ATC	2	6	613360	613365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287486
13019	NC_015470	CTT	2	6	613394	613399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287486
13020	NC_015470	ATTA	2	8	613419	613426	50 %	50 %	0 %	0 %	332287486
13021	NC_015470	AGTA	2	8	613473	613480	50 %	25 %	25 %	0 %	332287486
13022	NC_015470	AGGG	2	8	613591	613598	25 %	0 %	75 %	0 %	332287486
13023	NC_015470	ACA	2	6	613639	613644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287487
13024	NC_015470	AGA	2	6	613676	613681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287487
13025	NC_015470	TTG	2	6	613699	613704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287487
13026	NC_015470	AAC	2	6	613724	613729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287487
13027	NC_015470	TAG	2	6	613753	613758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287487
13028	NC_015470	CAA	2	6	613812	613817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287487
13029	NC_015470	TGCA	2	8	613854	613861	25 %	25 %	25 %	25 %	332287487
13030	NC_015470	ATC	2	6	613869	613874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287487
13031	NC_015470	CT	3	6	613971	613976	0 %	50 %	0 %	50 %	332287487
13032	NC_015470	CT	3	6	614009	614014	0 %	50 %	0 %	50 %	332287487
13033	NC_015470	CTT	2	6	614034	614039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287487
13034	NC_015470	TGA	2	6	614042	614047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287487
13035	NC_015470	GA	3	6	614108	614113	50 %	0 %	50 %	0 %	332287487
13036	NC_015470	CCAC	2	8	614137	614144	25 %	0 %	0 %	75 %	332287487
13037	NC_015470	GTG	2	6	614282	614287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287487
13038	NC_015470	GCT	2	6	614300	614305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_015470	AGC	2	6	614309	614314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_015470	TGC	2	6	614353	614358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287488
13041	NC_015470	CTT	2	6	614391	614396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287488
13042	NC_015470	CCT	2	6	614495	614500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287488
13043	NC_015470	AAG	2	6	614577	614582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287488
13044	NC_015470	TCG	2	6	614702	614707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287488
13045	NC_015470	TCA	2	6	614732	614737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287488
13046	NC_015470	AAG	2	6	614827	614832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287488
13047	NC_015470	AGA	2	6	614875	614880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287488
13048	NC_015470	A	6	6	614880	614885	100 %	0 %	0 %	0 %	332287488
13049	NC_015470	CCAT	2	8	615035	615042	25 %	25 %	0 %	50 %	332287488
13050	NC_015470	CAT	2	6	615079	615084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287488
13051	NC_015470	TCT	2	6	615152	615157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287488
13052	NC_015470	CCA	2	6	615278	615283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287488
13053	NC_015470	ATC	2	6	615355	615360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287488
13054	NC_015470	CTT	2	6	615366	615371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287488
13055	NC_015470	TTC	2	6	615397	615402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287488
13056	NC_015470	TCA	2	6	615464	615469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287488
13057	NC_015470	TA	3	6	615480	615485	50 %	50 %	0 %	0 %	332287488
13058	NC_015470	AAT	2	6	615486	615491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287488
13059	NC_015470	T	6	6	615594	615599	0 %	100 %	0 %	0 %	332287488
13060	NC_015470	CCA	2	6	615600	615605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287488
13061	NC_015470	T	6	6	615615	615620	0 %	100 %	0 %	0 %	332287488
13062	NC_015470	AGA	2	6	615628	615633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_015470	AAAG	2	8	615664	615671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_015470	TCT	2	6	615679	615684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_015470	AAT	2	6	615704	615709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_015470	TAA	2	6	615728	615733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_015470	TAAT	2	8	615741	615748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_015470	TATT	2	8	615757	615764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_015470	TTA	2	6	615794	615799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_015470	CT	3	6	615803	615808	0 %	50 %	0 %	50 %	332287489
13071	NC_015470	T	8	8	615825	615832	0 %	100 %	0 %	0 %	332287489
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13079	NC_015470	TTC	2	6	616236	616241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287489
13080	NC_015470	CATA	2	8	616265	616272	50 %	25 %	0 %	25 %	332287489
13081	NC_015470	TGC	2	6	616314	616319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287489
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13092	NC_015470	GTT	2	6	616881	616886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287489
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13095	NC_015470	TGAA	2	8	617211	617218	50 %	25 %	25 %	0 %	332287489
13096	NC_015470	TCT	3	9	617230	617238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287489
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13101	NC_015470	ACA	2	6	617407	617412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287489
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13104	NC_015470	AACT	2	8	617559	617566	50 %	25 %	0 %	25 %	332287489
13105	NC_015470	GAGCT	2	10	617593	617602	20 %	20 %	40 %	20 %	332287489
13106	NC_015470	CTT	2	6	617793	617798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287489
13107	NC_015470	GAT	2	6	617816	617821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287489
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13110	NC_015470	GTT	2	6	618059	618064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287489
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13112	NC_015470	ATT	2	6	618082	618087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287489
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13116	NC_015470	AT	3	6	618305	618310	50 %	50 %	0 %	0 %	332287489
13117	NC_015470	GAAA	2	8	618345	618352	75 %	0 %	25 %	0 %	332287489
13118	NC_015470	ACA	2	6	618365	618370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287489
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13244	NC_015470	A	6	6	623972	623977	100 %	0 %	0 %	0 %	332287494
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13493	NC_015470	CTC	2	6	635278	635283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
13494	NC_015470	CTTGTT	2	12	635295	635306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332287504
13495	NC_015470	AAT	2	6	635371	635376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287504
13496	NC_015470	ACT	2	6	635435	635440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
13497	NC_015470	AT	3	6	635514	635519	50 %	50 %	0 %	0 %	332287504
13498	NC_015470	TGT	2	6	635678	635683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287504
13499	NC_015470	TAT	2	6	635764	635769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504
13500	NC_015470	TAT	2	6	635848	635853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504

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