MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015470	TGA	2	6	565967	565972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287441
12003	NC_015470	GATA	2	8	566006	566013	50 %	25 %	25 %	0 %	332287441
12004	NC_015470	TTTG	2	8	566035	566042	0 %	75 %	25 %	0 %	332287441
12005	NC_015470	TTC	2	6	566057	566062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287441
12006	NC_015470	TA	3	6	566102	566107	50 %	50 %	0 %	0 %	332287441
12007	NC_015470	TAT	2	6	566123	566128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287441
12008	NC_015470	ATT	2	6	566134	566139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287441
12009	NC_015470	GTTT	2	8	566278	566285	0 %	75 %	25 %	0 %	332287441
12010	NC_015470	TTC	2	6	566369	566374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287441
12011	NC_015470	T	6	6	566381	566386	0 %	100 %	0 %	0 %	332287441
12012	NC_015470	ATTT	2	8	566404	566411	25 %	75 %	0 %	0 %	332287441
12013	NC_015470	TAC	2	6	566509	566514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_015470	ATTT	2	8	566533	566540	25 %	75 %	0 %	0 %	332287442
12015	NC_015470	T	6	6	566547	566552	0 %	100 %	0 %	0 %	332287442
12016	NC_015470	GTA	2	6	566559	566564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287442
12017	NC_015470	TAA	3	9	566601	566609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287442
12018	NC_015470	TG	3	6	566647	566652	0 %	50 %	50 %	0 %	332287442
12019	NC_015470	CTT	2	6	566654	566659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287442
12020	NC_015470	GAG	2	6	566660	566665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287442
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12022	NC_015470	A	6	6	566733	566738	100 %	0 %	0 %	0 %	332287442
12023	NC_015470	AAAT	2	8	566801	566808	75 %	25 %	0 %	0 %	332287442
12024	NC_015470	CTG	2	6	566873	566878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287442
12025	NC_015470	T	6	6	566967	566972	0 %	100 %	0 %	0 %	332287442
12026	NC_015470	TG	3	6	566998	567003	0 %	50 %	50 %	0 %	332287442
12027	NC_015470	ACA	2	6	567079	567084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287442
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12029	NC_015470	TCT	2	6	567163	567168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287442
12030	NC_015470	TTCT	2	8	567256	567263	0 %	75 %	0 %	25 %	332287442
12031	NC_015470	AGA	2	6	567345	567350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287442
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12033	NC_015470	TGAAC	2	10	567483	567492	40 %	20 %	20 %	20 %	332287442
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12036	NC_015470	AGAT	2	8	567565	567572	50 %	25 %	25 %	0 %	332287442
12037	NC_015470	GAA	2	6	567681	567686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287442
12038	NC_015470	CCA	2	6	567690	567695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287442
12039	NC_015470	ATG	2	6	567743	567748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287442
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12041	NC_015470	AGA	2	6	567806	567811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287442
12042	NC_015470	AGGT	2	8	567843	567850	25 %	25 %	50 %	0 %	332287442
12043	NC_015470	TAC	2	6	567864	567869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287442
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12045	NC_015470	TTC	2	6	568041	568046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287443
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12051	NC_015470	ATC	2	6	568231	568236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287443
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12053	NC_015470	GTAG	2	8	568277	568284	25 %	25 %	50 %	0 %	332287443
12054	NC_015470	CAG	2	6	568347	568352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287443
12055	NC_015470	TCT	2	6	568469	568474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287443
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12058	NC_015470	GTT	2	6	568571	568576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287443
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12066	NC_015470	GTT	2	6	568861	568866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287443
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12069	NC_015470	AT	3	6	568987	568992	50 %	50 %	0 %	0 %	332287443
12070	NC_015470	A	6	6	569097	569102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_015470	CTTT	2	8	569145	569152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12072	NC_015470	ACT	2	6	569210	569215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287444
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12097	NC_015470	T	6	6	570140	570145	0 %	100 %	0 %	0 %	332287444
12098	NC_015470	AGC	2	6	570190	570195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287444
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12100	NC_015470	CT	4	8	570410	570417	0 %	50 %	0 %	50 %	332287444
12101	NC_015470	AAG	2	6	570423	570428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287444
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12104	NC_015470	GCT	2	6	570575	570580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287444
12105	NC_015470	TAC	2	6	570673	570678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287444
12106	NC_015470	AG	3	6	570686	570691	50 %	0 %	50 %	0 %	332287444
12107	NC_015470	GA	3	6	570707	570712	50 %	0 %	50 %	0 %	332287444
12108	NC_015470	TCA	2	6	570788	570793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287444
12109	NC_015470	GCT	2	6	570929	570934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287444
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12113	NC_015470	TTC	2	6	571083	571088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287444
12114	NC_015470	TTATT	2	10	571118	571127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_015470	ATTAA	2	10	571156	571165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_015470	TAT	2	6	571206	571211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_015470	CAT	2	6	571268	571273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287445
12118	NC_015470	ATT	2	6	571362	571367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287445
12119	NC_015470	A	6	6	571477	571482	100 %	0 %	0 %	0 %	332287445
12120	NC_015470	TC	3	6	571608	571613	0 %	50 %	0 %	50 %	332287445
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12244	NC_015470	ATC	2	6	577184	577189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287450
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12248	NC_015470	GAA	2	6	577360	577365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287450
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12256	NC_015470	TTAT	2	8	577700	577707	25 %	75 %	0 %	0 %	332287451
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12315	NC_015470	CTA	2	6	580868	580873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287453
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12342	NC_015470	GATT	2	8	582205	582212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12343	NC_015470	TTC	2	6	582267	582272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12345	NC_015470	ATTT	2	8	582295	582302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12346	NC_015470	TAA	2	6	582303	582308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_015470	A	6	6	582343	582348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12348	NC_015470	TCT	2	6	582378	582383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12349	NC_015470	T	6	6	582393	582398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12350	NC_015470	T	9	9	582460	582468	0 %	100 %	0 %	0 %	332287455
12351	NC_015470	ATT	2	6	582483	582488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287455
12352	NC_015470	CAAGG	2	10	582494	582503	40 %	0 %	40 %	20 %	332287455
12353	NC_015470	TGTA	2	8	582618	582625	25 %	50 %	25 %	0 %	332287455
12354	NC_015470	AC	3	6	582671	582676	50 %	0 %	0 %	50 %	332287455
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12357	NC_015470	AAG	2	6	582873	582878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287455
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12361	NC_015470	GCTT	2	8	583037	583044	0 %	50 %	25 %	25 %	332287455
12362	NC_015470	AC	3	6	583045	583050	50 %	0 %	0 %	50 %	332287455
12363	NC_015470	AAGATG	2	12	583092	583103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332287455
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12490	NC_015470	AGC	2	6	589024	589029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287461
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