MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_015470	TGA	2	6	519723	519728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287404
11003	NC_015470	AATT	2	8	519744	519751	50 %	50 %	0 %	0 %	332287404
11004	NC_015470	AAT	2	6	519760	519765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287404
11005	NC_015470	GAG	2	6	519857	519862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287404
11006	NC_015470	CGG	2	6	519896	519901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287404
11007	NC_015470	TTC	2	6	519986	519991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287404
11008	NC_015470	A	7	7	520028	520034	100 %	0 %	0 %	0 %	332287404
11009	NC_015470	AGC	2	6	520159	520164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287404
11010	NC_015470	TAA	2	6	520189	520194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287404
11011	NC_015470	T	6	6	520250	520255	0 %	100 %	0 %	0 %	332287404
11012	NC_015470	GGTC	2	8	520285	520292	0 %	25 %	50 %	25 %	332287404
11013	NC_015470	ACA	2	6	520295	520300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287404
11014	NC_015470	CAA	2	6	520320	520325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287404
11015	NC_015470	GTAAAG	2	12	520341	520352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332287404
11016	NC_015470	CTT	2	6	520425	520430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287404
11017	NC_015470	A	6	6	520468	520473	100 %	0 %	0 %	0 %	332287404
11018	NC_015470	CGA	2	6	520474	520479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287404
11019	NC_015470	TAGA	2	8	520480	520487	50 %	25 %	25 %	0 %	332287404
11020	NC_015470	GGAA	2	8	520522	520529	50 %	0 %	50 %	0 %	332287404
11021	NC_015470	T	6	6	520555	520560	0 %	100 %	0 %	0 %	332287404
11022	NC_015470	T	6	6	520599	520604	0 %	100 %	0 %	0 %	332287404
11023	NC_015470	AAT	2	6	520648	520653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_015470	AG	3	6	520686	520691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_015470	ATT	2	6	520713	520718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_015470	TTC	2	6	520925	520930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_015470	TAA	2	6	520942	520947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_015470	CTT	2	6	521054	521059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287405
11029	NC_015470	TGA	2	6	521112	521117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287405
11030	NC_015470	GAGTCA	2	12	521142	521153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332287405
11031	NC_015470	TTTC	2	8	521239	521246	0 %	75 %	0 %	25 %	332287405
11032	NC_015470	TGT	2	6	521277	521282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287405
11033	NC_015470	GTT	2	6	521285	521290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287405
11034	NC_015470	AGAT	2	8	521324	521331	50 %	25 %	25 %	0 %	332287405
11035	NC_015470	TGA	2	6	521337	521342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287405
11036	NC_015470	TCT	2	6	521383	521388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287405
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11038	NC_015470	AAGC	2	8	521416	521423	50 %	0 %	25 %	25 %	332287405
11039	NC_015470	GAA	2	6	521430	521435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287405
11040	NC_015470	AGA	2	6	521523	521528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287405
11041	NC_015470	TGT	2	6	521573	521578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287405
11042	NC_015470	TGT	2	6	521634	521639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287405
11043	NC_015470	GAA	2	6	521641	521646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287405
11044	NC_015470	TGT	2	6	521670	521675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287405
11045	NC_015470	AGA	3	9	521694	521702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287405
11046	NC_015470	TGC	2	6	521787	521792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287405
11047	NC_015470	GATT	2	8	521807	521814	25 %	50 %	25 %	0 %	332287405
11048	NC_015470	TAG	2	6	522061	522066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287405
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11051	NC_015470	GAGAA	2	10	522124	522133	60 %	0 %	40 %	0 %	332287406
11052	NC_015470	TCTT	2	8	522137	522144	0 %	75 %	0 %	25 %	332287406
11053	NC_015470	TTC	2	6	522235	522240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287406
11054	NC_015470	AT	3	6	522278	522283	50 %	50 %	0 %	0 %	332287406
11055	NC_015470	GCAT	2	8	522305	522312	25 %	25 %	25 %	25 %	332287406
11056	NC_015470	ATCT	2	8	522503	522510	25 %	50 %	0 %	25 %	332287406
11057	NC_015470	GAG	2	6	522514	522519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287406
11058	NC_015470	CCTTC	2	10	522579	522588	0 %	40 %	0 %	60 %	332287406
11059	NC_015470	CAG	2	6	522667	522672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287406
11060	NC_015470	AGT	2	6	522712	522717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287406
11061	NC_015470	CAGT	2	8	522853	522860	25 %	25 %	25 %	25 %	332287406
11062	NC_015470	A	7	7	522890	522896	100 %	0 %	0 %	0 %	332287406
11063	NC_015470	AT	3	6	522977	522982	50 %	50 %	0 %	0 %	332287407
11064	NC_015470	TTC	2	6	523059	523064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287407
11065	NC_015470	TAC	2	6	523109	523114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287407
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11067	NC_015470	G	7	7	523281	523287	0 %	0 %	100 %	0 %	332287407
11068	NC_015470	TTG	2	6	523290	523295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287407
11069	NC_015470	TAGG	2	8	523339	523346	25 %	25 %	50 %	0 %	332287407
11070	NC_015470	T	6	6	523351	523356	0 %	100 %	0 %	0 %	332287407
11071	NC_015470	CAA	2	6	523364	523369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287407
11072	NC_015470	ATA	2	6	523442	523447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287407
11073	NC_015470	T	8	8	523535	523542	0 %	100 %	0 %	0 %	332287407
11074	NC_015470	TCCT	2	8	523586	523593	0 %	50 %	0 %	50 %	332287407
11075	NC_015470	AGA	2	6	523609	523614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287407
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11077	NC_015470	ATG	2	6	523648	523653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11079	NC_015470	ACG	2	6	523793	523798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287408
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11082	NC_015470	AT	3	6	524074	524079	50 %	50 %	0 %	0 %	332287409
11083	NC_015470	ACCT	2	8	524104	524111	25 %	25 %	0 %	50 %	332287409
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11086	NC_015470	CTT	2	6	524163	524168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287409
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11089	NC_015470	TTA	2	6	524225	524230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287409
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11092	NC_015470	CAG	2	6	524331	524336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287409
11093	NC_015470	TC	3	6	524347	524352	0 %	50 %	0 %	50 %	332287409
11094	NC_015470	TCA	2	6	524379	524384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287409
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11105	NC_015470	ACA	2	6	524780	524785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287409
11106	NC_015470	GCCT	2	8	524794	524801	0 %	25 %	25 %	50 %	332287409
11107	NC_015470	CACGAG	2	12	525009	525020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287409
11108	NC_015470	AGCA	2	8	525061	525068	50 %	0 %	25 %	25 %	332287409
11109	NC_015470	ATTG	2	8	525214	525221	25 %	50 %	25 %	0 %	332287409
11110	NC_015470	ACA	2	6	525224	525229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287409
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11114	NC_015470	AGT	2	6	525490	525495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287409
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11118	NC_015470	TGA	2	6	525619	525624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287409
11119	NC_015470	TGT	2	6	525670	525675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287409
11120	NC_015470	GT	3	6	525824	525829	0 %	50 %	50 %	0 %	332287409
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11122	NC_015470	T	6	6	525849	525854	0 %	100 %	0 %	0 %	332287409
11123	NC_015470	T	7	7	525862	525868	0 %	100 %	0 %	0 %	332287409
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11241	NC_015470	AAG	2	6	531124	531129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287413
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11243	NC_015470	AAT	2	6	531239	531244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287413
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11492	NC_015470	TTA	2	6	543357	543362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287423
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11496	NC_015470	GAG	2	6	543465	543470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287423
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