MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015470	AAG	2	6	23077	23082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286974
502	NC_015470	AAC	2	6	23108	23113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286974
503	NC_015470	GGT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286974
504	NC_015470	AGC	2	6	23176	23181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286974
505	NC_015470	ATG	2	6	23266	23271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286974
506	NC_015470	AGC	2	6	23283	23288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286974
507	NC_015470	GCT	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286974
508	NC_015470	CTG	2	6	23380	23385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286974
509	NC_015470	ATG	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286974
510	NC_015470	TTA	2	6	23599	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286974
511	NC_015470	AAG	2	6	23656	23661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286974
512	NC_015470	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	332286974
513	NC_015470	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015470	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015470	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015470	TTG	2	6	24012	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
517	NC_015470	TGT	2	6	24049	24054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
518	NC_015470	AGT	2	6	24066	24071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286975
519	NC_015470	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
520	NC_015470	TCC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286975
521	NC_015470	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	332286975
522	NC_015470	TTG	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
523	NC_015470	GAA	2	6	24364	24369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286975
524	NC_015470	T	6	6	24381	24386	0 %	100 %	0 %	0 %	332286975
525	NC_015470	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	332286975
526	NC_015470	CTT	2	6	24518	24523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286975
527	NC_015470	AGG	2	6	24539	24544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286975
528	NC_015470	GTA	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286975
529	NC_015470	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286975
530	NC_015470	TTA	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
531	NC_015470	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	332286975
532	NC_015470	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	332286975
533	NC_015470	T	8	8	24798	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	332286975
534	NC_015470	TGT	2	6	24820	24825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
535	NC_015470	GCT	2	6	24850	24855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286975
536	NC_015470	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	332286975
537	NC_015470	ATC	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286975
538	NC_015470	ACC	2	6	24966	24971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332286975
539	NC_015470	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	332286975
540	NC_015470	TTG	2	6	25010	25015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
541	NC_015470	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
542	NC_015470	ATT	2	6	25113	25118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
543	NC_015470	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286975
544	NC_015470	TTG	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286975
545	NC_015470	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	332286975
546	NC_015470	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286975
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548	NC_015470	GCA	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286975
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550	NC_015470	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	332286975
551	NC_015470	TAA	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286975
552	NC_015470	CTT	3	9	25649	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286975
553	NC_015470	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
554	NC_015470	TTA	2	6	25753	25758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
555	NC_015470	TAT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
556	NC_015470	TCA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286975
557	NC_015470	CCA	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332286975
558	NC_015470	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286975
559	NC_015470	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	332286975
560	NC_015470	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	332286975
561	NC_015470	TTC	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286975
562	NC_015470	TCT	2	6	25918	25923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286975
563	NC_015470	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	332286975
564	NC_015470	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	332286975
565	NC_015470	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286975
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573	NC_015470	AGA	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286975
574	NC_015470	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015470	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015470	TTC	2	6	26614	26619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015470	ATTT	2	8	26655	26662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015470	ATTA	2	8	26666	26673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015470	TTA	2	6	26697	26702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_015470	TGA	2	6	26909	26914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286976
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592	NC_015470	CTGG	2	8	27186	27193	0 %	25 %	50 %	25 %	332286976
593	NC_015470	AAG	2	6	27274	27279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286976
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598	NC_015470	TC	3	6	27458	27463	0 %	50 %	0 %	50 %	332286976
599	NC_015470	AGA	3	9	27563	27571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286976
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610	NC_015470	TTG	2	6	28075	28080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286976
611	NC_015470	CTA	2	6	28096	28101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286976
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613	NC_015470	AAG	2	6	28141	28146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286976
614	NC_015470	GAC	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286976
615	NC_015470	AAG	2	6	28261	28266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286976
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617	NC_015470	GCA	2	6	28368	28373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286976
618	NC_015470	T	6	6	28616	28621	0 %	100 %	0 %	0 %	332286976
619	NC_015470	TGC	2	6	28709	28714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286976
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