MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015470	TTG	2	6	282395	282400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287214
6002	NC_015470	TTC	2	6	282474	282479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287214
6003	NC_015470	AAC	2	6	282489	282494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287214
6004	NC_015470	CA	3	6	282534	282539	50 %	0 %	0 %	50 %	332287214
6005	NC_015470	TTG	2	6	282592	282597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287214
6006	NC_015470	T	6	6	282622	282627	0 %	100 %	0 %	0 %	332287214
6007	NC_015470	TTG	2	6	282650	282655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287214
6008	NC_015470	CAT	2	6	282679	282684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287214
6009	NC_015470	TTA	2	6	282703	282708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287214
6010	NC_015470	TCC	2	6	282867	282872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287214
6011	NC_015470	TTA	2	6	282883	282888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287214
6012	NC_015470	CCG	2	6	282907	282912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332287214
6013	NC_015470	TTC	2	6	282926	282931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287214
6014	NC_015470	CTT	3	9	282968	282976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287214
6015	NC_015470	TCA	2	6	283061	283066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287215
6016	NC_015470	TTC	2	6	283165	283170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287215
6017	NC_015470	ATA	2	6	283245	283250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287215
6018	NC_015470	GAT	2	6	283310	283315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287215
6019	NC_015470	CAG	2	6	283340	283345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287215
6020	NC_015470	TC	3	6	283346	283351	0 %	50 %	0 %	50 %	332287215
6021	NC_015470	CTG	2	6	283440	283445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287215
6022	NC_015470	ATC	2	6	283521	283526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287215
6023	NC_015470	TC	3	6	283639	283644	0 %	50 %	0 %	50 %	332287215
6024	NC_015470	TCT	2	6	283649	283654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287215
6025	NC_015470	CCT	2	6	283661	283666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287215
6026	NC_015470	A	7	7	283741	283747	100 %	0 %	0 %	0 %	332287215
6027	NC_015470	ATG	2	6	283818	283823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287215
6028	NC_015470	TCGT	2	8	283841	283848	0 %	50 %	25 %	25 %	332287215
6029	NC_015470	A	8	8	283862	283869	100 %	0 %	0 %	0 %	332287216
6030	NC_015470	AGA	2	6	283876	283881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287216
6031	NC_015470	GA	3	6	283893	283898	50 %	0 %	50 %	0 %	332287216
6032	NC_015470	GAA	2	6	284000	284005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287216
6033	NC_015470	TCT	2	6	284087	284092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287216
6034	NC_015470	ATTG	2	8	284164	284171	25 %	50 %	25 %	0 %	332287216
6035	NC_015470	TGA	2	6	284173	284178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287216
6036	NC_015470	CAG	2	6	284195	284200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287216
6037	NC_015470	AGCACG	2	12	284311	284322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287216
6038	NC_015470	GGT	2	6	284381	284386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287216
6039	NC_015470	GGA	2	6	284393	284398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287216
6040	NC_015470	TAGA	2	8	284433	284440	50 %	25 %	25 %	0 %	332287216
6041	NC_015470	GAT	2	6	284443	284448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287216
6042	NC_015470	AAAGA	2	10	284499	284508	80 %	0 %	20 %	0 %	332287216
6043	NC_015470	GCG	2	6	284509	284514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287216
6044	NC_015470	GT	3	6	284662	284667	0 %	50 %	50 %	0 %	332287216
6045	NC_015470	TTG	2	6	284736	284741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287216
6046	NC_015470	TGT	2	6	284794	284799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287216
6047	NC_015470	ATC	2	6	284882	284887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287216
6048	NC_015470	CAC	2	6	284952	284957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287216
6049	NC_015470	TCT	2	6	285001	285006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287216
6050	NC_015470	ATG	2	6	285096	285101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287216
6051	NC_015470	TCG	2	6	285121	285126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287216
6052	NC_015470	GAT	2	6	285131	285136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287216
6053	NC_015470	TTC	2	6	285208	285213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287216
6054	NC_015470	A	6	6	285272	285277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015470	TTA	2	6	285286	285291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015470	T	7	7	285332	285338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015470	TTGT	2	8	285392	285399	0 %	75 %	25 %	0 %	332287217
6058	NC_015470	CTT	2	6	285453	285458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287217
6059	NC_015470	T	6	6	285591	285596	0 %	100 %	0 %	0 %	332287217
6060	NC_015470	GTT	2	6	285598	285603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287217
6061	NC_015470	GTT	2	6	285608	285613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287217
6062	NC_015470	T	6	6	285634	285639	0 %	100 %	0 %	0 %	332287217
6063	NC_015470	AGAC	2	8	285648	285655	50 %	0 %	25 %	25 %	332287217
6064	NC_015470	TCT	2	6	285660	285665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287217
6065	NC_015470	TAT	2	6	285813	285818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287217
6066	NC_015470	CTTA	2	8	285821	285828	25 %	50 %	0 %	25 %	332287217
6067	NC_015470	TCCCG	2	10	285844	285853	0 %	20 %	20 %	60 %	332287217
6068	NC_015470	GAG	2	6	285868	285873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287217
6069	NC_015470	CTTAT	2	10	285962	285971	20 %	60 %	0 %	20 %	332287217
6070	NC_015470	AGAA	2	8	285999	286006	75 %	0 %	25 %	0 %	332287217
6071	NC_015470	TCT	2	6	286015	286020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287217
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6073	NC_015470	AT	3	6	286055	286060	50 %	50 %	0 %	0 %	332287217
6074	NC_015470	TAT	3	9	286058	286066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287217
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6080	NC_015470	TCT	2	6	286354	286359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287217
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6082	NC_015470	GAA	2	6	286389	286394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287217
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6093	NC_015470	TCCT	2	8	287002	287009	0 %	50 %	0 %	50 %	332287218
6094	NC_015470	AAGA	2	8	287113	287120	75 %	0 %	25 %	0 %	332287218
6095	NC_015470	A	8	8	287120	287127	100 %	0 %	0 %	0 %	332287218
6096	NC_015470	TTTA	2	8	287267	287274	25 %	75 %	0 %	0 %	332287218
6097	NC_015470	TAT	2	6	287306	287311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287218
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6102	NC_015470	TTC	2	6	287486	287491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287218
6103	NC_015470	A	6	6	287579	287584	100 %	0 %	0 %	0 %	332287218
6104	NC_015470	TTA	2	6	287670	287675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287219
6105	NC_015470	CTC	2	6	287729	287734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287219
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6107	NC_015470	TATC	2	8	287876	287883	25 %	50 %	0 %	25 %	332287219
6108	NC_015470	T	6	6	287948	287953	0 %	100 %	0 %	0 %	332287219
6109	NC_015470	TCA	2	6	287957	287962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287219
6110	NC_015470	ATG	2	6	288007	288012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287219
6111	NC_015470	TGT	2	6	288071	288076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287219
6112	NC_015470	ATT	2	6	288146	288151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287219
6113	NC_015470	GAA	2	6	288165	288170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287219
6114	NC_015470	CTC	3	9	288253	288261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287219
6115	NC_015470	TGGA	2	8	288315	288322	25 %	25 %	50 %	0 %	332287219
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6119	NC_015470	ACC	2	6	288586	288591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287219
6120	NC_015470	GCTTT	2	10	288652	288661	0 %	60 %	20 %	20 %	332287219
6121	NC_015470	TGT	2	6	288847	288852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287219
6122	NC_015470	AAG	2	6	288871	288876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287219
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6124	NC_015470	AGG	2	6	289034	289039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287219
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6495	NC_015470	AAC	2	6	307016	307021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287226
6496	NC_015470	CAC	2	6	307093	307098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287226
6497	NC_015470	ATGG	2	8	307131	307138	25 %	25 %	50 %	0 %	332287226
6498	NC_015470	TTG	2	6	307159	307164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287226
6499	NC_015470	ACT	2	6	307239	307244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287226
6500	NC_015470	CCA	2	6	307260	307265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287226

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