MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 30837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	T	6	6	2	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014774	CAA	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014774	AAAC	2	8	130	137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014774	TA	3	6	200	205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014774	A	6	6	222	227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014774	AGC	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014774	TCT	2	6	285	290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014774	TCC	2	6	302	307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014774	ATG	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014774	CGA	2	6	360	365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014774	ATC	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014774	CTT	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
13	NC_014774	TCA	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
14	NC_014774	T	7	7	642	648	0 %	100 %	0 %	0 %	315121752
15	NC_014774	CAT	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
16	NC_014774	GATT	2	8	716	723	25 %	50 %	25 %	0 %	315121752
17	NC_014774	CAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
18	NC_014774	A	6	6	771	776	100 %	0 %	0 %	0 %	315121752
19	NC_014774	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121752
20	NC_014774	GCA	2	6	790	795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121752
21	NC_014774	CGC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121752
22	NC_014774	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121752
23	NC_014774	CAT	3	9	950	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
24	NC_014774	ATTCA	2	10	960	969	40 %	40 %	0 %	20 %	315121752
25	NC_014774	TTTTG	2	10	1012	1021	0 %	80 %	20 %	0 %	315121752
26	NC_014774	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	315121752
27	NC_014774	ACA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121752
28	NC_014774	AGA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
29	NC_014774	ATTT	2	8	1205	1212	25 %	75 %	0 %	0 %	315121752
30	NC_014774	AATC	2	8	1269	1276	50 %	25 %	0 %	25 %	315121752
31	NC_014774	TTG	2	6	1286	1291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121752
32	NC_014774	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
33	NC_014774	TTC	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
34	NC_014774	A	6	6	1544	1549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014774	A	8	8	1551	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014774	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014774	T	8	8	1604	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014774	TCA	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014774	TAGAA	2	10	1725	1734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014774	T	6	6	1738	1743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014774	ATC	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014774	CCCT	2	8	1783	1790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014774	TAT	2	6	1794	1799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014774	ATTT	2	8	1829	1836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014774	ATA	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014774	TTA	2	6	1878	1883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014774	AAC	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014774	AAT	2	6	1947	1952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014774	CAA	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
50	NC_014774	GAT	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121753
51	NC_014774	CAT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
52	NC_014774	CAA	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
53	NC_014774	TAA	2	6	2203	2208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121753
54	NC_014774	T	6	6	2215	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	315121753
55	NC_014774	AAC	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
56	NC_014774	TCC	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121753
57	NC_014774	CAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
58	NC_014774	TGT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
59	NC_014774	CAAATG	2	12	2353	2364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315121753
60	NC_014774	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121753
61	NC_014774	ACT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
62	NC_014774	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
63	NC_014774	TCAAA	2	10	2598	2607	60 %	20 %	0 %	20 %	315121753
64	NC_014774	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
65	NC_014774	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
66	NC_014774	CAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
67	NC_014774	TTG	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
68	NC_014774	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
69	NC_014774	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
70	NC_014774	AAGCAA	2	12	2848	2859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315121754
71	NC_014774	TAT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
72	NC_014774	TAATT	2	10	2886	2895	40 %	60 %	0 %	0 %	315121754
73	NC_014774	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
74	NC_014774	GAA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
75	NC_014774	ATT	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
76	NC_014774	AAT	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
77	NC_014774	A	8	8	3081	3088	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
78	NC_014774	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
79	NC_014774	TTGA	2	8	3149	3156	25 %	50 %	25 %	0 %	315121754
80	NC_014774	TC	3	6	3183	3188	0 %	50 %	0 %	50 %	315121754
81	NC_014774	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
82	NC_014774	TGT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
83	NC_014774	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
84	NC_014774	A	6	6	3350	3355	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
85	NC_014774	AAT	2	6	3371	3376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
86	NC_014774	CCA	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
87	NC_014774	ATC	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
88	NC_014774	AAT	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
89	NC_014774	A	7	7	3448	3454	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
90	NC_014774	CAAA	2	8	3491	3498	75 %	0 %	0 %	25 %	315121754
91	NC_014774	A	9	9	3496	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
92	NC_014774	AGAA	2	8	3515	3522	75 %	0 %	25 %	0 %	315121754
93	NC_014774	TTA	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
94	NC_014774	TAG	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
95	NC_014774	CCT	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121754
96	NC_014774	TAG	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
97	NC_014774	CATAA	2	10	3636	3645	60 %	20 %	0 %	20 %	315121754
98	NC_014774	GCC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121754
99	NC_014774	CAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
100	NC_014774	A	6	6	3704	3709	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
101	NC_014774	GTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
102	NC_014774	GCTA	2	8	3791	3798	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
103	NC_014774	A	6	6	3809	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
104	NC_014774	CAA	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
105	NC_014774	AAATT	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	315121754
106	NC_014774	ATCC	2	8	3894	3901	25 %	25 %	0 %	50 %	315121754
107	NC_014774	CAC	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
108	NC_014774	ATA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
109	NC_014774	AG	3	6	4058	4063	50 %	0 %	50 %	0 %	315121754
110	NC_014774	TGCC	2	8	4067	4074	0 %	25 %	25 %	50 %	315121754
111	NC_014774	AAT	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
112	NC_014774	ATAA	2	8	4099	4106	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
113	NC_014774	AAAT	2	8	4114	4121	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
114	NC_014774	AT	3	6	4143	4148	50 %	50 %	0 %	0 %	315121754
115	NC_014774	AAG	2	6	4169	4174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
116	NC_014774	TGAC	2	8	4235	4242	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
117	NC_014774	TCT	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121755
118	NC_014774	T	6	6	4329	4334	0 %	100 %	0 %	0 %	315121755
119	NC_014774	AAC	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121755
120	NC_014774	ATAA	2	8	4750	4757	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
121	NC_014774	TG	3	6	4769	4774	0 %	50 %	50 %	0 %	315121755
122	NC_014774	TAA	2	6	4779	4784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
123	NC_014774	TCA	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
124	NC_014774	ATAA	2	8	4828	4835	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
125	NC_014774	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
126	NC_014774	TTCCA	2	10	4877	4886	20 %	40 %	0 %	40 %	315121755
127	NC_014774	CT	3	6	4919	4924	0 %	50 %	0 %	50 %	315121755
128	NC_014774	AAAC	2	8	4927	4934	75 %	0 %	0 %	25 %	315121755
129	NC_014774	T	7	7	4938	4944	0 %	100 %	0 %	0 %	315121755
130	NC_014774	ATT	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
131	NC_014774	TAA	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
132	NC_014774	CAT	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
133	NC_014774	AGA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121755
134	NC_014774	TTTTA	2	10	5092	5101	20 %	80 %	0 %	0 %	315121755
135	NC_014774	C	6	6	5109	5114	0 %	0 %	0 %	100 %	315121755
136	NC_014774	ACTA	2	8	5200	5207	50 %	25 %	0 %	25 %	315121755
137	NC_014774	TCT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014774	A	8	8	5267	5274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014774	A	6	6	5283	5288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014774	GGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014774	TCTA	2	8	5319	5326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014774	TAA	2	6	5327	5332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014774	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014774	A	6	6	5375	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014774	CTATCA	2	12	5413	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014774	TAA	2	6	5583	5588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
147	NC_014774	T	6	6	5612	5617	0 %	100 %	0 %	0 %	315121756
148	NC_014774	AAT	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
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151	NC_014774	TTC	2	6	5813	5818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121756
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153	NC_014774	T	6	6	5845	5850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014774	CT	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014774	CCT	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014774	TTA	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014774	T	6	6	5948	5953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014774	T	6	6	5995	6000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014774	AAT	2	6	6027	6032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014774	TTAA	2	8	6081	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014774	T	7	7	6101	6107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014774	ATTT	2	8	6108	6115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014774	TAT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014774	T	7	7	6158	6164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014774	A	6	6	6190	6195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014774	TATC	2	8	6294	6301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_014774	ATTAT	2	10	6381	6390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014774	AGTA	2	8	6404	6411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014774	TTA	2	6	6660	6665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014774	ATG	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_014774	ATC	3	9	6721	6729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_014774	TGT	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014774	TTG	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014774	TTA	2	6	6859	6864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014774	TTA	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014774	ATTT	2	8	6883	6890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014774	ATG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
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244	NC_014774	AC	3	6	8794	8799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
245	NC_014774	TTA	2	6	8820	8825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014774	A	8	8	8933	8940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_014774	A	7	7	9423	9429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014774	ATC	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_014774	ATTT	2	8	9530	9537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014774	A	7	7	9552	9558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014774	TCT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121761
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272	NC_014774	TCAAA	2	10	9939	9948	60 %	20 %	0 %	20 %	315121761
273	NC_014774	TCT	2	6	9959	9964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121761
274	NC_014774	TATC	2	8	9984	9991	25 %	50 %	0 %	25 %	315121761
275	NC_014774	TAG	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121761
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277	NC_014774	A	7	7	10217	10223	100 %	0 %	0 %	0 %	315121761
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280	NC_014774	ACA	2	6	10469	10474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_014774	GAAAA	2	10	10548	10557	80 %	0 %	20 %	0 %	315121762
282	NC_014774	TGG	2	6	10669	10674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315121762
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