MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 30837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014774	GAAA	2	8	147562	147569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014774	T	6	6	147620	147625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014774	ATT	2	6	147637	147642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014774	GAA	2	6	147677	147682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014774	CAA	2	6	147737	147742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014774	CAC	2	6	147746	147751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_014774	TCAT	2	8	147830	147837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_014774	ACT	2	6	147893	147898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_014774	TAA	2	6	147904	147909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014774	AT	3	6	147914	147919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014774	TTG	2	6	147970	147975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014774	CAA	2	6	148060	148065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121894
3513	NC_014774	A	6	6	148104	148109	100 %	0 %	0 %	0 %	315121894
3514	NC_014774	GAA	2	6	148133	148138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014774	CTT	2	6	148141	148146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_014774	AAATAA	2	12	148210	148221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014774	A	7	7	148246	148252	100 %	0 %	0 %	0 %	315121895
3518	NC_014774	A	7	7	148269	148275	100 %	0 %	0 %	0 %	315121895
3519	NC_014774	AT	3	6	148330	148335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014774	CT	3	6	148414	148419	0 %	50 %	0 %	50 %	315121896
3521	NC_014774	GCA	2	6	148485	148490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121896
3522	NC_014774	TTAAA	2	10	148573	148582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014774	TCC	2	6	148600	148605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_014774	A	6	6	148613	148618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014774	TAAAA	2	10	148666	148675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014774	AATT	2	8	148683	148690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014774	TAA	2	6	148698	148703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014774	ATC	2	6	148734	148739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014774	AGT	2	6	148755	148760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014774	A	6	6	148761	148766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014774	GAA	2	6	148843	148848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121897
3532	NC_014774	AAT	2	6	148910	148915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121897
3533	NC_014774	CAC	2	6	148916	148921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121897
3534	NC_014774	GCA	2	6	148932	148937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121897
3535	NC_014774	AAT	2	6	149012	149017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014774	TAT	2	6	149045	149050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014774	AT	3	6	149071	149076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014774	AAAAT	2	10	149105	149114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014774	GTA	2	6	149134	149139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014774	AT	3	6	149145	149150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014774	AAT	2	6	149158	149163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014774	CAA	2	6	149244	149249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_014774	AGA	2	6	149277	149282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121898
3544	NC_014774	GCA	2	6	149291	149296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121898
3545	NC_014774	GAA	2	6	149368	149373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014774	TCC	2	6	149374	149379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_014774	AAC	2	6	149398	149403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014774	AT	3	6	149422	149427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014774	AT	3	6	149429	149434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014774	TA	3	6	149437	149442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014774	TA	3	6	149446	149451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014774	TA	3	6	149453	149458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014774	TAA	2	6	149476	149481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014774	AAT	2	6	149483	149488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014774	ACC	2	6	149521	149526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_014774	ATG	2	6	149527	149532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014774	CGG	2	6	149544	149549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_014774	AAT	2	6	149578	149583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014774	AAG	2	6	149604	149609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014774	CTA	2	6	149696	149701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121899
3561	NC_014774	GCA	2	6	149713	149718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121899
3562	NC_014774	T	7	7	149765	149771	0 %	100 %	0 %	0 %	315121899
3563	NC_014774	CTC	2	6	149796	149801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_014774	TAC	2	6	149887	149892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121900
3565	NC_014774	AGAT	3	12	149926	149937	50 %	25 %	25 %	0 %	315121900
3566	NC_014774	TTGTT	2	10	149996	150005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014774	ATT	2	6	150017	150022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014774	ATT	2	6	150051	150056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014774	ATT	2	6	150070	150075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014774	ACT	2	6	150083	150088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_014774	TTA	2	6	150089	150094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3575	NC_014774	A	7	7	150286	150292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014774	T	6	6	150333	150338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014774	TCT	2	6	150352	150357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_014774	TAA	2	6	150385	150390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014774	T	6	6	150439	150444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014774	TAC	2	6	150457	150462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_014774	AAG	2	6	150472	150477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014774	ATTT	2	8	150506	150513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014774	ATA	2	6	150521	150526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014774	CAT	2	6	150578	150583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121901
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3589	NC_014774	ACA	2	6	150713	150718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121901
3590	NC_014774	A	8	8	150721	150728	100 %	0 %	0 %	0 %	315121901
3591	NC_014774	GC	3	6	150759	150764	0 %	0 %	50 %	50 %	315121901
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3595	NC_014774	ATCG	2	8	150881	150888	25 %	25 %	25 %	25 %	315121901
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3597	NC_014774	ATC	2	6	150921	150926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121901
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3599	NC_014774	A	6	6	150967	150972	100 %	0 %	0 %	0 %	315121901
3600	NC_014774	A	7	7	150990	150996	100 %	0 %	0 %	0 %	315121901
3601	NC_014774	ATC	2	6	151011	151016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121901
3602	NC_014774	CAA	2	6	151031	151036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121901
3603	NC_014774	TTC	2	6	151039	151044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121901
3604	NC_014774	AG	3	6	151177	151182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014774	A	6	6	151203	151208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014774	TTGA	2	8	151221	151228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014774	A	6	6	151231	151236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014774	T	7	7	151334	151340	0 %	100 %	0 %	0 %	315121902
3609	NC_014774	ATA	2	6	151342	151347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121902
3610	NC_014774	ATAAGA	2	12	151365	151376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315121902
3611	NC_014774	TAG	2	6	151409	151414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121902
3612	NC_014774	TTTC	2	8	151438	151445	0 %	75 %	0 %	25 %	315121902
3613	NC_014774	AAC	2	6	151451	151456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_014774	AAT	2	6	151487	151492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121903
3615	NC_014774	GCA	2	6	151495	151500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121903
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3617	NC_014774	TAAC	2	8	151613	151620	50 %	25 %	0 %	25 %	315121903
3618	NC_014774	ATT	2	6	151665	151670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121903
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3620	NC_014774	CAA	2	6	151698	151703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121903
3621	NC_014774	CTATC	2	10	151706	151715	20 %	40 %	0 %	40 %	315121903
3622	NC_014774	CAT	2	6	151721	151726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121903
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3624	NC_014774	TATAA	2	10	151836	151845	60 %	40 %	0 %	0 %	315121903
3625	NC_014774	CAT	2	6	151850	151855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121903
3626	NC_014774	GCTG	2	8	151939	151946	0 %	25 %	50 %	25 %	315121903
3627	NC_014774	CTAG	2	8	151969	151976	25 %	25 %	25 %	25 %	315121903
3628	NC_014774	CCG	2	6	152001	152006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121903
3629	NC_014774	AAAAG	2	10	152019	152028	80 %	0 %	20 %	0 %	315121903
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