MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 30837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014774	TGA	2	6	541590	541595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122249
13002	NC_014774	TAATGC	2	12	541734	541745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315122249
13003	NC_014774	ATCTG	2	10	541797	541806	20 %	40 %	20 %	20 %	315122249
13004	NC_014774	AAG	2	6	541817	541822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315122249
13005	NC_014774	CTT	2	6	541900	541905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315122249
13006	NC_014774	TGA	2	6	541917	541922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122249
13007	NC_014774	GCTTG	2	10	541924	541933	0 %	40 %	40 %	20 %	315122249
13008	NC_014774	GAT	2	6	541947	541952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122249
13009	NC_014774	CAAT	2	8	542015	542022	50 %	25 %	0 %	25 %	315122249
13010	NC_014774	GAT	2	6	542043	542048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122249
13011	NC_014774	TGT	2	6	542079	542084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315122249
13012	NC_014774	GATATT	2	12	542089	542100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	315122249
13013	NC_014774	TCT	2	6	542101	542106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315122249
13014	NC_014774	TCC	2	6	542232	542237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315122249
13015	NC_014774	GAT	2	6	542251	542256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122249
13016	NC_014774	GTG	2	6	542317	542322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315122249
13017	NC_014774	TG	3	6	542321	542326	0 %	50 %	50 %	0 %	315122249
13018	NC_014774	TGG	2	6	542461	542466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315122249
13019	NC_014774	AATT	2	8	542571	542578	50 %	50 %	0 %	0 %	315122249
13020	NC_014774	AAG	2	6	542585	542590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315122249
13021	NC_014774	AGA	2	6	542610	542615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315122249
13022	NC_014774	TATTC	2	10	542728	542737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13023	NC_014774	TTTG	2	8	542779	542786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_014774	GAA	2	6	542798	542803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014774	T	6	6	542841	542846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_014774	ATT	2	6	542867	542872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_014774	A	7	7	542906	542912	100 %	0 %	0 %	0 %	315122250
13028	NC_014774	G	6	6	543014	543019	0 %	0 %	100 %	0 %	315122250
13029	NC_014774	TAT	2	6	543082	543087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315122250
13030	NC_014774	TTGAT	2	10	543099	543108	20 %	60 %	20 %	0 %	315122250
13031	NC_014774	T	7	7	543161	543167	0 %	100 %	0 %	0 %	315122250
13032	NC_014774	TCA	2	6	543172	543177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315122250
13033	NC_014774	TGA	2	6	543232	543237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122250
13034	NC_014774	CAG	2	6	543261	543266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315122250
13035	NC_014774	T	6	6	543283	543288	0 %	100 %	0 %	0 %	315122250
13036	NC_014774	AT	3	6	543306	543311	50 %	50 %	0 %	0 %	315122250
13037	NC_014774	GAA	2	6	543331	543336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014774	TAA	2	6	543369	543374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_014774	TAA	2	6	543395	543400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_014774	AGG	2	6	543416	543421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_014774	TCT	2	6	543471	543476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315122251
13042	NC_014774	GA	3	6	543494	543499	50 %	0 %	50 %	0 %	315122251
13043	NC_014774	GTT	2	6	543564	543569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315122251
13044	NC_014774	TAT	2	6	543594	543599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315122251
13045	NC_014774	GT	3	6	543756	543761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_014774	CATC	2	8	543764	543771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_014774	TAA	2	6	543841	543846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_014774	T	6	6	543855	543860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_014774	T	6	6	543874	543879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_014774	ATT	2	6	543933	543938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_014774	TTAT	2	8	543995	544002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_014774	T	6	6	544014	544019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_014774	TAA	2	6	544036	544041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_014774	CTT	2	6	544053	544058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_014774	GT	3	6	544078	544083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_014774	T	6	6	544101	544106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_014774	ATG	2	6	544177	544182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122252
13058	NC_014774	TGT	2	6	544190	544195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315122252
13059	NC_014774	GTT	2	6	544234	544239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315122252
13060	NC_014774	TTA	2	6	544259	544264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315122252
13061	NC_014774	GT	3	6	544281	544286	0 %	50 %	50 %	0 %	315122252
13062	NC_014774	TA	4	8	544314	544321	50 %	50 %	0 %	0 %	315122252
13063	NC_014774	T	6	6	544355	544360	0 %	100 %	0 %	0 %	315122252
13064	NC_014774	TAG	2	6	544364	544369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122252
13065	NC_014774	T	7	7	544374	544380	0 %	100 %	0 %	0 %	315122252
13066	NC_014774	ATCC	2	8	544432	544439	25 %	25 %	0 %	50 %	315122252
13067	NC_014774	TTCCT	2	10	544470	544479	0 %	60 %	0 %	40 %	315122252
13068	NC_014774	T	7	7	544496	544502	0 %	100 %	0 %	0 %	315122252
13069	NC_014774	AGA	2	6	544608	544613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315122252
13070	NC_014774	TAG	2	6	544643	544648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122252
13071	NC_014774	TGG	2	6	544671	544676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315122252
13072	NC_014774	TAT	2	6	544677	544682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315122252
13073	NC_014774	AT	3	6	544717	544722	50 %	50 %	0 %	0 %	315122252
13074	NC_014774	T	6	6	544752	544757	0 %	100 %	0 %	0 %	315122252
13075	NC_014774	GATG	2	8	544775	544782	25 %	25 %	50 %	0 %	315122252
13076	NC_014774	ATGTTT	2	12	544784	544795	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315122252
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13078	NC_014774	GTA	2	6	545069	545074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122252
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13080	NC_014774	CTC	2	6	545117	545122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315122252
13081	NC_014774	TGA	2	6	545123	545128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315122252
13082	NC_014774	ATTA	2	8	545130	545137	50 %	50 %	0 %	0 %	315122252
13083	NC_014774	AGG	3	9	545139	545147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315122252
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13088	NC_014774	TGTT	2	8	545417	545424	0 %	75 %	25 %	0 %	315122252
13089	NC_014774	TAT	2	6	545445	545450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315122252
13090	NC_014774	T	6	6	545454	545459	0 %	100 %	0 %	0 %	315122252
13091	NC_014774	ATGT	2	8	545494	545501	25 %	50 %	25 %	0 %	315122252
13092	NC_014774	ATAA	2	8	545612	545619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13094	NC_014774	TTAAT	2	10	545647	545656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_014774	TAT	2	6	545682	545687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_014774	T	6	6	545692	545697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_014774	TAA	2	6	545804	545809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_014774	ATT	2	6	545828	545833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_014774	T	6	6	545863	545868	0 %	100 %	0 %	0 %	315122253
13100	NC_014774	CTT	2	6	545869	545874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315122253
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13103	NC_014774	TCT	2	6	545952	545957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315122253
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13105	NC_014774	G	7	7	545997	546003	0 %	0 %	100 %	0 %	315122253
13106	NC_014774	TGC	2	6	546007	546012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315122253
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13109	NC_014774	TGC	2	6	546260	546265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315122253
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13112	NC_014774	T	6	6	546469	546474	0 %	100 %	0 %	0 %	315122253
13113	NC_014774	ATTA	2	8	546644	546651	50 %	50 %	0 %	0 %	315122253
13114	NC_014774	AGA	2	6	546666	546671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315122253
13115	NC_014774	ATC	2	6	546741	546746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_014774	TTA	2	6	546752	546757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_014774	GAT	2	6	546766	546771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_014774	TA	3	6	546782	546787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_014774	AGAAT	2	10	546796	546805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_014774	T	6	6	546822	546827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_014774	TAC	2	6	546862	546867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_014774	TTA	2	6	546910	546915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_014774	ACG	2	6	546998	547003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315122254
13124	NC_014774	TTTC	2	8	547010	547017	0 %	75 %	0 %	25 %	315122254
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