MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 66536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_014720	GCA	2	6	2314219	2314224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312623165
54002	NC_014720	T	6	6	2314232	2314237	0 %	100 %	0 %	0 %	312623165
54003	NC_014720	T	7	7	2314305	2314311	0 %	100 %	0 %	0 %	312623165
54004	NC_014720	TC	3	6	2314322	2314327	0 %	50 %	0 %	50 %	312623165
54005	NC_014720	CTTT	2	8	2314375	2314382	0 %	75 %	0 %	25 %	312623165
54006	NC_014720	T	6	6	2314380	2314385	0 %	100 %	0 %	0 %	312623165
54007	NC_014720	TTC	2	6	2314530	2314535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623165
54008	NC_014720	TGC	2	6	2314599	2314604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623165
54009	NC_014720	TTC	2	6	2314605	2314610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623165
54010	NC_014720	TCAT	2	8	2314657	2314664	25 %	50 %	0 %	25 %	312623165
54011	NC_014720	TTC	2	6	2314687	2314692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623165
54012	NC_014720	ATA	2	6	2314710	2314715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623165
54013	NC_014720	CAG	2	6	2314724	2314729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312623165
54014	NC_014720	GTGC	2	8	2314730	2314737	0 %	25 %	50 %	25 %	312623165
54015	NC_014720	GC	3	6	2314776	2314781	0 %	0 %	50 %	50 %	312623165
54016	NC_014720	ATA	2	6	2314785	2314790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623165
54017	NC_014720	GC	3	6	2314798	2314803	0 %	0 %	50 %	50 %	312623165
54018	NC_014720	TTG	2	6	2314823	2314828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623165
54019	NC_014720	A	6	6	2314882	2314887	100 %	0 %	0 %	0 %	312623165
54020	NC_014720	CAC	2	6	2314909	2314914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54021	NC_014720	TCT	2	6	2314918	2314923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54022	NC_014720	AAT	2	6	2314956	2314961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623166
54023	NC_014720	ACA	2	6	2315069	2315074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623166
54024	NC_014720	TCA	2	6	2315207	2315212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623166
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54026	NC_014720	CATC	2	8	2315274	2315281	25 %	25 %	0 %	50 %	312623166
54027	NC_014720	CA	3	6	2315289	2315294	50 %	0 %	0 %	50 %	312623166
54028	NC_014720	TCA	2	6	2315349	2315354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623166
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54031	NC_014720	ATTTCG	2	12	2315423	2315434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312623166
54032	NC_014720	TAGA	2	8	2315435	2315442	50 %	25 %	25 %	0 %	312623166
54033	NC_014720	GTG	2	6	2315652	2315657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312623166
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54036	NC_014720	AT	3	6	2315765	2315770	50 %	50 %	0 %	0 %	312623166
54037	NC_014720	TGGTT	2	10	2315777	2315786	0 %	60 %	40 %	0 %	312623166
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54042	NC_014720	TC	3	6	2315918	2315923	0 %	50 %	0 %	50 %	312623166
54043	NC_014720	TGT	2	6	2315986	2315991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623166
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54051	NC_014720	TG	3	6	2316452	2316457	0 %	50 %	50 %	0 %	312623167
54052	NC_014720	AT	3	6	2316488	2316493	50 %	50 %	0 %	0 %	312623167
54053	NC_014720	TCAAGC	2	12	2316520	2316531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312623167
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54059	NC_014720	A	6	6	2316795	2316800	100 %	0 %	0 %	0 %	312623167
54060	NC_014720	GTT	2	6	2316826	2316831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623167
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54062	NC_014720	ATGT	2	8	2316898	2316905	25 %	50 %	25 %	0 %	312623167
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54073	NC_014720	CTG	2	6	2317311	2317316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623167
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54082	NC_014720	TG	3	6	2317617	2317622	0 %	50 %	50 %	0 %	312623167
54083	NC_014720	TTC	2	6	2317632	2317637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623167
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54090	NC_014720	CAGC	2	8	2318022	2318029	25 %	0 %	25 %	50 %	312623168
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54101	NC_014720	T	6	6	2318444	2318449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54102	NC_014720	TTTTCA	2	12	2318700	2318711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312623170
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54115	NC_014720	CAC	2	6	2319031	2319036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312623170
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54117	NC_014720	CAA	2	6	2319166	2319171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623170
54118	NC_014720	GTT	2	6	2319219	2319224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623170
54119	NC_014720	ACC	2	6	2319239	2319244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312623170
54120	NC_014720	CCT	2	6	2319282	2319287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54121	NC_014720	TTG	2	6	2319304	2319309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54122	NC_014720	T	7	7	2319358	2319364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54123	NC_014720	CTA	2	6	2319395	2319400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54124	NC_014720	TTC	2	6	2319432	2319437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54125	NC_014720	AAG	2	6	2319453	2319458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54126	NC_014720	CAG	2	6	2319488	2319493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54127	NC_014720	ATGGCA	2	12	2319524	2319535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54128	NC_014720	AC	3	6	2319544	2319549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54129	NC_014720	T	6	6	2319557	2319562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54130	NC_014720	AGGCA	2	10	2319580	2319589	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54131	NC_014720	TTA	2	6	2319598	2319603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54132	NC_014720	CTG	2	6	2319626	2319631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54133	NC_014720	CAA	2	6	2319783	2319788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623171
54134	NC_014720	GTA	2	6	2319868	2319873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623171
54135	NC_014720	TTC	2	6	2319879	2319884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623171
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54137	NC_014720	ACTT	2	8	2320049	2320056	25 %	50 %	0 %	25 %	312623172
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54139	NC_014720	ATT	2	6	2320169	2320174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312623172
54140	NC_014720	GTT	2	6	2320190	2320195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623172
54141	NC_014720	CCA	2	6	2320259	2320264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312623172
54142	NC_014720	TCC	2	6	2320273	2320278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312623172
54143	NC_014720	ATC	2	6	2320354	2320359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623172
54144	NC_014720	T	6	6	2320369	2320374	0 %	100 %	0 %	0 %	312623172
54145	NC_014720	ACA	2	6	2320394	2320399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623172
54146	NC_014720	TAT	2	6	2320423	2320428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312623172
54147	NC_014720	CTG	2	6	2320461	2320466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623172
54148	NC_014720	CAA	2	6	2320473	2320478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623172
54149	NC_014720	T	6	6	2320519	2320524	0 %	100 %	0 %	0 %	312623172
54150	NC_014720	TCAT	2	8	2320610	2320617	25 %	50 %	0 %	25 %	312623172
54151	NC_014720	ACCA	2	8	2320650	2320657	50 %	0 %	0 %	50 %	312623172
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54153	NC_014720	ATTT	2	8	2320714	2320721	25 %	75 %	0 %	0 %	312623172
54154	NC_014720	TGC	2	6	2320762	2320767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623172
54155	NC_014720	TGC	2	6	2320777	2320782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623172
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54159	NC_014720	TTG	2	6	2320962	2320967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623172
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54162	NC_014720	ATAG	2	8	2321018	2321025	50 %	25 %	25 %	0 %	312623172
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54169	NC_014720	TAA	2	6	2321522	2321527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54170	NC_014720	AAGAA	2	10	2321541	2321550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54171	NC_014720	A	6	6	2321549	2321554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54172	NC_014720	A	7	7	2321605	2321611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54173	NC_014720	CA	3	6	2321612	2321617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54174	NC_014720	AAAG	2	8	2321618	2321625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54175	NC_014720	CCA	2	6	2321695	2321700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312623173
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54200	NC_014720	A	7	7	2322601	2322607	100 %	0 %	0 %	0 %	312623173
54201	NC_014720	GCA	2	6	2322617	2322622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312623173
54202	NC_014720	GA	3	6	2322623	2322628	50 %	0 %	50 %	0 %	312623173
54203	NC_014720	GA	3	6	2322788	2322793	50 %	0 %	50 %	0 %	312623173
54204	NC_014720	ATT	2	6	2322895	2322900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54205	NC_014720	AT	3	6	2322915	2322920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54206	NC_014720	ACCC	2	8	2322970	2322977	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54207	NC_014720	AGA	2	6	2323008	2323013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54208	NC_014720	GT	4	8	2323028	2323035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54209	NC_014720	A	6	6	2323060	2323065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54210	NC_014720	GCCTTT	2	12	2323090	2323101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54211	NC_014720	CTTT	3	12	2323098	2323109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54212	NC_014720	TTC	2	6	2323135	2323140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54213	NC_014720	ATTTT	2	10	2323170	2323179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54214	NC_014720	TA	3	6	2323222	2323227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54215	NC_014720	AT	4	8	2323235	2323242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54216	NC_014720	ATT	2	6	2323293	2323298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54217	NC_014720	ATA	2	6	2323304	2323309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54218	NC_014720	AATTA	2	10	2323376	2323385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54219	NC_014720	T	6	6	2323386	2323391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54220	NC_014720	TAAA	2	8	2323412	2323419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54221	NC_014720	A	6	6	2323429	2323434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54222	NC_014720	ATG	2	6	2323445	2323450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623174
54223	NC_014720	A	7	7	2323516	2323522	100 %	0 %	0 %	0 %	312623174
54224	NC_014720	AGG	2	6	2323534	2323539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312623174
54225	NC_014720	GCATTG	2	12	2323544	2323555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312623174
54226	NC_014720	T	7	7	2323588	2323594	0 %	100 %	0 %	0 %	312623174
54227	NC_014720	AAG	2	6	2323599	2323604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312623174
54228	NC_014720	A	6	6	2323611	2323616	100 %	0 %	0 %	0 %	312623174
54229	NC_014720	AT	3	6	2323627	2323632	50 %	50 %	0 %	0 %	312623174
54230	NC_014720	CTA	2	6	2323707	2323712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623174
54231	NC_014720	TTGA	2	8	2323754	2323761	25 %	50 %	25 %	0 %	312623174
54232	NC_014720	TGA	2	6	2323836	2323841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623174
54233	NC_014720	AGA	2	6	2323859	2323864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312623174
54234	NC_014720	A	6	6	2323904	2323909	100 %	0 %	0 %	0 %	312623174
54235	NC_014720	AT	3	6	2323927	2323932	50 %	50 %	0 %	0 %	312623174
54236	NC_014720	T	6	6	2323977	2323982	0 %	100 %	0 %	0 %	312623174
54237	NC_014720	AAC	2	6	2324001	2324006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623174
54238	NC_014720	AGA	2	6	2324017	2324022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312623174
54239	NC_014720	TA	3	6	2324129	2324134	50 %	50 %	0 %	0 %	312623174
54240	NC_014720	TAA	3	9	2324234	2324242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623175
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54244	NC_014720	AGCC	2	8	2324487	2324494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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54272	NC_014720	AT	3	6	2325983	2325988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54361	NC_014720	TCT	2	6	2329780	2329785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623180
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54375	NC_014720	CT	3	6	2330165	2330170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54460	NC_014720	A	6	6	2333822	2333827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54461	NC_014720	AT	3	6	2333831	2333836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54462	NC_014720	ATT	2	6	2333876	2333881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54463	NC_014720	TATT	2	8	2333906	2333913	25 %	75 %	0 %	0 %	312623187
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54471	NC_014720	GC	3	6	2334618	2334623	0 %	0 %	50 %	50 %	312623187
54472	NC_014720	CAAT	2	8	2334871	2334878	50 %	25 %	0 %	25 %	312623187
54473	NC_014720	CAA	2	6	2334895	2334900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623187
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