MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 66536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_014720	TGCA	2	8	2269909	2269916	25 %	25 %	25 %	25 %	312623126
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53004	NC_014720	AT	3	6	2269979	2269984	50 %	50 %	0 %	0 %	312623126
53005	NC_014720	GAA	2	6	2269991	2269996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312623126
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53118	NC_014720	A	6	6	2275722	2275727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_014720	TGCC	2	8	2275753	2275760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53120	NC_014720	ATGA	2	8	2275861	2275868	50 %	25 %	25 %	0 %	312623130
53121	NC_014720	TCA	2	6	2275884	2275889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623130
53122	NC_014720	CAA	2	6	2275906	2275911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312623130
53123	NC_014720	TTTC	2	8	2275936	2275943	0 %	75 %	0 %	25 %	312623130
53124	NC_014720	CAT	2	6	2275981	2275986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623130
53125	NC_014720	ATC	2	6	2275994	2275999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623130
53126	NC_014720	CAT	2	6	2276137	2276142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623130
53127	NC_014720	TCTG	2	8	2276190	2276197	0 %	50 %	25 %	25 %	312623130
53128	NC_014720	GC	3	6	2276201	2276206	0 %	0 %	50 %	50 %	312623130
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53134	NC_014720	CTT	2	6	2276433	2276438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53135	NC_014720	GCT	2	6	2276459	2276464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623131
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53157	NC_014720	GATTTT	2	12	2277430	2277441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53158	NC_014720	CAA	2	6	2277449	2277454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53159	NC_014720	ATA	2	6	2277506	2277511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53160	NC_014720	T	6	6	2277532	2277537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53161	NC_014720	T	8	8	2277555	2277562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53162	NC_014720	A	7	7	2277572	2277578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53163	NC_014720	ATA	2	6	2277586	2277591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53187	NC_014720	CT	3	6	2278501	2278506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53188	NC_014720	TAAAG	2	10	2278514	2278523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53189	NC_014720	TCT	2	6	2278537	2278542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623134
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53218	NC_014720	AGT	2	6	2280513	2280518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623134
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53223	NC_014720	CTT	2	6	2280661	2280666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53224	NC_014720	ACT	2	6	2280674	2280679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53225	NC_014720	AT	3	6	2280680	2280685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53226	NC_014720	ATT	2	6	2280693	2280698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53227	NC_014720	AT	3	6	2280712	2280717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53228	NC_014720	A	6	6	2280753	2280758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53229	NC_014720	T	6	6	2280759	2280764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53230	NC_014720	A	6	6	2280765	2280770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53231	NC_014720	AGGC	2	8	2280775	2280782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53232	NC_014720	A	6	6	2280790	2280795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53233	NC_014720	TGCC	2	8	2280800	2280807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53234	NC_014720	ACTTCC	2	12	2280914	2280925	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312623135
53235	NC_014720	TTG	2	6	2280938	2280943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623135
53236	NC_014720	CA	3	6	2280958	2280963	50 %	0 %	0 %	50 %	312623135
53237	NC_014720	T	6	6	2280993	2280998	0 %	100 %	0 %	0 %	312623135
53238	NC_014720	ACTG	2	8	2281012	2281019	25 %	25 %	25 %	25 %	312623135
53239	NC_014720	AC	3	6	2281037	2281042	50 %	0 %	0 %	50 %	312623135
53240	NC_014720	TAAA	2	8	2281056	2281063	75 %	25 %	0 %	0 %	312623135
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53254	NC_014720	T	6	6	2281538	2281543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53255	NC_014720	GGTA	2	8	2281552	2281559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53258	NC_014720	AGTTT	2	10	2281634	2281643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53259	NC_014720	ATA	2	6	2281766	2281771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53260	NC_014720	TAA	2	6	2281773	2281778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53261	NC_014720	GAGG	2	8	2281800	2281807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53262	NC_014720	AGAA	2	8	2281844	2281851	75 %	0 %	25 %	0 %	312623136
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53337	NC_014720	T	6	6	2285313	2285318	0 %	100 %	0 %	0 %	312623140
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53342	NC_014720	T	6	6	2285485	2285490	0 %	100 %	0 %	0 %	312623140
53343	NC_014720	ATTT	2	8	2285517	2285524	25 %	75 %	0 %	0 %	312623140
53344	NC_014720	TTC	2	6	2285530	2285535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623140
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53348	NC_014720	TCT	2	6	2285735	2285740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623140
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53350	NC_014720	T	6	6	2285816	2285821	0 %	100 %	0 %	0 %	312623140
53351	NC_014720	TTTC	2	8	2285835	2285842	0 %	75 %	0 %	25 %	312623140
53352	NC_014720	T	6	6	2286010	2286015	0 %	100 %	0 %	0 %	312623140
53353	NC_014720	AAT	2	6	2286082	2286087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623140
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53355	NC_014720	TGA	2	6	2286125	2286130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623140
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53357	NC_014720	TTC	2	6	2286187	2286192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623140
53358	NC_014720	TAA	2	6	2286205	2286210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312623140
53359	NC_014720	CTT	2	6	2286226	2286231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623140
53360	NC_014720	TCCC	2	8	2286293	2286300	0 %	25 %	0 %	75 %	312623141
53361	NC_014720	ATC	2	6	2286316	2286321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623141
53362	NC_014720	TTCT	2	8	2286338	2286345	0 %	75 %	0 %	25 %	312623141
53363	NC_014720	ATTT	2	8	2286470	2286477	25 %	75 %	0 %	0 %	312623141
53364	NC_014720	TAAA	2	8	2286504	2286511	75 %	25 %	0 %	0 %	312623141
53365	NC_014720	TGA	2	6	2286649	2286654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623141
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53368	NC_014720	AGT	2	6	2286698	2286703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312623141
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53370	NC_014720	CAT	2	6	2286717	2286722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623141
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53383	NC_014720	ATCT	2	8	2287224	2287231	25 %	50 %	0 %	25 %	312623141
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53385	NC_014720	AACT	2	8	2287251	2287258	50 %	25 %	0 %	25 %	312623141
53386	NC_014720	AGTG	2	8	2287326	2287333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53387	NC_014720	ATGG	2	8	2287372	2287379	25 %	25 %	50 %	0 %	312623142
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53407	NC_014720	AT	3	6	2288281	2288286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53408	NC_014720	CTT	2	6	2288370	2288375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623143
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53438	NC_014720	TATTT	2	10	2289733	2289742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53439	NC_014720	ATCT	2	8	2289749	2289756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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53477	NC_014720	GTC	2	6	2291338	2291343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623146
53478	NC_014720	ACATA	2	10	2291382	2291391	60 %	20 %	0 %	20 %	312623146
53479	NC_014720	TCT	2	6	2291403	2291408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623146
53480	NC_014720	TTG	2	6	2291429	2291434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312623146
53481	NC_014720	TC	3	6	2291458	2291463	0 %	50 %	0 %	50 %	312623146
53482	NC_014720	ATT	2	6	2291495	2291500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312623146
53483	NC_014720	CAT	2	6	2291511	2291516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312623146
53484	NC_014720	CTT	2	6	2291591	2291596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623146
53485	NC_014720	CCA	2	6	2291613	2291618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312623146
53486	NC_014720	ATAC	2	8	2291682	2291689	50 %	25 %	0 %	25 %	312623146
53487	NC_014720	TGTT	2	8	2291715	2291722	0 %	75 %	25 %	0 %	312623146
53488	NC_014720	AT	3	6	2291755	2291760	50 %	50 %	0 %	0 %	312623146
53489	NC_014720	TGC	2	6	2291761	2291766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312623146
53490	NC_014720	CTT	2	6	2291783	2291788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312623146
53491	NC_014720	CATT	2	8	2291792	2291799	25 %	50 %	0 %	25 %	312623146
53492	NC_014720	GTCA	2	8	2291827	2291834	25 %	25 %	25 %	25 %	312623146
53493	NC_014720	T	7	7	2291878	2291884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_014720	A	6	6	2291950	2291955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53495	NC_014720	ACAA	2	8	2292008	2292015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53496	NC_014720	CCT	2	6	2292021	2292026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53497	NC_014720	AGG	2	6	2292035	2292040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53498	NC_014720	TTTCT	2	10	2292046	2292055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53499	NC_014720	T	6	6	2292060	2292065	0 %	100 %	0 %	0 %	312623147
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