MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_014652	GTC	2	6	1996779	1996784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128162
46003	NC_014652	ACC	2	6	1996794	1996799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128162
46004	NC_014652	CCTT	2	8	1996845	1996852	0 %	50 %	0 %	50 %	312128162
46005	NC_014652	AAT	2	6	1996862	1996867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128162
46006	NC_014652	TC	3	6	1996878	1996883	0 %	50 %	0 %	50 %	312128162
46007	NC_014652	AAT	2	6	1996905	1996910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128162
46008	NC_014652	T	6	6	1996924	1996929	0 %	100 %	0 %	0 %	312128162
46009	NC_014652	GTT	2	6	1996947	1996952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128162
46010	NC_014652	TTTCT	2	10	1996991	1997000	0 %	80 %	0 %	20 %	312128162
46011	NC_014652	GCA	2	6	1997026	1997031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128162
46012	NC_014652	CTT	2	6	1997102	1997107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128162
46013	NC_014652	TC	3	6	1997310	1997315	0 %	50 %	0 %	50 %	312128162
46014	NC_014652	TGA	2	6	1997317	1997322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128162
46015	NC_014652	T	6	6	1997355	1997360	0 %	100 %	0 %	0 %	312128162
46016	NC_014652	TACA	2	8	1997367	1997374	50 %	25 %	0 %	25 %	312128162
46017	NC_014652	ACA	2	6	1997380	1997385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128162
46018	NC_014652	CAA	2	6	1997387	1997392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128162
46019	NC_014652	CAT	2	6	1997435	1997440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128162
46020	NC_014652	T	6	6	1997454	1997459	0 %	100 %	0 %	0 %	312128162
46021	NC_014652	AATTT	2	10	1997465	1997474	40 %	60 %	0 %	0 %	312128162
46022	NC_014652	T	6	6	1997487	1997492	0 %	100 %	0 %	0 %	312128162
46023	NC_014652	TAA	2	6	1997513	1997518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128162
46024	NC_014652	AAT	2	6	1997550	1997555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128163
46025	NC_014652	GCATA	2	10	1997569	1997578	40 %	20 %	20 %	20 %	312128163
46026	NC_014652	CTGT	2	8	1997580	1997587	0 %	50 %	25 %	25 %	312128163
46027	NC_014652	TA	3	6	1997597	1997602	50 %	50 %	0 %	0 %	312128163
46028	NC_014652	CTA	2	6	1997605	1997610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128163
46029	NC_014652	AT	3	6	1997706	1997711	50 %	50 %	0 %	0 %	312128163
46030	NC_014652	T	6	6	1997730	1997735	0 %	100 %	0 %	0 %	312128163
46031	NC_014652	GCATA	2	10	1997785	1997794	40 %	20 %	20 %	20 %	312128163
46032	NC_014652	A	6	6	1997794	1997799	100 %	0 %	0 %	0 %	312128163
46033	NC_014652	T	6	6	1997838	1997843	0 %	100 %	0 %	0 %	312128163
46034	NC_014652	TAAT	2	8	1997854	1997861	50 %	50 %	0 %	0 %	312128163
46035	NC_014652	TC	5	10	1997870	1997879	0 %	50 %	0 %	50 %	312128163
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46038	NC_014652	CAA	2	6	1998103	1998108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128163
46039	NC_014652	TG	3	6	1998127	1998132	0 %	50 %	50 %	0 %	312128163
46040	NC_014652	GT	3	6	1998187	1998192	0 %	50 %	50 %	0 %	312128163
46041	NC_014652	GT	3	6	1998290	1998295	0 %	50 %	50 %	0 %	312128163
46042	NC_014652	CCT	2	6	1998356	1998361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312128163
46043	NC_014652	TAT	2	6	1998377	1998382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128163
46044	NC_014652	TCTATC	2	12	1998383	1998394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312128163
46045	NC_014652	TTCTG	2	10	1998423	1998432	0 %	60 %	20 %	20 %	312128163
46046	NC_014652	T	6	6	1998453	1998458	0 %	100 %	0 %	0 %	312128163
46047	NC_014652	TTC	2	6	1998488	1998493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128163
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46049	NC_014652	CT	3	6	1998509	1998514	0 %	50 %	0 %	50 %	312128163
46050	NC_014652	T	6	6	1998552	1998557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46051	NC_014652	TTTA	2	8	1998564	1998571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46052	NC_014652	TTA	2	6	1998580	1998585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46053	NC_014652	CTT	2	6	1998619	1998624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46054	NC_014652	AGA	2	6	1998644	1998649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46055	NC_014652	TCC	2	6	1998662	1998667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46056	NC_014652	CTT	2	6	1998729	1998734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128164
46057	NC_014652	TAT	2	6	1998788	1998793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128164
46058	NC_014652	TCT	2	6	1998807	1998812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128164
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46088	NC_014652	TTTCT	2	10	1999991	2000000	0 %	80 %	0 %	20 %	312128164
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46091	NC_014652	CT	3	6	2000159	2000164	0 %	50 %	0 %	50 %	312128165
46092	NC_014652	TATT	2	8	2000175	2000182	25 %	75 %	0 %	0 %	312128165
46093	NC_014652	T	6	6	2000186	2000191	0 %	100 %	0 %	0 %	312128165
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46101	NC_014652	AAGAA	2	10	2000477	2000486	80 %	0 %	20 %	0 %	312128165
46102	NC_014652	AT	3	6	2000566	2000571	50 %	50 %	0 %	0 %	312128165
46103	NC_014652	CAC	2	6	2000586	2000591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128165
46104	NC_014652	T	6	6	2000645	2000650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46105	NC_014652	A	6	6	2000651	2000656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46106	NC_014652	TAAA	2	8	2000738	2000745	75 %	25 %	0 %	0 %	312128166
46107	NC_014652	TA	3	6	2000779	2000784	50 %	50 %	0 %	0 %	312128166
46108	NC_014652	ATC	2	6	2000791	2000796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128166
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46110	NC_014652	TC	3	6	2001007	2001012	0 %	50 %	0 %	50 %	312128166
46111	NC_014652	ATA	2	6	2001058	2001063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128166
46112	NC_014652	T	6	6	2001120	2001125	0 %	100 %	0 %	0 %	312128166
46113	NC_014652	ATCA	2	8	2001136	2001143	50 %	25 %	0 %	25 %	312128166
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46116	NC_014652	TTTCCT	2	12	2001360	2001371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128166
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46120	NC_014652	TCCA	2	8	2001475	2001482	25 %	25 %	0 %	50 %	312128166
46121	NC_014652	CT	3	6	2001559	2001564	0 %	50 %	0 %	50 %	312128166
46122	NC_014652	CT	3	6	2001752	2001757	0 %	50 %	0 %	50 %	312128166
46123	NC_014652	CAT	3	9	2001801	2001809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128166
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46132	NC_014652	T	6	6	2002150	2002155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46133	NC_014652	ATT	2	6	2002179	2002184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46135	NC_014652	GGGA	2	8	2002255	2002262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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46326	NC_014652	TGTT	2	8	2011291	2011298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46327	NC_014652	T	6	6	2011297	2011302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46344	NC_014652	T	6	6	2012195	2012200	0 %	100 %	0 %	0 %	312128173
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46348	NC_014652	T	6	6	2012608	2012613	0 %	100 %	0 %	0 %	312128174
46349	NC_014652	CAA	2	6	2012654	2012659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128174
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46352	NC_014652	T	7	7	2012827	2012833	0 %	100 %	0 %	0 %	312128174
46353	NC_014652	CT	3	6	2012854	2012859	0 %	50 %	0 %	50 %	312128174
46354	NC_014652	AACA	2	8	2012900	2012907	75 %	0 %	0 %	25 %	312128174
46355	NC_014652	AC	3	6	2012913	2012918	50 %	0 %	0 %	50 %	312128174
46356	NC_014652	TCT	2	6	2012995	2013000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128175
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46358	NC_014652	CAA	2	6	2013032	2013037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128175
46359	NC_014652	TCT	2	6	2013088	2013093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128175
46360	NC_014652	TA	3	6	2013124	2013129	50 %	50 %	0 %	0 %	312128175
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46472	NC_014652	TGC	2	6	2018192	2018197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128179
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46474	NC_014652	TCT	2	6	2018273	2018278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128179
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