MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43004	NC_014652	TTA	2	6	1866425	1866430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128040
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43013	NC_014652	TG	3	6	1867087	1867092	0 %	50 %	50 %	0 %	312128041
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43112	NC_014652	TTTG	2	8	1871324	1871331	0 %	75 %	25 %	0 %	312128043
43113	NC_014652	TCAA	2	8	1871386	1871393	50 %	25 %	0 %	25 %	312128043
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43117	NC_014652	CTC	2	6	1871735	1871740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43118	NC_014652	AAAT	2	8	1871795	1871802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43119	NC_014652	T	6	6	1871867	1871872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43120	NC_014652	TGA	2	6	1871879	1871884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43121	NC_014652	GCTAA	2	10	1871920	1871929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43122	NC_014652	T	6	6	1871940	1871945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43123	NC_014652	TCA	2	6	1871948	1871953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43124	NC_014652	T	6	6	1871955	1871960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43125	NC_014652	ATA	2	6	1871982	1871987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43129	NC_014652	TAA	2	6	1872112	1872117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128044
43130	NC_014652	A	6	6	1872162	1872167	100 %	0 %	0 %	0 %	312128044
43131	NC_014652	A	6	6	1872242	1872247	100 %	0 %	0 %	0 %	312128044
43132	NC_014652	TGA	2	6	1872290	1872295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128044
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43153	NC_014652	AT	3	6	1873009	1873014	50 %	50 %	0 %	0 %	312128044
43154	NC_014652	GAAA	2	8	1873085	1873092	75 %	0 %	25 %	0 %	312128044
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43159	NC_014652	GTA	2	6	1873158	1873163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43231	NC_014652	A	6	6	1876336	1876341	100 %	0 %	0 %	0 %	312128047
43232	NC_014652	T	6	6	1876357	1876362	0 %	100 %	0 %	0 %	312128048
43233	NC_014652	TC	3	6	1876387	1876392	0 %	50 %	0 %	50 %	312128048
43234	NC_014652	GGC	2	6	1876413	1876418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312128048
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43237	NC_014652	CAA	2	6	1876663	1876668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128048
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43239	NC_014652	T	6	6	1876782	1876787	0 %	100 %	0 %	0 %	312128048
43240	NC_014652	CCGCC	2	10	1876957	1876966	0 %	0 %	20 %	80 %	312128048
43241	NC_014652	CTT	2	6	1876987	1876992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128048
43242	NC_014652	TCT	2	6	1877025	1877030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128048
43243	NC_014652	GTA	2	6	1877146	1877151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128049
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43245	NC_014652	TCCT	2	8	1877185	1877192	0 %	50 %	0 %	50 %	312128049
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43264	NC_014652	TGTT	2	8	1878589	1878596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43265	NC_014652	TAT	2	6	1878599	1878604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43326	NC_014652	CCTT	2	8	1880996	1881003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43327	NC_014652	T	6	6	1881051	1881056	0 %	100 %	0 %	0 %	312128054
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43333	NC_014652	T	7	7	1881424	1881430	0 %	100 %	0 %	0 %	312128054
43334	NC_014652	TTTG	2	8	1881442	1881449	0 %	75 %	25 %	0 %	312128054
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43340	NC_014652	A	6	6	1881768	1881773	100 %	0 %	0 %	0 %	312128054
43341	NC_014652	TTG	2	6	1881811	1881816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128054
43342	NC_014652	A	6	6	1881947	1881952	100 %	0 %	0 %	0 %	312128054
43343	NC_014652	A	8	8	1881964	1881971	100 %	0 %	0 %	0 %	312128054
43344	NC_014652	ACC	2	6	1881993	1881998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43345	NC_014652	AAG	2	6	1882030	1882035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43346	NC_014652	GGC	2	6	1882051	1882056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43347	NC_014652	A	7	7	1882078	1882084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43348	NC_014652	ATCTT	2	10	1882093	1882102	20 %	60 %	0 %	20 %	312128055
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43350	NC_014652	CTGT	2	8	1882170	1882177	0 %	50 %	25 %	25 %	312128055
43351	NC_014652	CTT	2	6	1882248	1882253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128055
43352	NC_014652	TTCC	2	8	1882350	1882357	0 %	50 %	0 %	50 %	312128055
43353	NC_014652	A	6	6	1882385	1882390	100 %	0 %	0 %	0 %	312128055
43354	NC_014652	CAC	2	6	1882395	1882400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128055
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43356	NC_014652	GCT	2	6	1882469	1882474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128055
43357	NC_014652	AT	3	6	1882478	1882483	50 %	50 %	0 %	0 %	312128055
43358	NC_014652	TCA	2	6	1882518	1882523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128055
43359	NC_014652	CAA	2	6	1882527	1882532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128055
43360	NC_014652	A	6	6	1882531	1882536	100 %	0 %	0 %	0 %	312128055
43361	NC_014652	GTT	2	6	1882607	1882612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128055
43362	NC_014652	TA	3	6	1882639	1882644	50 %	50 %	0 %	0 %	312128055
43363	NC_014652	A	6	6	1882840	1882845	100 %	0 %	0 %	0 %	312128055
43364	NC_014652	A	6	6	1882892	1882897	100 %	0 %	0 %	0 %	312128055
43365	NC_014652	AG	3	6	1882905	1882910	50 %	0 %	50 %	0 %	312128055
43366	NC_014652	ACC	2	6	1882915	1882920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128055
43367	NC_014652	TGAA	2	8	1882939	1882946	50 %	25 %	25 %	0 %	312128055
43368	NC_014652	GTCT	2	8	1882962	1882969	0 %	50 %	25 %	25 %	312128055
43369	NC_014652	T	6	6	1882990	1882995	0 %	100 %	0 %	0 %	312128055
43370	NC_014652	TGA	2	6	1883010	1883015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128055
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43372	NC_014652	AATA	2	8	1883147	1883154	75 %	25 %	0 %	0 %	312128056
43373	NC_014652	GAA	2	6	1883163	1883168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128056
43374	NC_014652	TAAT	2	8	1883242	1883249	50 %	50 %	0 %	0 %	312128056
43375	NC_014652	A	8	8	1883274	1883281	100 %	0 %	0 %	0 %	312128056
43376	NC_014652	TTG	2	6	1883370	1883375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128056
43377	NC_014652	TAA	2	6	1883393	1883398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128056
43378	NC_014652	AT	3	6	1883409	1883414	50 %	50 %	0 %	0 %	312128056
43379	NC_014652	A	6	6	1883417	1883422	100 %	0 %	0 %	0 %	312128056
43380	NC_014652	ATT	2	6	1883529	1883534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128056
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43383	NC_014652	AAG	2	6	1883603	1883608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128057
43384	NC_014652	ATT	2	6	1883642	1883647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128057
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43386	NC_014652	AT	3	6	1883740	1883745	50 %	50 %	0 %	0 %	312128057
43387	NC_014652	TCA	2	6	1883837	1883842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128057
43388	NC_014652	A	6	6	1883872	1883877	100 %	0 %	0 %	0 %	312128057
43389	NC_014652	CTT	2	6	1883879	1883884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128057
43390	NC_014652	AT	3	6	1883921	1883926	50 %	50 %	0 %	0 %	312128057
43391	NC_014652	CTT	2	6	1883931	1883936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128057
43392	NC_014652	CAT	2	6	1883952	1883957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128057
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43394	NC_014652	TA	3	6	1884091	1884096	50 %	50 %	0 %	0 %	312128057
43395	NC_014652	ATTG	2	8	1884157	1884164	25 %	50 %	25 %	0 %	312128057
43396	NC_014652	AAT	2	6	1884168	1884173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128057
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43398	NC_014652	T	8	8	1884245	1884252	0 %	100 %	0 %	0 %	312128057
43399	NC_014652	TTC	2	6	1884267	1884272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128057
43400	NC_014652	T	6	6	1884490	1884495	0 %	100 %	0 %	0 %	312128058
43401	NC_014652	TAA	2	6	1884500	1884505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128058
43402	NC_014652	TAAT	2	8	1884529	1884536	50 %	50 %	0 %	0 %	312128058
43403	NC_014652	TTC	2	6	1884579	1884584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128058
43404	NC_014652	AT	3	6	1884647	1884652	50 %	50 %	0 %	0 %	312128058
43405	NC_014652	TGC	2	6	1884653	1884658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128058
43406	NC_014652	ACA	2	6	1884667	1884672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128058
43407	NC_014652	TTG	2	6	1884703	1884708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128058
43408	NC_014652	CTT	2	6	1884752	1884757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128058
43409	NC_014652	TA	3	6	1884805	1884810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43410	NC_014652	CTAA	2	8	1884842	1884849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43411	NC_014652	A	6	6	1884848	1884853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43412	NC_014652	AGGA	2	8	1884874	1884881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43413	NC_014652	AG	3	6	1884946	1884951	50 %	0 %	50 %	0 %	312128059
43414	NC_014652	TAA	2	6	1884968	1884973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128059
43415	NC_014652	AAG	2	6	1885046	1885051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128059
43416	NC_014652	A	6	6	1885067	1885072	100 %	0 %	0 %	0 %	312128059
43417	NC_014652	TGG	2	6	1885098	1885103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312128059
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43419	NC_014652	TAA	3	9	1885262	1885270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128059
43420	NC_014652	AAT	2	6	1885417	1885422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128060
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43422	NC_014652	ATT	2	6	1885564	1885569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128060
43423	NC_014652	TGT	2	6	1885621	1885626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128060
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43425	NC_014652	AT	3	6	1885695	1885700	50 %	50 %	0 %	0 %	312128060
43426	NC_014652	AAG	2	6	1885702	1885707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128060
43427	NC_014652	TCAA	2	8	1885763	1885770	50 %	25 %	0 %	25 %	312128060
43428	NC_014652	CGCTT	2	10	1885774	1885783	0 %	40 %	20 %	40 %	312128060
43429	NC_014652	CTG	2	6	1885811	1885816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128060
43430	NC_014652	TTGA	2	8	1885820	1885827	25 %	50 %	25 %	0 %	312128060
43431	NC_014652	ATTTTC	2	12	1885846	1885857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312128060
43432	NC_014652	T	7	7	1885924	1885930	0 %	100 %	0 %	0 %	312128060
43433	NC_014652	A	7	7	1885961	1885967	100 %	0 %	0 %	0 %	312128060
43434	NC_014652	CTG	2	6	1885974	1885979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128060
43435	NC_014652	CTT	2	6	1886046	1886051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128060
43436	NC_014652	TCTAT	2	10	1886057	1886066	20 %	60 %	0 %	20 %	312128060
43437	NC_014652	CAA	2	6	1886076	1886081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128060
43438	NC_014652	TGT	2	6	1886094	1886099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128060
43439	NC_014652	GCA	2	6	1886132	1886137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128060
43440	NC_014652	CCT	2	6	1886337	1886342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312128061
43441	NC_014652	CTT	2	6	1886373	1886378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128061
43442	NC_014652	CTTTTT	2	12	1886384	1886395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312128061
43443	NC_014652	TCT	2	6	1886403	1886408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128061
43444	NC_014652	TCA	2	6	1886430	1886435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128061
43445	NC_014652	CT	3	6	1886444	1886449	0 %	50 %	0 %	50 %	312128061
43446	NC_014652	ACAG	2	8	1886473	1886480	50 %	0 %	25 %	25 %	312128061
43447	NC_014652	TGA	2	6	1886498	1886503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128061
43448	NC_014652	AGC	2	6	1886597	1886602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128061
43449	NC_014652	CTT	2	6	1886623	1886628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128061
43450	NC_014652	TTGG	2	8	1886687	1886694	0 %	50 %	50 %	0 %	312128061
43451	NC_014652	AAT	3	9	1886726	1886734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128061
43452	NC_014652	T	6	6	1886742	1886747	0 %	100 %	0 %	0 %	312128061
43453	NC_014652	AAATC	2	10	1886755	1886764	60 %	20 %	0 %	20 %	312128061
43454	NC_014652	TCA	2	6	1886772	1886777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128061
43455	NC_014652	CT	3	6	1886815	1886820	0 %	50 %	0 %	50 %	312128061
43456	NC_014652	CT	3	6	1886825	1886830	0 %	50 %	0 %	50 %	312128061
43457	NC_014652	TAA	2	6	1886944	1886949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128061
43458	NC_014652	AACC	2	8	1886973	1886980	50 %	0 %	0 %	50 %	312128061
43459	NC_014652	TGT	2	6	1886984	1886989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128061
43460	NC_014652	TATATT	2	12	1886990	1887001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128061
43461	NC_014652	TG	3	6	1887016	1887021	0 %	50 %	50 %	0 %	312128061
43462	NC_014652	TC	3	6	1887048	1887053	0 %	50 %	0 %	50 %	312128061
43463	NC_014652	A	6	6	1887054	1887059	100 %	0 %	0 %	0 %	312128061
43464	NC_014652	CCA	2	6	1887066	1887071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128061
43465	NC_014652	TCT	2	6	1887129	1887134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128061
43466	NC_014652	ATA	2	6	1887158	1887163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128061
43467	NC_014652	A	7	7	1887190	1887196	100 %	0 %	0 %	0 %	312128061
43468	NC_014652	TCA	2	6	1887262	1887267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43469	NC_014652	ATC	2	6	1887278	1887283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128062
43470	NC_014652	CCA	2	6	1887309	1887314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128062
43471	NC_014652	TA	3	6	1887337	1887342	50 %	50 %	0 %	0 %	312128062
43472	NC_014652	CTC	2	6	1887378	1887383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312128062
43473	NC_014652	TA	3	6	1887436	1887441	50 %	50 %	0 %	0 %	312128062
43474	NC_014652	CTC	2	6	1887442	1887447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312128062
43475	NC_014652	CTT	2	6	1887470	1887475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128062
43476	NC_014652	TCTTT	2	10	1887495	1887504	0 %	80 %	0 %	20 %	312128062
43477	NC_014652	AAAG	2	8	1887526	1887533	75 %	0 %	25 %	0 %	312128062
43478	NC_014652	A	7	7	1887539	1887545	100 %	0 %	0 %	0 %	312128062
43479	NC_014652	A	6	6	1887559	1887564	100 %	0 %	0 %	0 %	312128062
43480	NC_014652	T	6	6	1887760	1887765	0 %	100 %	0 %	0 %	312128062
43481	NC_014652	AAG	2	6	1887838	1887843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128062
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43485	NC_014652	CTTT	2	8	1888014	1888021	0 %	75 %	0 %	25 %	312128062
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