MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42504	NC_014652	AATG	2	8	1846113	1846120	50 %	25 %	25 %	0 %	312128026
42505	NC_014652	ATT	2	6	1846122	1846127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128026
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42625	NC_014652	TGA	2	6	1850807	1850812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128028
42626	NC_014652	CTTC	2	8	1850865	1850872	0 %	50 %	0 %	50 %	312128028
42627	NC_014652	CTT	2	6	1850911	1850916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128028
42628	NC_014652	CTTCT	2	10	1850986	1850995	0 %	60 %	0 %	40 %	312128028
42629	NC_014652	CT	3	6	1851026	1851031	0 %	50 %	0 %	50 %	312128028
42630	NC_014652	TA	3	6	1851069	1851074	50 %	50 %	0 %	0 %	312128028
42631	NC_014652	A	7	7	1851115	1851121	100 %	0 %	0 %	0 %	312128028
42632	NC_014652	CAT	2	6	1851154	1851159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128028
42633	NC_014652	CTA	2	6	1851165	1851170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128028
42634	NC_014652	TAG	2	6	1851213	1851218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42635	NC_014652	TTC	2	6	1851241	1851246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128029
42636	NC_014652	TCAA	2	8	1851263	1851270	50 %	25 %	0 %	25 %	312128029
42637	NC_014652	GTG	2	6	1851376	1851381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312128029
42638	NC_014652	A	6	6	1851436	1851441	100 %	0 %	0 %	0 %	312128029
42639	NC_014652	TCA	2	6	1851476	1851481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128029
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42641	NC_014652	T	7	7	1851531	1851537	0 %	100 %	0 %	0 %	312128029
42642	NC_014652	T	6	6	1851615	1851620	0 %	100 %	0 %	0 %	312128029
42643	NC_014652	TCA	2	6	1851632	1851637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128029
42644	NC_014652	TCA	2	6	1851668	1851673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128029
42645	NC_014652	ACCT	2	8	1851721	1851728	25 %	25 %	0 %	50 %	312128029
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42648	NC_014652	T	6	6	1851778	1851783	0 %	100 %	0 %	0 %	312128029
42649	NC_014652	CCTTT	2	10	1851885	1851894	0 %	60 %	0 %	40 %	312128029
42650	NC_014652	TGT	2	6	1851930	1851935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128029
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42673	NC_014652	TCT	2	6	1852961	1852966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128031
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42678	NC_014652	T	6	6	1853119	1853124	0 %	100 %	0 %	0 %	312128032
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42680	NC_014652	ACC	2	6	1853179	1853184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128032
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42685	NC_014652	ATGT	2	8	1853332	1853339	25 %	50 %	25 %	0 %	312128032
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42696	NC_014652	T	7	7	1853784	1853790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42697	NC_014652	A	6	6	1853803	1853808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42699	NC_014652	GCT	2	6	1853827	1853832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42702	NC_014652	CTT	2	6	1854080	1854085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128033
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42733	NC_014652	ATT	2	6	1855276	1855281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128033
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42738	NC_014652	CA	3	6	1855384	1855389	50 %	0 %	0 %	50 %	312128033
42739	NC_014652	A	6	6	1855392	1855397	100 %	0 %	0 %	0 %	312128033
42740	NC_014652	TTC	2	6	1855398	1855403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128033
42741	NC_014652	A	6	6	1855438	1855443	100 %	0 %	0 %	0 %	312128033
42742	NC_014652	TC	3	6	1855512	1855517	0 %	50 %	0 %	50 %	312128033
42743	NC_014652	ATG	2	6	1855560	1855565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128033
42744	NC_014652	TTTTAA	2	12	1855578	1855589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128033
42745	NC_014652	ATTTA	2	10	1855599	1855608	40 %	60 %	0 %	0 %	312128033
42746	NC_014652	TCCT	2	8	1855611	1855618	0 %	50 %	0 %	50 %	312128033
42747	NC_014652	TCA	2	6	1855678	1855683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128033
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42750	NC_014652	TTC	2	6	1855776	1855781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128033
42751	NC_014652	CTG	2	6	1855810	1855815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128033
42752	NC_014652	TTA	2	6	1855853	1855858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128033
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42755	NC_014652	CCA	2	6	1855978	1855983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128033
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42764	NC_014652	TCT	2	6	1856575	1856580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42765	NC_014652	TAC	2	6	1856581	1856586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128034
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42780	NC_014652	TA	3	6	1857609	1857614	50 %	50 %	0 %	0 %	312128034
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42785	NC_014652	ATC	2	6	1857754	1857759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128035
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42809	NC_014652	CAAA	2	8	1859046	1859053	75 %	0 %	0 %	25 %	312128035
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42815	NC_014652	CTTT	2	8	1859343	1859350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42858	NC_014652	CAA	2	6	1861090	1861095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128036
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42984	NC_014652	A	6	6	1865818	1865823	100 %	0 %	0 %	0 %	312128039
42985	NC_014652	TA	3	6	1865859	1865864	50 %	50 %	0 %	0 %	312128039
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