MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41120	NC_014652	GAT	2	6	1790190	1790195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127976
41121	NC_014652	CAA	2	6	1790257	1790262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127976
41122	NC_014652	ATCCC	2	10	1790299	1790308	20 %	20 %	0 %	60 %	312127976
41123	NC_014652	CAA	2	6	1790386	1790391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127976
41124	NC_014652	TTGTA	2	10	1790425	1790434	20 %	60 %	20 %	0 %	312127976
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41134	NC_014652	CT	3	6	1790823	1790828	0 %	50 %	0 %	50 %	312127976
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41150	NC_014652	TGA	2	6	1791634	1791639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127977
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41184	NC_014652	T	6	6	1793279	1793284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41185	NC_014652	TTC	2	6	1793290	1793295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41187	NC_014652	CTT	2	6	1793338	1793343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41191	NC_014652	CTTT	2	8	1793421	1793428	0 %	75 %	0 %	25 %	312127979
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41193	NC_014652	TGT	2	6	1793499	1793504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127979
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41227	NC_014652	CATAAC	2	12	1795027	1795038	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312127981
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41230	NC_014652	AGA	2	6	1795154	1795159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127981
41231	NC_014652	CGG	2	6	1795208	1795213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312127981
41232	NC_014652	TCT	2	6	1795218	1795223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127981
41233	NC_014652	T	6	6	1795223	1795228	0 %	100 %	0 %	0 %	312127981
41234	NC_014652	GATT	2	8	1795261	1795268	25 %	50 %	25 %	0 %	312127981
41235	NC_014652	CTTTA	2	10	1795289	1795298	20 %	60 %	0 %	20 %	312127982
41236	NC_014652	TCA	2	6	1795319	1795324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127982
41237	NC_014652	TCTT	2	8	1795352	1795359	0 %	75 %	0 %	25 %	312127982
41238	NC_014652	TGC	2	6	1795435	1795440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127982
41239	NC_014652	TCT	2	6	1795855	1795860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
41240	NC_014652	T	7	7	1795892	1795898	0 %	100 %	0 %	0 %	312127982
41241	NC_014652	TCT	2	6	1795925	1795930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
41242	NC_014652	TCG	2	6	1795948	1795953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127982
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41244	NC_014652	T	6	6	1796056	1796061	0 %	100 %	0 %	0 %	312127982
41245	NC_014652	CTT	2	6	1796099	1796104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
41246	NC_014652	TCT	2	6	1796120	1796125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
41247	NC_014652	GT	3	6	1796190	1796195	0 %	50 %	50 %	0 %	312127982
41248	NC_014652	T	6	6	1796363	1796368	0 %	100 %	0 %	0 %	312127982
41249	NC_014652	ATAA	2	8	1796389	1796396	75 %	25 %	0 %	0 %	312127982
41250	NC_014652	TTC	2	6	1796397	1796402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
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41252	NC_014652	ACC	2	6	1796461	1796466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312127982
41253	NC_014652	CCA	2	6	1796547	1796552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312127982
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41255	NC_014652	CTTT	2	8	1796615	1796622	0 %	75 %	0 %	25 %	312127982
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41258	NC_014652	CTT	2	6	1796693	1796698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
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41261	NC_014652	TTC	2	6	1796815	1796820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
41262	NC_014652	TCT	2	6	1796832	1796837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
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41264	NC_014652	GTT	2	6	1796913	1796918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127982
41265	NC_014652	ATA	2	6	1796926	1796931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127982
41266	NC_014652	T	6	6	1796956	1796961	0 %	100 %	0 %	0 %	312127982
41267	NC_014652	TTTCAA	2	12	1796982	1796993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312127982
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41269	NC_014652	TCTT	2	8	1797037	1797044	0 %	75 %	0 %	25 %	312127982
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41271	NC_014652	GACA	2	8	1797145	1797152	50 %	0 %	25 %	25 %	312127982
41272	NC_014652	TTTG	2	8	1797172	1797179	0 %	75 %	25 %	0 %	312127982
41273	NC_014652	TTA	2	6	1797219	1797224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127982
41274	NC_014652	TCT	2	6	1797245	1797250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127982
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41276	NC_014652	TTA	2	6	1797318	1797323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127982
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41295	NC_014652	CTT	2	6	1798284	1798289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127984
41296	NC_014652	TCT	2	6	1798399	1798404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127984
41297	NC_014652	TAGG	2	8	1798414	1798421	25 %	25 %	50 %	0 %	312127984
41298	NC_014652	ATCT	2	8	1798442	1798449	25 %	50 %	0 %	25 %	312127984
41299	NC_014652	CTT	2	6	1798504	1798509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127984
41300	NC_014652	T	8	8	1798572	1798579	0 %	100 %	0 %	0 %	312127984
41301	NC_014652	ACTTT	2	10	1798614	1798623	20 %	60 %	0 %	20 %	312127984
41302	NC_014652	CTT	2	6	1798636	1798641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41303	NC_014652	GA	4	8	1798705	1798712	50 %	0 %	50 %	0 %	312127985
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41307	NC_014652	GCA	2	6	1798968	1798973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127985
41308	NC_014652	CTG	2	6	1798981	1798986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127985
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41310	NC_014652	CATGAA	2	12	1799020	1799031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312127985
41311	NC_014652	CAA	2	6	1799083	1799088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127985
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41321	NC_014652	CTG	2	6	1799503	1799508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127985
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41324	NC_014652	T	6	6	1799615	1799620	0 %	100 %	0 %	0 %	312127985
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41330	NC_014652	TC	4	8	1799811	1799818	0 %	50 %	0 %	50 %	312127985
41331	NC_014652	T	6	6	1799831	1799836	0 %	100 %	0 %	0 %	312127985
41332	NC_014652	ATC	2	6	1799837	1799842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127985
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41335	NC_014652	ACT	2	6	1799901	1799906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127985
41336	NC_014652	TCCCA	2	10	1800054	1800063	20 %	20 %	0 %	60 %	312127986
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41339	NC_014652	ATC	2	6	1800187	1800192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127986
41340	NC_014652	CT	3	6	1800195	1800200	0 %	50 %	0 %	50 %	312127986
41341	NC_014652	TTC	2	6	1800201	1800206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127986
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41344	NC_014652	TC	3	6	1800448	1800453	0 %	50 %	0 %	50 %	312127986
41345	NC_014652	TCA	2	6	1800496	1800501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127986
41346	NC_014652	CTT	2	6	1800506	1800511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127986
41347	NC_014652	CTAT	2	8	1800535	1800542	25 %	50 %	0 %	25 %	312127986
41348	NC_014652	CAA	2	6	1800560	1800565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127986
41349	NC_014652	TTCCTT	2	12	1800599	1800610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127986
41350	NC_014652	GTA	2	6	1800672	1800677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127986
41351	NC_014652	AT	3	6	1800693	1800698	50 %	50 %	0 %	0 %	312127986
41352	NC_014652	TGCA	2	8	1800738	1800745	25 %	25 %	25 %	25 %	312127986
41353	NC_014652	TTA	2	6	1800758	1800763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127986
41354	NC_014652	TGAA	2	8	1800795	1800802	50 %	25 %	25 %	0 %	312127986
41355	NC_014652	TGC	2	6	1800942	1800947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127986
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41358	NC_014652	ATC	2	6	1801099	1801104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127986
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41480	NC_014652	CAAG	2	8	1806253	1806260	50 %	0 %	25 %	25 %	312127992
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41484	NC_014652	T	8	8	1806378	1806385	0 %	100 %	0 %	0 %	312127992
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41499	NC_014652	T	6	6	1806895	1806900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41500	NC_014652	TTG	2	6	1806908	1806913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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