MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30005	NC_014652	GGA	2	6	1311970	1311975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312127495
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30011	NC_014652	TA	4	8	1312136	1312143	50 %	50 %	0 %	0 %	312127495
30012	NC_014652	AGT	2	6	1312150	1312155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127495
30013	NC_014652	TA	3	6	1312169	1312174	50 %	50 %	0 %	0 %	312127495
30014	NC_014652	TGA	2	6	1312246	1312251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127495
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30017	NC_014652	TAT	2	6	1312395	1312400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_014652	TAA	2	6	1312416	1312421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_014652	T	6	6	1312422	1312427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30020	NC_014652	A	6	6	1312455	1312460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30051	NC_014652	AATT	2	8	1313825	1313832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_014652	ATA	2	6	1313857	1313862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30089	NC_014652	TAT	2	6	1315204	1315209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127497
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30118	NC_014652	TGA	2	6	1316557	1316562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127500
30119	NC_014652	GGA	2	6	1316597	1316602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312127500
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30220	NC_014652	GAA	2	6	1320752	1320757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127502
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30222	NC_014652	GA	3	6	1320831	1320836	50 %	0 %	50 %	0 %	312127503
30223	NC_014652	TTA	2	6	1320854	1320859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127503
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30225	NC_014652	AT	3	6	1320912	1320917	50 %	50 %	0 %	0 %	312127503
30226	NC_014652	CTTTT	2	10	1321048	1321057	0 %	80 %	0 %	20 %	312127503
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30228	NC_014652	GA	3	6	1321160	1321165	50 %	0 %	50 %	0 %	312127503
30229	NC_014652	CTG	2	6	1321166	1321171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127503
30230	NC_014652	AAG	2	6	1321271	1321276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127503
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30232	NC_014652	AT	3	6	1321378	1321383	50 %	50 %	0 %	0 %	312127503
30233	NC_014652	AT	3	6	1321432	1321437	50 %	50 %	0 %	0 %	312127503
30234	NC_014652	T	6	6	1321507	1321512	0 %	100 %	0 %	0 %	312127503
30235	NC_014652	CAT	2	6	1321551	1321556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127503
30236	NC_014652	AGA	2	6	1321617	1321622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127503
30237	NC_014652	AG	3	6	1321624	1321629	50 %	0 %	50 %	0 %	312127503
30238	NC_014652	AAG	2	6	1321679	1321684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127503
30239	NC_014652	GTT	2	6	1321768	1321773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127503
30240	NC_014652	A	6	6	1321782	1321787	100 %	0 %	0 %	0 %	312127503
30241	NC_014652	TCAGGT	2	12	1321803	1321814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312127504
30242	NC_014652	GA	3	6	1321852	1321857	50 %	0 %	50 %	0 %	312127504
30243	NC_014652	CTA	2	6	1321864	1321869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127504
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30251	NC_014652	TA	3	6	1322049	1322054	50 %	50 %	0 %	0 %	312127504
30252	NC_014652	TCCT	2	8	1322105	1322112	0 %	50 %	0 %	50 %	312127504
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30254	NC_014652	GTAT	2	8	1322137	1322144	25 %	50 %	25 %	0 %	312127504
30255	NC_014652	GT	3	6	1322164	1322169	0 %	50 %	50 %	0 %	312127504
30256	NC_014652	TTG	2	6	1322209	1322214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127504
30257	NC_014652	GGT	2	6	1322229	1322234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312127504
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30259	NC_014652	TA	3	6	1322255	1322260	50 %	50 %	0 %	0 %	312127504
30260	NC_014652	GAT	2	6	1322271	1322276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127504
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30262	NC_014652	CTT	2	6	1322346	1322351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127504
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30265	NC_014652	A	6	6	1322411	1322416	100 %	0 %	0 %	0 %	312127504
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30289	NC_014652	A	6	6	1323507	1323512	100 %	0 %	0 %	0 %	312127505
30290	NC_014652	TGG	2	6	1323544	1323549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312127505
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30297	NC_014652	TGG	2	6	1324018	1324023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312127506
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30327	NC_014652	A	6	6	1325493	1325498	100 %	0 %	0 %	0 %	312127507
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30340	NC_014652	AT	3	6	1325937	1325942	50 %	50 %	0 %	0 %	312127508
30341	NC_014652	TAC	2	6	1326043	1326048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127508
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30343	NC_014652	TAG	2	6	1326208	1326213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127508
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30347	NC_014652	ATTT	2	8	1326456	1326463	25 %	75 %	0 %	0 %	312127508
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30349	NC_014652	CTT	2	6	1326531	1326536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127508
30350	NC_014652	GA	3	6	1326585	1326590	50 %	0 %	50 %	0 %	312127508
30351	NC_014652	TGA	2	6	1326652	1326657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127508
30352	NC_014652	AGA	2	6	1326662	1326667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127508
30353	NC_014652	GAATG	2	10	1326686	1326695	40 %	20 %	40 %	0 %	312127508
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30471	NC_014652	TTG	2	6	1332230	1332235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127512
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