MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_014652	GAG	2	6	1119498	1119503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25502	NC_014652	GCA	3	9	1119519	1119527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127319
25503	NC_014652	AGA	2	6	1119563	1119568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127319
25504	NC_014652	ATG	2	6	1119586	1119591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127319
25505	NC_014652	TGA	2	6	1119629	1119634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127319
25506	NC_014652	ATC	2	6	1119681	1119686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127319
25507	NC_014652	A	6	6	1119728	1119733	100 %	0 %	0 %	0 %	312127319
25508	NC_014652	TGA	2	6	1119736	1119741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127319
25509	NC_014652	A	6	6	1119786	1119791	100 %	0 %	0 %	0 %	312127319
25510	NC_014652	AATA	2	8	1119882	1119889	75 %	25 %	0 %	0 %	312127319
25511	NC_014652	TAA	2	6	1119911	1119916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127320
25512	NC_014652	TCT	2	6	1119926	1119931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127320
25513	NC_014652	GAA	2	6	1119933	1119938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127320
25514	NC_014652	GCA	2	6	1119980	1119985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127320
25515	NC_014652	TGA	2	6	1120010	1120015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127320
25516	NC_014652	TTG	2	6	1120027	1120032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127320
25517	NC_014652	TTGA	2	8	1120047	1120054	25 %	50 %	25 %	0 %	312127320
25518	NC_014652	ATAGA	2	10	1120063	1120072	60 %	20 %	20 %	0 %	312127320
25519	NC_014652	TGA	2	6	1120130	1120135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127320
25520	NC_014652	CAT	2	6	1120183	1120188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127320
25521	NC_014652	AAT	2	6	1120233	1120238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127320
25522	NC_014652	TGA	2	6	1120259	1120264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127320
25523	NC_014652	A	6	6	1120296	1120301	100 %	0 %	0 %	0 %	312127320
25524	NC_014652	ACAA	2	8	1120327	1120334	75 %	0 %	0 %	25 %	312127320
25525	NC_014652	A	6	6	1120359	1120364	100 %	0 %	0 %	0 %	312127320
25526	NC_014652	CTT	2	6	1120388	1120393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127321
25527	NC_014652	GTT	2	6	1120501	1120506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127321
25528	NC_014652	T	6	6	1120575	1120580	0 %	100 %	0 %	0 %	312127321
25529	NC_014652	CAT	2	6	1120646	1120651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127321
25530	NC_014652	TA	4	8	1120657	1120664	50 %	50 %	0 %	0 %	312127321
25531	NC_014652	CAT	2	6	1120716	1120721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127321
25532	NC_014652	AT	3	6	1120720	1120725	50 %	50 %	0 %	0 %	312127321
25533	NC_014652	TCA	2	6	1120763	1120768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25534	NC_014652	TAAC	2	8	1120886	1120893	50 %	25 %	0 %	25 %	312127322
25535	NC_014652	AAAG	2	8	1120937	1120944	75 %	0 %	25 %	0 %	312127322
25536	NC_014652	GTC	2	6	1121063	1121068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127322
25537	NC_014652	TCT	2	6	1121083	1121088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127322
25538	NC_014652	TATG	2	8	1121090	1121097	25 %	50 %	25 %	0 %	312127322
25539	NC_014652	ATG	2	6	1121136	1121141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127322
25540	NC_014652	ATTTT	2	10	1121173	1121182	20 %	80 %	0 %	0 %	312127322
25541	NC_014652	GCA	2	6	1121196	1121201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127322
25542	NC_014652	TCT	2	6	1121248	1121253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127322
25543	NC_014652	GTT	2	6	1121350	1121355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127322
25544	NC_014652	AGA	2	6	1121416	1121421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127322
25545	NC_014652	TAA	2	6	1121433	1121438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127322
25546	NC_014652	T	6	6	1121450	1121455	0 %	100 %	0 %	0 %	312127322
25547	NC_014652	TGC	2	6	1121519	1121524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127322
25548	NC_014652	AGC	2	6	1121540	1121545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127322
25549	NC_014652	GAAA	2	8	1121564	1121571	75 %	0 %	25 %	0 %	312127322
25550	NC_014652	TAT	2	6	1121612	1121617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127322
25551	NC_014652	CTT	2	6	1121671	1121676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127322
25552	NC_014652	CAAT	2	8	1121752	1121759	50 %	25 %	0 %	25 %	312127322
25553	NC_014652	A	6	6	1121777	1121782	100 %	0 %	0 %	0 %	312127322
25554	NC_014652	A	6	6	1121880	1121885	100 %	0 %	0 %	0 %	312127322
25555	NC_014652	GA	3	6	1121929	1121934	50 %	0 %	50 %	0 %	312127322
25556	NC_014652	GTT	2	6	1121957	1121962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127322
25557	NC_014652	TTTG	2	8	1122052	1122059	0 %	75 %	25 %	0 %	312127322
25558	NC_014652	CTTT	2	8	1122089	1122096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25559	NC_014652	AAAT	2	8	1122109	1122116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25560	NC_014652	TCTA	2	8	1122166	1122173	25 %	50 %	0 %	25 %	312127323
25561	NC_014652	CTCA	2	8	1122178	1122185	25 %	25 %	0 %	50 %	312127323
25562	NC_014652	A	7	7	1122185	1122191	100 %	0 %	0 %	0 %	312127323
25563	NC_014652	TCA	2	6	1122215	1122220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127323
25564	NC_014652	ACA	2	6	1122272	1122277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127323
25565	NC_014652	GT	3	6	1122300	1122305	0 %	50 %	50 %	0 %	312127323
25566	NC_014652	CT	3	6	1122307	1122312	0 %	50 %	0 %	50 %	312127323
25567	NC_014652	T	6	6	1122312	1122317	0 %	100 %	0 %	0 %	312127323
25568	NC_014652	CAA	2	6	1122351	1122356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127323
25569	NC_014652	A	6	6	1122360	1122365	100 %	0 %	0 %	0 %	312127323
25570	NC_014652	T	7	7	1122485	1122491	0 %	100 %	0 %	0 %	312127323
25571	NC_014652	T	6	6	1122507	1122512	0 %	100 %	0 %	0 %	312127323
25572	NC_014652	T	6	6	1122586	1122591	0 %	100 %	0 %	0 %	312127323
25573	NC_014652	CAA	2	6	1122621	1122626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127323
25574	NC_014652	AATG	2	8	1122661	1122668	50 %	25 %	25 %	0 %	312127323
25575	NC_014652	AATA	2	8	1122744	1122751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25576	NC_014652	AGC	2	6	1122754	1122759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25577	NC_014652	CAA	2	6	1122881	1122886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127324
25578	NC_014652	TGA	2	6	1122916	1122921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127324
25579	NC_014652	CAT	2	6	1122958	1122963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127324
25580	NC_014652	AAG	2	6	1122966	1122971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127324
25581	NC_014652	AATA	2	8	1122985	1122992	75 %	25 %	0 %	0 %	312127324
25582	NC_014652	A	6	6	1123127	1123132	100 %	0 %	0 %	0 %	312127325
25583	NC_014652	GTT	2	6	1123134	1123139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127325
25584	NC_014652	TTCT	2	8	1123216	1123223	0 %	75 %	0 %	25 %	312127325
25585	NC_014652	A	6	6	1123229	1123234	100 %	0 %	0 %	0 %	312127325
25586	NC_014652	GAAG	2	8	1123236	1123243	50 %	0 %	50 %	0 %	312127325
25587	NC_014652	AAC	2	6	1123316	1123321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312127325
25588	NC_014652	CTT	2	6	1123419	1123424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312127325
25589	NC_014652	TGT	2	6	1123433	1123438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127325
25590	NC_014652	TGA	2	6	1123439	1123444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127325
25591	NC_014652	AGA	3	9	1123447	1123455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127325
25592	NC_014652	ACG	2	6	1123522	1123527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127325
25593	NC_014652	TTG	2	6	1123528	1123533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127325
25594	NC_014652	AAT	2	6	1123589	1123594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127325
25595	NC_014652	ATT	2	6	1123611	1123616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312127325
25596	NC_014652	AT	3	6	1123703	1123708	50 %	50 %	0 %	0 %	312127325
25597	NC_014652	AGG	2	6	1123721	1123726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312127325
25598	NC_014652	TCAAC	2	10	1123738	1123747	40 %	20 %	0 %	40 %	312127325
25599	NC_014652	TGCAA	2	10	1123784	1123793	40 %	20 %	20 %	20 %	312127325
25600	NC_014652	TTGA	2	8	1123939	1123946	25 %	50 %	25 %	0 %	312127326
25601	NC_014652	AAG	2	6	1123964	1123969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127326
25602	NC_014652	A	6	6	1123974	1123979	100 %	0 %	0 %	0 %	312127326
25603	NC_014652	TGAAAA	2	12	1123995	1124006	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312127326
25604	NC_014652	AGA	2	6	1124045	1124050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127326
25605	NC_014652	ATTTT	2	10	1124054	1124063	20 %	80 %	0 %	0 %	312127326
25606	NC_014652	AG	3	6	1124258	1124263	50 %	0 %	50 %	0 %	312127326
25607	NC_014652	AAT	2	6	1124283	1124288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127326
25608	NC_014652	GAG	2	6	1124363	1124368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312127326
25609	NC_014652	GCA	2	6	1124447	1124452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127326
25610	NC_014652	TTG	2	6	1124459	1124464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127326
25611	NC_014652	CTG	2	6	1124483	1124488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312127326
25612	NC_014652	ATG	2	6	1124494	1124499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127326
25613	NC_014652	GGT	2	6	1124536	1124541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312127326
25614	NC_014652	TGT	2	6	1124559	1124564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127326
25615	NC_014652	TGA	2	6	1124622	1124627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312127326
25616	NC_014652	TTG	2	6	1124657	1124662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127326
25617	NC_014652	AGA	2	6	1124733	1124738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312127326
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25619	NC_014652	A	6	6	1124772	1124777	100 %	0 %	0 %	0 %	312127326
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25634	NC_014652	TAA	2	6	1125282	1125287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25740	NC_014652	TGT	2	6	1130080	1130085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127330
25741	NC_014652	AG	3	6	1130116	1130121	50 %	0 %	50 %	0 %	312127330
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25801	NC_014652	ATT	2	6	1133537	1133542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25844	NC_014652	CTTT	2	8	1135414	1135421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25845	NC_014652	T	6	6	1135481	1135486	0 %	100 %	0 %	0 %	312127335
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25851	NC_014652	CAT	2	6	1135678	1135683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127336
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25857	NC_014652	TGT	2	6	1136080	1136085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312127336
25858	NC_014652	ATA	2	6	1136151	1136156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312127336
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25980	NC_014652	ATC	2	6	1141658	1141663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312127344
25981	NC_014652	CAG	2	6	1141705	1141710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312127344
25982	NC_014652	CCCT	2	8	1141751	1141758	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25983	NC_014652	TTAT	2	8	1141779	1141786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25984	NC_014652	T	6	6	1141796	1141801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25985	NC_014652	AAT	2	6	1141823	1141828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25986	NC_014652	TTC	2	6	1141831	1141836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25987	NC_014652	TAA	2	6	1141849	1141854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25988	NC_014652	A	6	6	1141900	1141905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25989	NC_014652	T	6	6	1141952	1141957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25990	NC_014652	AAT	2	6	1141958	1141963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25991	NC_014652	AAGG	2	8	1141998	1142005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25992	NC_014652	AAAGTC	2	12	1142030	1142041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25993	NC_014652	GTC	2	6	1142046	1142051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25995	NC_014652	T	6	6	1142133	1142138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25996	NC_014652	AGG	2	6	1142143	1142148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25997	NC_014652	TCC	2	6	1142188	1142193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312127345
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