MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014652	ATG	2	6	644632	644637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126828
14502	NC_014652	ACCAG	2	10	644675	644684	40 %	0 %	20 %	40 %	312126828
14503	NC_014652	GATG	2	8	644685	644692	25 %	25 %	50 %	0 %	312126828
14504	NC_014652	TCAAG	2	10	644732	644741	40 %	20 %	20 %	20 %	312126828
14505	NC_014652	GT	3	6	644846	644851	0 %	50 %	50 %	0 %	312126828
14506	NC_014652	T	6	6	644938	644943	0 %	100 %	0 %	0 %	312126828
14507	NC_014652	GAG	2	6	644951	644956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126828
14508	NC_014652	GATG	2	8	645047	645054	25 %	25 %	50 %	0 %	312126828
14509	NC_014652	AT	3	6	645187	645192	50 %	50 %	0 %	0 %	312126828
14510	NC_014652	TTG	2	6	645220	645225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126828
14511	NC_014652	CAA	2	6	645251	645256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126828
14512	NC_014652	AC	3	6	645288	645293	50 %	0 %	0 %	50 %	312126828
14513	NC_014652	TGA	2	6	645411	645416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126828
14514	NC_014652	TGA	2	6	645495	645500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126828
14515	NC_014652	GAA	2	6	645542	645547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126828
14516	NC_014652	TGT	2	6	645588	645593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126828
14517	NC_014652	TA	3	6	645877	645882	50 %	50 %	0 %	0 %	312126828
14518	NC_014652	CTGGTT	2	12	645920	645931	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312126828
14519	NC_014652	AGGG	2	8	646112	646119	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_014652	TTTCA	2	10	646179	646188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14521	NC_014652	ACA	2	6	646235	646240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126829
14522	NC_014652	TAA	2	6	646298	646303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126829
14523	NC_014652	TTG	2	6	646325	646330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126829
14524	NC_014652	TAT	2	6	646395	646400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126829
14525	NC_014652	AAT	2	6	646460	646465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126830
14526	NC_014652	CTT	2	6	646485	646490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126830
14527	NC_014652	ATG	2	6	646494	646499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126830
14528	NC_014652	A	6	6	646532	646537	100 %	0 %	0 %	0 %	312126830
14529	NC_014652	TCA	2	6	646551	646556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126830
14530	NC_014652	ACT	2	6	646566	646571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126830
14531	NC_014652	A	6	6	646581	646586	100 %	0 %	0 %	0 %	312126830
14532	NC_014652	ATG	2	6	646615	646620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126830
14533	NC_014652	CAAA	2	8	646653	646660	75 %	0 %	0 %	25 %	312126830
14534	NC_014652	GAA	2	6	646666	646671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126830
14535	NC_014652	CAG	2	6	646783	646788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126830
14536	NC_014652	GAAA	2	8	646811	646818	75 %	0 %	25 %	0 %	312126830
14537	NC_014652	A	6	6	646906	646911	100 %	0 %	0 %	0 %	312126830
14538	NC_014652	GGT	2	6	646912	646917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_014652	GAT	2	6	647097	647102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126831
14540	NC_014652	CAC	2	6	647127	647132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126831
14541	NC_014652	GTT	2	6	647158	647163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126831
14542	NC_014652	AGC	2	6	647186	647191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126831
14543	NC_014652	GATA	2	8	647310	647317	50 %	25 %	25 %	0 %	312126831
14544	NC_014652	GGA	2	6	647326	647331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126831
14545	NC_014652	ATT	2	6	647414	647419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126831
14546	NC_014652	TTG	2	6	647441	647446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126831
14547	NC_014652	AAT	2	6	647601	647606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126831
14548	NC_014652	CAA	2	6	647618	647623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126831
14549	NC_014652	A	7	7	647683	647689	100 %	0 %	0 %	0 %	312126831
14550	NC_014652	GA	3	6	647692	647697	50 %	0 %	50 %	0 %	312126831
14551	NC_014652	GGTG	2	8	647766	647773	0 %	25 %	75 %	0 %	312126831
14552	NC_014652	AAG	2	6	647861	647866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126831
14553	NC_014652	AGA	2	6	647895	647900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126831
14554	NC_014652	GGA	2	6	647904	647909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126831
14555	NC_014652	CT	3	6	647928	647933	0 %	50 %	0 %	50 %	312126832
14556	NC_014652	CAT	3	9	647974	647982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126832
14557	NC_014652	CAG	2	6	648046	648051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126832
14558	NC_014652	CCA	2	6	648052	648057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126832
14559	NC_014652	GTG	2	6	648168	648173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126832
14560	NC_014652	AAGG	2	8	648177	648184	50 %	0 %	50 %	0 %	312126832
14561	NC_014652	TCT	2	6	648200	648205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126832
14562	NC_014652	AAGA	2	8	648213	648220	75 %	0 %	25 %	0 %	312126832
14563	NC_014652	ATG	2	6	648246	648251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126832
14564	NC_014652	TGG	2	6	648331	648336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126832
14565	NC_014652	TTC	2	6	648356	648361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126832
14566	NC_014652	GAG	2	6	648429	648434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126832
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14568	NC_014652	GATA	2	8	648503	648510	50 %	25 %	25 %	0 %	312126832
14569	NC_014652	GAAG	2	8	648632	648639	50 %	0 %	50 %	0 %	312126832
14570	NC_014652	CTT	2	6	648655	648660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126832
14571	NC_014652	CTT	2	6	648697	648702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126832
14572	NC_014652	CCA	3	9	648708	648716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126832
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14574	NC_014652	TGA	2	6	648773	648778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126832
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14577	NC_014652	AG	3	6	648873	648878	50 %	0 %	50 %	0 %	312126832
14578	NC_014652	ATT	2	6	648903	648908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126832
14579	NC_014652	TGA	2	6	648989	648994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126832
14580	NC_014652	ATAA	2	8	649050	649057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_014652	T	6	6	649062	649067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_014652	AAGT	2	8	649077	649084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_014652	A	6	6	649100	649105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_014652	GA	4	8	649122	649129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_014652	TGA	2	6	649156	649161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126833
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14588	NC_014652	ATG	2	6	649286	649291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126833
14589	NC_014652	A	6	6	649339	649344	100 %	0 %	0 %	0 %	312126833
14590	NC_014652	CAG	2	6	649388	649393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126833
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14592	NC_014652	GC	3	6	649424	649429	0 %	0 %	50 %	50 %	312126833
14593	NC_014652	AG	3	6	649456	649461	50 %	0 %	50 %	0 %	312126833
14594	NC_014652	TTG	2	6	649464	649469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126833
14595	NC_014652	A	6	6	649478	649483	100 %	0 %	0 %	0 %	312126833
14596	NC_014652	GAG	2	6	649508	649513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_014652	A	7	7	649514	649520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_014652	TAT	2	6	649591	649596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126834
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14602	NC_014652	CTT	2	6	649838	649843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126834
14603	NC_014652	GAA	2	6	649851	649856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126834
14604	NC_014652	GAT	2	6	649906	649911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126834
14605	NC_014652	A	8	8	649913	649920	100 %	0 %	0 %	0 %	312126834
14606	NC_014652	TATAT	2	10	649931	649940	40 %	60 %	0 %	0 %	312126835
14607	NC_014652	ACT	2	6	649945	649950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126835
14608	NC_014652	TTTAAT	2	12	649951	649962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126835
14609	NC_014652	A	7	7	649975	649981	100 %	0 %	0 %	0 %	312126835
14610	NC_014652	ATG	2	6	650111	650116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126835
14611	NC_014652	CAT	2	6	650118	650123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126835
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14615	NC_014652	TGAC	2	8	650244	650251	25 %	25 %	25 %	25 %	312126835
14616	NC_014652	CATA	2	8	650277	650284	50 %	25 %	0 %	25 %	312126835
14617	NC_014652	AAG	2	6	650304	650309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126835
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14619	NC_014652	A	6	6	650363	650368	100 %	0 %	0 %	0 %	312126835
14620	NC_014652	GACCTT	2	12	650369	650380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312126835
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14623	NC_014652	TAA	2	6	650514	650519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126835
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14989	NC_014652	AGT	2	6	665455	665460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126853
14990	NC_014652	ATG	2	6	665581	665586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126853
14991	NC_014652	TG	3	6	665585	665590	0 %	50 %	50 %	0 %	312126853
14992	NC_014652	A	6	6	665701	665706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_014652	GAA	2	6	665735	665740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_014652	TAT	2	6	665748	665753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_014652	T	7	7	665792	665798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14996	NC_014652	GAA	2	6	665826	665831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14997	NC_014652	TATT	2	8	665842	665849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14998	NC_014652	AGTG	2	8	665869	665876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14999	NC_014652	AGG	2	6	665893	665898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_014652	TCA	2	6	665940	665945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126854

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