MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014652	GTC	2	6	511106	511111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126704
11502	NC_014652	AAGC	2	8	511112	511119	50 %	0 %	25 %	25 %	312126704
11503	NC_014652	CAA	2	6	511123	511128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126704
11504	NC_014652	AT	3	6	511152	511157	50 %	50 %	0 %	0 %	312126704
11505	NC_014652	AGC	2	6	511164	511169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126704
11506	NC_014652	AAC	2	6	511251	511256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126704
11507	NC_014652	A	6	6	511308	511313	100 %	0 %	0 %	0 %	312126704
11508	NC_014652	GCA	2	6	511315	511320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126704
11509	NC_014652	CTT	2	6	511335	511340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126704
11510	NC_014652	TAT	2	6	511356	511361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126704
11511	NC_014652	ATC	2	6	511467	511472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126704
11512	NC_014652	ATG	2	6	511486	511491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126704
11513	NC_014652	ACAT	2	8	511500	511507	50 %	25 %	0 %	25 %	312126704
11514	NC_014652	GACA	2	8	511568	511575	50 %	0 %	25 %	25 %	312126704
11515	NC_014652	AAC	2	6	511653	511658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126704
11516	NC_014652	TCAAC	2	10	511684	511693	40 %	20 %	0 %	40 %	312126704
11517	NC_014652	CTA	3	9	511787	511795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126704
11518	NC_014652	ACT	2	6	511813	511818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126704
11519	NC_014652	CAG	2	6	511819	511824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126704
11520	NC_014652	AGA	2	6	511831	511836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126704
11521	NC_014652	ACT	2	6	511891	511896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126704
11522	NC_014652	GCA	2	6	511987	511992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126704
11523	NC_014652	TGT	2	6	512015	512020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126704
11524	NC_014652	ATG	2	6	512044	512049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126704
11525	NC_014652	GACA	2	8	512063	512070	50 %	0 %	25 %	25 %	312126704
11526	NC_014652	TTG	2	6	512095	512100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126704
11527	NC_014652	TTG	2	6	512164	512169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126704
11528	NC_014652	GTA	2	6	512175	512180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126704
11529	NC_014652	AAC	2	6	512186	512191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126704
11530	NC_014652	AGACA	2	10	512204	512213	60 %	0 %	20 %	20 %	312126704
11531	NC_014652	CTT	2	6	512247	512252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126704
11532	NC_014652	AG	3	6	512275	512280	50 %	0 %	50 %	0 %	312126704
11533	NC_014652	AAT	2	6	512342	512347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_014652	GCC	2	6	512360	512365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_014652	GGC	2	6	512380	512385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_014652	T	6	6	512387	512392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_014652	TATAAT	2	12	512419	512430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_014652	A	6	6	512455	512460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_014652	CCT	2	6	512501	512506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312126705
11540	NC_014652	CTT	2	6	512558	512563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126705
11541	NC_014652	GAT	2	6	512599	512604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11542	NC_014652	AAAC	2	8	512631	512638	75 %	0 %	0 %	25 %	312126705
11543	NC_014652	GTT	2	6	512846	512851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126705
11544	NC_014652	AT	3	6	512877	512882	50 %	50 %	0 %	0 %	312126705
11545	NC_014652	CAA	2	6	512883	512888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126705
11546	NC_014652	AT	3	6	512907	512912	50 %	50 %	0 %	0 %	312126705
11547	NC_014652	GAT	2	6	512918	512923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11548	NC_014652	AT	3	6	512922	512927	50 %	50 %	0 %	0 %	312126705
11549	NC_014652	GGT	2	6	512938	512943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126705
11550	NC_014652	AAG	2	6	512985	512990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126705
11551	NC_014652	AGA	2	6	513031	513036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126705
11552	NC_014652	AGA	2	6	513095	513100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126705
11553	NC_014652	ATTAT	2	10	513129	513138	40 %	60 %	0 %	0 %	312126705
11554	NC_014652	TAG	2	6	513183	513188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11555	NC_014652	AGG	2	6	513202	513207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126705
11556	NC_014652	GCT	2	6	513247	513252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126705
11557	NC_014652	TGA	2	6	513253	513258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11558	NC_014652	GACAAA	2	12	513259	513270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312126705
11559	NC_014652	CAG	2	6	513290	513295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126705
11560	NC_014652	CAG	2	6	513302	513307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126705
11561	NC_014652	CAG	2	6	513326	513331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126705
11562	NC_014652	A	6	6	513361	513366	100 %	0 %	0 %	0 %	312126705
11563	NC_014652	TGA	3	9	513388	513396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11564	NC_014652	TGA	2	6	513424	513429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126705
11565	NC_014652	ATTTT	2	10	513484	513493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_014652	GACT	2	8	513494	513501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_014652	ATC	2	6	513558	513563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126706
11568	NC_014652	ATT	2	6	513604	513609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126706
11569	NC_014652	CAA	2	6	513611	513616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126706
11570	NC_014652	TG	3	6	513635	513640	0 %	50 %	50 %	0 %	312126706
11571	NC_014652	TGT	2	6	513675	513680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126706
11572	NC_014652	CT	3	6	513720	513725	0 %	50 %	0 %	50 %	312126706
11573	NC_014652	CTT	2	6	513740	513745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126706
11574	NC_014652	CTA	2	6	513800	513805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126706
11575	NC_014652	TTG	2	6	513811	513816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126706
11576	NC_014652	T	6	6	513847	513852	0 %	100 %	0 %	0 %	312126706
11577	NC_014652	TTC	2	6	513856	513861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126706
11578	NC_014652	CTCTT	2	10	513879	513888	0 %	60 %	0 %	40 %	312126706
11579	NC_014652	TTCC	2	8	513908	513915	0 %	50 %	0 %	50 %	312126706
11580	NC_014652	TCA	2	6	514004	514009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126706
11581	NC_014652	AT	3	6	514012	514017	50 %	50 %	0 %	0 %	312126706
11582	NC_014652	TG	4	8	514042	514049	0 %	50 %	50 %	0 %	312126706
11583	NC_014652	CAT	2	6	514109	514114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126706
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11585	NC_014652	CAA	2	6	514208	514213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126706
11586	NC_014652	CT	3	6	514244	514249	0 %	50 %	0 %	50 %	312126706
11587	NC_014652	CCT	2	6	514278	514283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11588	NC_014652	AT	3	6	514300	514305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_014652	TTTGAA	2	12	514310	514321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_014652	TAC	2	6	514343	514348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126707
11591	NC_014652	AAT	2	6	514359	514364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126707
11592	NC_014652	CAA	2	6	514383	514388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126707
11593	NC_014652	GACC	2	8	514389	514396	25 %	0 %	25 %	50 %	312126707
11594	NC_014652	GAACAG	2	12	514413	514424	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312126707
11595	NC_014652	ATC	2	6	514468	514473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126707
11596	NC_014652	TAA	2	6	514488	514493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126707
11597	NC_014652	CTGG	2	8	514539	514546	0 %	25 %	50 %	25 %	312126707
11598	NC_014652	TCA	2	6	514601	514606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126707
11599	NC_014652	ACA	2	6	514607	514612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126707
11600	NC_014652	T	6	6	514625	514630	0 %	100 %	0 %	0 %	312126707
11601	NC_014652	T	6	6	514632	514637	0 %	100 %	0 %	0 %	312126707
11602	NC_014652	ATG	2	6	514700	514705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126707
11603	NC_014652	T	7	7	514716	514722	0 %	100 %	0 %	0 %	312126707
11604	NC_014652	T	6	6	514756	514761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_014652	ATTA	2	8	514770	514777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_014652	TA	3	6	514776	514781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_014652	AATT	2	8	514786	514793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_014652	A	6	6	514803	514808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_014652	CAA	2	6	514828	514833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_014652	TTA	2	6	514834	514839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_014652	GA	4	8	514889	514896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_014652	AGA	2	6	514953	514958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126708
11613	NC_014652	TTGC	2	8	515012	515019	0 %	50 %	25 %	25 %	312126708
11614	NC_014652	AG	3	6	515033	515038	50 %	0 %	50 %	0 %	312126708
11615	NC_014652	GTG	2	6	515106	515111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126708
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11617	NC_014652	ATT	2	6	515366	515371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126708
11618	NC_014652	A	6	6	515408	515413	100 %	0 %	0 %	0 %	312126708
11619	NC_014652	GCAAA	2	10	515426	515435	60 %	0 %	20 %	20 %	312126708
11620	NC_014652	TTG	2	6	515457	515462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126708
11621	NC_014652	TAT	2	6	515711	515716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11988	NC_014652	A	6	6	530567	530572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11997	NC_014652	AT	3	6	530998	531003	50 %	50 %	0 %	0 %	312126725
11998	NC_014652	AAG	2	6	531070	531075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126725
11999	NC_014652	TTTG	2	8	531083	531090	0 %	75 %	25 %	0 %	312126725
12000	NC_014652	CAG	2	6	531144	531149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126725

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