MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_014652	ATT	2	6	2279806	2279811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52502	NC_014652	AAT	2	6	2279876	2279881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52503	NC_014652	A	6	6	2279900	2279905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52504	NC_014652	CTTT	2	8	2279941	2279948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52505	NC_014652	TAA	2	6	2279961	2279966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52506	NC_014652	A	6	6	2279965	2279970	100 %	0 %	0 %	0 %	312128408
52507	NC_014652	AG	3	6	2280000	2280005	50 %	0 %	50 %	0 %	312128408
52508	NC_014652	AAC	2	6	2280014	2280019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128408
52509	NC_014652	GAA	2	6	2280127	2280132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128408
52510	NC_014652	TA	3	6	2280186	2280191	50 %	50 %	0 %	0 %	312128408
52511	NC_014652	CAA	2	6	2280229	2280234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128408
52512	NC_014652	GAA	3	9	2280292	2280300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128408
52513	NC_014652	T	6	6	2280324	2280329	0 %	100 %	0 %	0 %	312128408
52514	NC_014652	TGA	2	6	2280338	2280343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128408
52515	NC_014652	AACA	2	8	2280371	2280378	75 %	0 %	0 %	25 %	312128408
52516	NC_014652	ATTG	2	8	2280413	2280420	25 %	50 %	25 %	0 %	312128408
52517	NC_014652	AG	3	6	2280528	2280533	50 %	0 %	50 %	0 %	312128408
52518	NC_014652	ATT	2	6	2280544	2280549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128408
52519	NC_014652	ACAG	2	8	2280588	2280595	50 %	0 %	25 %	25 %	312128408
52520	NC_014652	ATG	2	6	2280769	2280774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128408
52521	NC_014652	A	6	6	2280780	2280785	100 %	0 %	0 %	0 %	312128408
52522	NC_014652	A	6	6	2280792	2280797	100 %	0 %	0 %	0 %	312128408
52523	NC_014652	AGA	2	6	2280851	2280856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128408
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52527	NC_014652	CAA	2	6	2281184	2281189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128408
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52529	NC_014652	TGA	2	6	2281280	2281285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128408
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52534	NC_014652	TGA	2	6	2281451	2281456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128408
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52539	NC_014652	GA	3	6	2281873	2281878	50 %	0 %	50 %	0 %	312128408
52540	NC_014652	GCA	2	6	2281911	2281916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128408
52541	NC_014652	T	6	6	2281918	2281923	0 %	100 %	0 %	0 %	312128408
52542	NC_014652	CAA	2	6	2281928	2281933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128408
52543	NC_014652	AGAGA	2	10	2282016	2282025	60 %	0 %	40 %	0 %	312128408
52544	NC_014652	GAT	2	6	2282066	2282071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128408
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52546	NC_014652	CTG	2	6	2282128	2282133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128408
52547	NC_014652	TTG	2	6	2282143	2282148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128408
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52549	NC_014652	A	6	6	2282279	2282284	100 %	0 %	0 %	0 %	312128408
52550	NC_014652	A	6	6	2282310	2282315	100 %	0 %	0 %	0 %	312128408
52551	NC_014652	GTT	2	6	2282319	2282324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128408
52552	NC_014652	TTG	2	6	2282383	2282388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312128408
52553	NC_014652	AGG	2	6	2282416	2282421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52554	NC_014652	T	6	6	2282425	2282430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52555	NC_014652	AG	3	6	2282461	2282466	50 %	0 %	50 %	0 %	312128409
52556	NC_014652	ATT	2	6	2282507	2282512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128409
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52558	NC_014652	TA	3	6	2282645	2282650	50 %	50 %	0 %	0 %	312128409
52559	NC_014652	ATG	2	6	2282923	2282928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128409
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52563	NC_014652	T	6	6	2283030	2283035	0 %	100 %	0 %	0 %	312128409
52564	NC_014652	ACAG	2	8	2283070	2283077	50 %	0 %	25 %	25 %	312128409
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52571	NC_014652	CAT	2	6	2283598	2283603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128409
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52584	NC_014652	TGA	2	6	2284158	2284163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128409
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52601	NC_014652	GAG	2	6	2284836	2284841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52602	NC_014652	GTG	2	6	2284863	2284868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52603	NC_014652	T	7	7	2284875	2284881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52604	NC_014652	TTTCT	2	10	2284883	2284892	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52605	NC_014652	AT	3	6	2284977	2284982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52606	NC_014652	AGG	2	6	2285031	2285036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52607	NC_014652	TGC	2	6	2285073	2285078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128410
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52615	NC_014652	A	7	7	2285508	2285514	100 %	0 %	0 %	0 %	312128410
52616	NC_014652	TATTG	2	10	2285536	2285545	20 %	60 %	20 %	0 %	312128410
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52619	NC_014652	GCA	2	6	2285895	2285900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128410
52620	NC_014652	ACT	2	6	2285945	2285950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128410
52621	NC_014652	AC	3	6	2285951	2285956	50 %	0 %	0 %	50 %	312128410
52622	NC_014652	TTC	2	6	2285982	2285987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128410
52623	NC_014652	TA	3	6	2286115	2286120	50 %	50 %	0 %	0 %	312128410
52624	NC_014652	TGC	2	6	2286132	2286137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128410
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52627	NC_014652	GCA	2	6	2286211	2286216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128410
52628	NC_014652	TG	3	6	2286258	2286263	0 %	50 %	50 %	0 %	312128410
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52630	NC_014652	A	6	6	2286341	2286346	100 %	0 %	0 %	0 %	312128410
52631	NC_014652	A	6	6	2286352	2286357	100 %	0 %	0 %	0 %	312128410
52632	NC_014652	CAG	2	6	2286376	2286381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128410
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52651	NC_014652	TATTGT	2	12	2287096	2287107	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312128412
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52654	NC_014652	ATC	2	6	2287132	2287137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128412
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52657	NC_014652	T	7	7	2287276	2287282	0 %	100 %	0 %	0 %	312128412
52658	NC_014652	T	6	6	2287307	2287312	0 %	100 %	0 %	0 %	312128412
52659	NC_014652	T	6	6	2287344	2287349	0 %	100 %	0 %	0 %	312128413
52660	NC_014652	GCC	2	6	2287422	2287427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312128413
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52680	NC_014652	T	7	7	2288400	2288406	0 %	100 %	0 %	0 %	312128413
52681	NC_014652	TGCA	2	8	2288430	2288437	25 %	25 %	25 %	25 %	312128413
52682	NC_014652	CCA	2	6	2288449	2288454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312128413
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52685	NC_014652	T	6	6	2288539	2288544	0 %	100 %	0 %	0 %	312128413
52686	NC_014652	TCA	2	6	2288572	2288577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128413
52687	NC_014652	CAA	2	6	2288591	2288596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128413
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52689	NC_014652	CTT	2	6	2288705	2288710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52690	NC_014652	T	7	7	2288713	2288719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52691	NC_014652	T	6	6	2288740	2288745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52692	NC_014652	ATA	2	6	2288758	2288763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52693	NC_014652	AT	4	8	2288786	2288793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52694	NC_014652	AGG	2	6	2288835	2288840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52695	NC_014652	A	6	6	2288845	2288850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52696	NC_014652	GAA	2	6	2288866	2288871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128414
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52698	NC_014652	AAT	2	6	2288967	2288972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128414
52699	NC_014652	TTGAAG	2	12	2288987	2288998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128414
52700	NC_014652	TCA	2	6	2289012	2289017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128414
52701	NC_014652	CACTG	2	10	2289028	2289037	20 %	20 %	20 %	40 %	312128414
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52717	NC_014652	TTGA	2	8	2289574	2289581	25 %	50 %	25 %	0 %	312128414
52718	NC_014652	TCT	2	6	2289606	2289611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128414
52719	NC_014652	TAT	2	6	2289640	2289645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128414
52720	NC_014652	AC	3	6	2289818	2289823	50 %	0 %	0 %	50 %	312128414
52721	NC_014652	CA	3	6	2289913	2289918	50 %	0 %	0 %	50 %	312128414
52722	NC_014652	ATA	2	6	2289994	2289999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128414
52723	NC_014652	AGA	2	6	2290062	2290067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128414
52724	NC_014652	GAA	2	6	2290082	2290087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312128414
52725	NC_014652	A	6	6	2290119	2290124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52726	NC_014652	TAT	2	6	2290171	2290176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52727	NC_014652	TCTTT	2	10	2290191	2290200	0 %	80 %	0 %	20 %	312128415
52728	NC_014652	A	6	6	2290202	2290207	100 %	0 %	0 %	0 %	312128415
52729	NC_014652	CAA	3	9	2290254	2290262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128415
52730	NC_014652	CTG	2	6	2290281	2290286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128415
52731	NC_014652	CAA	2	6	2290338	2290343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128415
52732	NC_014652	AGC	2	6	2290366	2290371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312128415
52733	NC_014652	TCT	2	6	2290406	2290411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128415
52734	NC_014652	GAAAT	2	10	2290417	2290426	60 %	20 %	20 %	0 %	312128415
52735	NC_014652	A	6	6	2290442	2290447	100 %	0 %	0 %	0 %	312128415
52736	NC_014652	TTCCC	2	10	2290472	2290481	0 %	40 %	0 %	60 %	312128415
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52979	NC_014652	TCA	2	6	2302333	2302338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128426
52980	NC_014652	AAT	2	6	2302349	2302354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312128426
52981	NC_014652	TAT	2	6	2302428	2302433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128426
52982	NC_014652	T	7	7	2302463	2302469	0 %	100 %	0 %	0 %	312128426
52983	NC_014652	TAT	2	6	2302543	2302548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52984	NC_014652	ACC	2	6	2302557	2302562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52985	NC_014652	TA	3	6	2302568	2302573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52986	NC_014652	TAT	2	6	2302592	2302597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52987	NC_014652	AT	3	6	2302672	2302677	50 %	50 %	0 %	0 %	312128427
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