MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_014652	A	6	6	2195630	2195635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50502	NC_014652	A	9	9	2195649	2195657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50504	NC_014652	TCT	2	6	2195695	2195700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128332
50505	NC_014652	TCAA	2	8	2195713	2195720	50 %	25 %	0 %	25 %	312128332
50506	NC_014652	T	6	6	2195722	2195727	0 %	100 %	0 %	0 %	312128332
50507	NC_014652	CTG	2	6	2195779	2195784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128332
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50510	NC_014652	TA	3	6	2195871	2195876	50 %	50 %	0 %	0 %	312128332
50511	NC_014652	TCA	2	6	2195960	2195965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128332
50512	NC_014652	T	6	6	2195979	2195984	0 %	100 %	0 %	0 %	312128332
50513	NC_014652	TCT	2	6	2196028	2196033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128332
50514	NC_014652	TCT	2	6	2196047	2196052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128332
50515	NC_014652	GC	3	6	2196063	2196068	0 %	0 %	50 %	50 %	312128332
50516	NC_014652	TA	3	6	2196100	2196105	50 %	50 %	0 %	0 %	312128332
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50521	NC_014652	CAA	2	6	2196248	2196253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312128332
50522	NC_014652	TCTTT	2	10	2196287	2196296	0 %	80 %	0 %	20 %	312128332
50523	NC_014652	TCT	2	6	2196311	2196316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312128332
50524	NC_014652	ATC	2	6	2196345	2196350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128332
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50526	NC_014652	ACC	2	6	2196374	2196379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50527	NC_014652	T	6	6	2196393	2196398	0 %	100 %	0 %	0 %	312128333
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50543	NC_014652	CAT	2	6	2197402	2197407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128333
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50545	NC_014652	ATT	2	6	2197471	2197476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312128334
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50547	NC_014652	CTGT	3	12	2197536	2197547	0 %	50 %	25 %	25 %	312128334
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50573	NC_014652	TCA	2	6	2198725	2198730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128334
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50586	NC_014652	TGC	2	6	2199370	2199375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312128334
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50589	NC_014652	TAT	2	6	2199463	2199468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50601	NC_014652	ACT	2	6	2200100	2200105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312128335
50602	NC_014652	TGA	2	6	2200165	2200170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312128335
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50615	NC_014652	TCC	2	6	2200732	2200737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50616	NC_014652	T	6	6	2200750	2200755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50618	NC_014652	TTA	2	6	2200815	2200820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50849	NC_014652	TCTTT	2	10	2210522	2210531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50850	NC_014652	CAC	2	6	2210582	2210587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50851	NC_014652	TAA	2	6	2210604	2210609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50852	NC_014652	A	7	7	2210630	2210636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50853	NC_014652	AATAA	2	10	2210641	2210650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50854	NC_014652	ATCC	2	8	2210710	2210717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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50857	NC_014652	TTCT	2	8	2210839	2210846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50858	NC_014652	C	6	6	2210874	2210879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50859	NC_014652	TAT	2	6	2210921	2210926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50860	NC_014652	ACT	2	6	2211068	2211073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50861	NC_014652	GAG	2	6	2211077	2211082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50862	NC_014652	TGG	2	6	2211145	2211150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312128345
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50896	NC_014652	TTTA	2	8	2212557	2212564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50897	NC_014652	GATT	2	8	2212572	2212579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50898	NC_014652	T	6	6	2212578	2212583	0 %	100 %	0 %	0 %	312128346
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50970	NC_014652	AGA	2	6	2216387	2216392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50971	NC_014652	TG	3	6	2216410	2216415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50972	NC_014652	A	6	6	2216439	2216444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50974	NC_014652	CTTT	3	12	2216477	2216488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50975	NC_014652	TTC	2	6	2216514	2216519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50976	NC_014652	ATTTT	2	10	2216549	2216558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50977	NC_014652	TA	3	6	2216601	2216606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50978	NC_014652	AT	4	8	2216614	2216621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50979	NC_014652	TTAA	2	8	2216641	2216648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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