MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 10166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	CGG	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014534	ATCTTT	2	12	89	100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014534	TAAT	2	8	261	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014534	TAAC	2	8	278	285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014534	TTG	2	6	294	299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014534	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014534	CTCA	2	8	503	510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014534	CTTTAT	2	12	558	569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014534	TAAA	2	8	571	578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014534	GATAAG	2	12	582	593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	TCACG	2	10	595	604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014534	T	6	6	614	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	TG	3	6	641	646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014534	T	6	6	654	659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014534	ATT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014534	T	8	8	680	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014534	CAG	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014534	T	6	6	730	735	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
19	NC_014534	TTC	2	6	739	744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591290
20	NC_014534	GCC	3	9	773	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591290
21	NC_014534	T	6	6	814	819	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
22	NC_014534	CTTTT	2	10	823	832	0 %	80 %	0 %	20 %	307591290
23	NC_014534	CTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591290
24	NC_014534	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
25	NC_014534	GTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014534	CTT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014534	TTA	2	6	947	952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014534	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014534	GGCT	2	8	1054	1061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014534	A	6	6	1084	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014534	AACC	2	8	1103	1110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014534	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014534	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014534	TAC	2	6	1163	1168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014534	AATT	2	8	1217	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014534	CATT	2	8	1249	1256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014534	TGC	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014534	CTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014534	ACC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014534	GATA	2	8	1587	1594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014534	TGA	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014534	TCA	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014534	CTA	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014534	TCA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014534	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014534	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014534	A	6	6	1762	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014534	TGG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014534	GAT	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014534	AGGG	2	8	1964	1971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014534	GCT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014534	TGC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014534	TGAAGA	2	12	2061	2072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014534	CAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014534	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014534	A	6	6	2110	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014534	ACCGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014534	GAT	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014534	CGC	2	6	2271	2276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014534	ATCCG	2	10	2286	2295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014534	GTT	2	6	2335	2340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014534	GCC	2	6	2390	2395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014534	GCACTC	2	12	2445	2456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014534	GTG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014534	GGAG	2	8	2550	2557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014534	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014534	G	6	6	2650	2655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014534	CGT	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014534	TCAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014534	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014534	CGG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014534	ATC	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014534	GTC	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014534	GTC	3	9	2970	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014534	CCG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014534	TTTG	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014534	CTACAG	2	12	3351	3362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014534	CGT	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014534	GT	3	6	3416	3421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014534	T	6	6	3470	3475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014534	AAT	2	6	3517	3522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014534	AAT	3	9	3587	3595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014534	TGA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014534	ACC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014534	A	7	7	3696	3702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014534	GAT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014534	A	6	6	3758	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014534	CAC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014534	CA	3	6	3843	3848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014534	CA	3	6	3875	3880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014534	TCA	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014534	GAA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014534	TCC	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014534	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014534	GAC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014534	CTC	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014534	GCT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014534	ATT	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014534	TC	3	6	4250	4255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014534	CAAA	2	8	4330	4337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014534	TGC	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014534	AATA	2	8	4383	4390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014534	T	6	6	4429	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014534	TGAAAA	2	12	4486	4497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591291
105	NC_014534	AC	3	6	4521	4526	50 %	0 %	0 %	50 %	307591291
106	NC_014534	GAA	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591291
107	NC_014534	AGA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591291
108	NC_014534	ACG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591291
109	NC_014534	ATACTC	2	12	4746	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
110	NC_014534	TGG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591292
111	NC_014534	CAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
112	NC_014534	ATT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591292
113	NC_014534	TCT	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591292
114	NC_014534	TC	3	6	5044	5049	0 %	50 %	0 %	50 %	307591292
115	NC_014534	CTA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
116	NC_014534	GATT	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014534	ATT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014534	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014534	ATTG	2	8	5141	5148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014534	CCTT	2	8	5221	5228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014534	ATCA	2	8	5280	5287	50 %	25 %	0 %	25 %	307591293
122	NC_014534	GAT	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
123	NC_014534	GGC	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591293
124	NC_014534	AG	4	8	5546	5553	50 %	0 %	50 %	0 %	307591293
125	NC_014534	TTCG	2	8	5660	5667	0 %	50 %	25 %	25 %	307591293
126	NC_014534	ACA	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591293
127	NC_014534	CGC	3	9	5876	5884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591293
128	NC_014534	CGC	2	6	5888	5893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591293
129	NC_014534	GAC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591293
130	NC_014534	TCA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
131	NC_014534	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	307591293
132	NC_014534	GAA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
133	NC_014534	CTAC	2	8	6022	6029	25 %	25 %	0 %	50 %	307591293
134	NC_014534	AGA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
135	NC_014534	TGC	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591293
136	NC_014534	CTT	2	6	6260	6265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591293
137	NC_014534	ATT	2	6	6376	6381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591293
138	NC_014534	TTG	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591293
139	NC_014534	TGA	3	9	6488	6496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
140	NC_014534	AAG	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
141	NC_014534	CTA	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
142	NC_014534	ATC	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
143	NC_014534	CAAA	2	8	6737	6744	75 %	0 %	0 %	25 %	307591293
144	NC_014534	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
145	NC_014534	A	6	6	6933	6938	100 %	0 %	0 %	0 %	307591293
146	NC_014534	ATT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591293
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152	NC_014534	TCA	2	6	7303	7308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
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171	NC_014534	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591294
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190	NC_014534	GTC	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_014534	A	6	6	13049	13054	100 %	0 %	0 %	0 %	307591298
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281	NC_014534	TCC	2	6	13312	13317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591299
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284	NC_014534	CT	3	6	13651	13656	0 %	50 %	0 %	50 %	307591299
285	NC_014534	AGG	2	6	13689	13694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591299
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412	NC_014534	TTTA	2	8	19758	19765	25 %	75 %	0 %	0 %	307591303
413	NC_014534	TTC	2	6	19797	19802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591303
414	NC_014534	T	6	6	19820	19825	0 %	100 %	0 %	0 %	307591303
415	NC_014534	TCC	2	6	19827	19832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
416	NC_014534	T	6	6	19853	19858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_014534	ATTT	2	8	19869	19876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_014534	T	6	6	19874	19879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_014534	ATT	2	6	19880	19885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_014534	T	8	8	19927	19934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_014534	AAT	2	6	19936	19941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_014534	TTAT	2	8	19971	19978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014534	T	6	6	19985	19990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_014534	TAA	2	6	20001	20006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_014534	TTA	2	6	20007	20012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_014534	T	6	6	20032	20037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_014534	CTC	2	6	20041	20046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_014534	T	8	8	20077	20084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_014534	AGT	2	6	20128	20133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_014534	T	6	6	20144	20149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_014534	AAG	2	6	20150	20155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_014534	CTT	2	6	20231	20236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_014534	TTA	2	6	20248	20253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014534	TTC	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_014534	CAT	2	6	20436	20441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591304
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440	NC_014534	G	6	6	20542	20547	0 %	0 %	100 %	0 %	307591304
441	NC_014534	CGG	2	6	20563	20568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591304
442	NC_014534	AAC	2	6	20588	20593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591304
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446	NC_014534	GGTT	2	8	20901	20908	0 %	50 %	50 %	0 %	307591304
447	NC_014534	TGA	2	6	20942	20947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591304
448	NC_014534	TCA	2	6	21012	21017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591304
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450	NC_014534	GCT	2	6	21219	21224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591304
451	NC_014534	TGA	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591304
452	NC_014534	CCA	2	6	21315	21320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591304
453	NC_014534	TA	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	307591304
454	NC_014534	GTG	2	6	21377	21382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591304
455	NC_014534	CCA	2	6	21446	21451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591304
456	NC_014534	AAC	2	6	21496	21501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591304
457	NC_014534	AAT	2	6	21529	21534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591304
458	NC_014534	CTA	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591304
459	NC_014534	CATCC	2	10	21711	21720	20 %	20 %	0 %	60 %	307591304
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468	NC_014534	TCG	2	6	22319	22324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591304
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492	NC_014534	TCT	2	6	23402	23407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_014534	GAT	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
494	NC_014534	A	6	6	23490	23495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_014534	TTAA	2	8	23590	23597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_014534	ATTT	2	8	23610	23617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_014534	GTGTC	2	10	23645	23654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
498	NC_014534	CCA	2	6	23730	23735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_014534	CCG	2	6	23740	23745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_014534	T	6	6	23749	23754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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