MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 94496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	AGA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
2	NC_014376	CTT	2	6	172	177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384445
3	NC_014376	A	6	6	256	261	100 %	0 %	0 %	0 %	302384445
4	NC_014376	TCT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384445
5	NC_014376	AGA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
6	NC_014376	GTT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384445
7	NC_014376	AAG	2	6	347	352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
8	NC_014376	CAT	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384445
9	NC_014376	TGGT	2	8	464	471	0 %	50 %	50 %	0 %	302384445
10	NC_014376	A	6	6	609	614	100 %	0 %	0 %	0 %	302384445
11	NC_014376	TAA	2	6	684	689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384445
12	NC_014376	TC	3	6	698	703	0 %	50 %	0 %	50 %	302384445
13	NC_014376	CAA	2	6	729	734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384445
14	NC_014376	TTC	2	6	740	745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384445
15	NC_014376	TCA	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384445
16	NC_014376	GAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
17	NC_014376	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384445
18	NC_014376	A	6	6	829	834	100 %	0 %	0 %	0 %	302384445
19	NC_014376	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384445
20	NC_014376	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
21	NC_014376	AGG	2	6	974	979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384445
22	NC_014376	TCA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384445
23	NC_014376	CAAC	2	8	1025	1032	50 %	0 %	0 %	50 %	302384445
24	NC_014376	GAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
25	NC_014376	CAT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384445
26	NC_014376	GGT	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384445
27	NC_014376	CTC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384445
28	NC_014376	GAT	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384445
29	NC_014376	AGG	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384445
30	NC_014376	ACC	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384445
31	NC_014376	ATC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384445
32	NC_014376	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	302384445
33	NC_014376	ATA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384445
34	NC_014376	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384445
35	NC_014376	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014376	CTA	3	9	1637	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014376	ACG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014376	TAT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014376	CAA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014376	ACC	2	6	1789	1794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384446
41	NC_014376	GCT	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384446
42	NC_014376	CT	3	6	1957	1962	0 %	50 %	0 %	50 %	302384446
43	NC_014376	CAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384446
44	NC_014376	TGA	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384446
45	NC_014376	AGGGA	2	10	2048	2057	40 %	0 %	60 %	0 %	302384446
46	NC_014376	AAG	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384446
47	NC_014376	ATG	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384446
48	NC_014376	GGT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384446
49	NC_014376	TGGG	2	8	2342	2349	0 %	25 %	75 %	0 %	302384446
50	NC_014376	TTC	2	6	2374	2379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384446
51	NC_014376	ACCA	2	8	2383	2390	50 %	0 %	0 %	50 %	302384446
52	NC_014376	TTG	2	6	2417	2422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384446
53	NC_014376	AAG	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384446
54	NC_014376	CAT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384446
55	NC_014376	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384446
56	NC_014376	GAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384446
57	NC_014376	GAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384446
58	NC_014376	GAA	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384446
59	NC_014376	AT	3	6	2790	2795	50 %	50 %	0 %	0 %	302384446
60	NC_014376	TTC	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384446
61	NC_014376	GCA	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384446
62	NC_014376	GA	3	6	2856	2861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014376	GA	3	6	2868	2873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014376	AG	3	6	2920	2925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014376	AT	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	302384447
66	NC_014376	AGC	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384447
67	NC_014376	TGG	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384447
68	NC_014376	AG	3	6	3071	3076	50 %	0 %	50 %	0 %	302384447
69	NC_014376	GAAA	2	8	3077	3084	75 %	0 %	25 %	0 %	302384447
70	NC_014376	GTA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384447
71	NC_014376	GC	3	6	3177	3182	0 %	0 %	50 %	50 %	302384447
72	NC_014376	A	6	6	3190	3195	100 %	0 %	0 %	0 %	302384447
73	NC_014376	CCAT	2	8	3221	3228	25 %	25 %	0 %	50 %	302384447
74	NC_014376	ATG	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384448
75	NC_014376	TCAG	2	8	3288	3295	25 %	25 %	25 %	25 %	302384448
76	NC_014376	A	6	6	3451	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	302384448
77	NC_014376	GAA	3	9	3487	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384448
78	NC_014376	AAG	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384448
79	NC_014376	T	7	7	3572	3578	0 %	100 %	0 %	0 %	302384448
80	NC_014376	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	302384448
81	NC_014376	CAA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384448
82	NC_014376	CCGG	2	8	3736	3743	0 %	0 %	50 %	50 %	302384448
83	NC_014376	TG	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	302384448
84	NC_014376	GGAAA	2	10	3791	3800	60 %	0 %	40 %	0 %	302384448
85	NC_014376	TGGA	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	302384448
86	NC_014376	ATCC	2	8	3850	3857	25 %	25 %	0 %	50 %	302384448
87	NC_014376	GAG	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384448
88	NC_014376	GCAG	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	302384448
89	NC_014376	AAC	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384448
90	NC_014376	GAT	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384448
91	NC_014376	TCA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384448
92	NC_014376	GCA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384448
93	NC_014376	CAG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384448
94	NC_014376	A	6	6	4107	4112	100 %	0 %	0 %	0 %	302384448
95	NC_014376	TGA	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384448
96	NC_014376	TAT	2	6	4149	4154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384448
97	NC_014376	CAG	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384448
98	NC_014376	TTGC	2	8	4184	4191	0 %	50 %	25 %	25 %	302384448
99	NC_014376	AATC	2	8	4195	4202	50 %	25 %	0 %	25 %	302384448
100	NC_014376	AGATA	2	10	4264	4273	60 %	20 %	20 %	0 %	302384448
101	NC_014376	GGT	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384448
102	NC_014376	AGG	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014376	GTAT	2	8	4438	4445	25 %	50 %	25 %	0 %	302384449
104	NC_014376	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384449
105	NC_014376	ATCC	2	8	4551	4558	25 %	25 %	0 %	50 %	302384449
106	NC_014376	CGGG	2	8	4586	4593	0 %	0 %	75 %	25 %	302384449
107	NC_014376	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384449
108	NC_014376	CGG	2	6	4630	4635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384449
109	NC_014376	TCC	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384449
110	NC_014376	GCGG	2	8	4662	4669	0 %	0 %	75 %	25 %	302384449
111	NC_014376	CGG	3	9	4676	4684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384449
112	NC_014376	CGG	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384449
113	NC_014376	GGGT	2	8	4714	4721	0 %	25 %	75 %	0 %	302384449
114	NC_014376	TTC	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384449
115	NC_014376	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384449
116	NC_014376	GA	4	8	4989	4996	50 %	0 %	50 %	0 %	302384449
117	NC_014376	GGC	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384449
118	NC_014376	GCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384449
119	NC_014376	AT	3	6	5164	5169	50 %	50 %	0 %	0 %	302384449
120	NC_014376	AAT	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384449
121	NC_014376	AGG	2	6	5201	5206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384449
122	NC_014376	AGAA	2	8	5262	5269	75 %	0 %	25 %	0 %	302384449
123	NC_014376	CAT	2	6	5333	5338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384449
124	NC_014376	GAG	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384449
125	NC_014376	TAT	2	6	5445	5450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384449
126	NC_014376	CGG	2	6	5654	5659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384449
127	NC_014376	TCCT	2	8	5698	5705	0 %	50 %	0 %	50 %	302384449
128	NC_014376	AGGCT	2	10	5734	5743	20 %	20 %	40 %	20 %	302384449
129	NC_014376	ATC	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384449
130	NC_014376	AGG	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384449
131	NC_014376	GGTAT	2	10	5993	6002	20 %	40 %	40 %	0 %	302384449
132	NC_014376	ACAATA	2	12	6052	6063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302384449
133	NC_014376	GA	3	6	6088	6093	50 %	0 %	50 %	0 %	302384449
134	NC_014376	ACC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384449
135	NC_014376	AGA	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384449
136	NC_014376	TCA	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384449
137	NC_014376	TGAA	2	8	6160	6167	50 %	25 %	25 %	0 %	302384449
138	NC_014376	ACC	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384449
139	NC_014376	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014376	ATG	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384450
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248	NC_014376	A	6	6	11057	11062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014376	AATG	2	8	11068	11075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014376	AAT	2	6	11094	11099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014376	AGG	2	6	11170	11175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014376	TTTA	2	8	11178	11185	25 %	75 %	0 %	0 %	302384452
253	NC_014376	AGC	2	6	11253	11258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384452
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258	NC_014376	TTA	2	6	11470	11475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384452
259	NC_014376	AGG	3	9	11498	11506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_014376	TGG	2	6	11687	11692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384453
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266	NC_014376	CAAA	2	8	11791	11798	75 %	0 %	0 %	25 %	302384453
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268	NC_014376	ATT	3	9	11837	11845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384453
269	NC_014376	CAGG	2	8	11870	11877	25 %	0 %	50 %	25 %	302384453
270	NC_014376	T	6	6	11975	11980	0 %	100 %	0 %	0 %	302384453
271	NC_014376	ATC	2	6	11986	11991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384453
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390	NC_014376	ATT	2	6	18051	18056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_014376	T	6	6	18055	18060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_014376	A	6	6	18075	18080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_014376	CTA	2	6	18107	18112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_014376	TA	3	6	18111	18116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_014376	A	6	6	18136	18141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_014376	TAAAA	2	10	18142	18151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_014376	A	7	7	18148	18154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_014376	ACAGA	2	10	18161	18170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
399	NC_014376	AAGA	2	8	18202	18209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
400	NC_014376	ACA	2	6	18210	18215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_014376	AGA	2	6	18233	18238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_014376	TAA	2	6	18268	18273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_014376	ACA	2	6	18344	18349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_014376	AAAT	2	8	18361	18368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_014376	TAGT	2	8	18373	18380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
406	NC_014376	A	6	6	18484	18489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_014376	AAGC	2	8	18500	18507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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430	NC_014376	TAG	2	6	19670	19675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_014376	CAG	2	6	19677	19682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_014376	GGA	2	6	19722	19727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_014376	AC	3	6	19773	19778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
435	NC_014376	AC	3	6	19942	19947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
436	NC_014376	AGG	2	6	20001	20006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014376	CCT	2	6	20083	20088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_014376	GAA	3	9	20096	20104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014376	AAT	2	6	20197	20202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014376	A	6	6	20240	20245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_014376	AAGC	2	8	20256	20263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
442	NC_014376	GGTG	2	8	20423	20430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014376	A	8	8	20442	20449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014376	TA	3	6	20468	20473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014376	CAG	2	6	20541	20546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_014376	TA	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_014376	TGAGTT	2	12	20588	20599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_014376	AT	3	6	20719	20724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014376	CAAA	2	8	20799	20806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_014376	ACCCGC	2	12	20887	20898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_014376	TAA	2	6	20923	20928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014376	GAG	2	6	20997	21002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014376	GGA	2	6	21125	21130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014376	AAAG	2	8	21131	21138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014376	GCG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_014376	AAG	2	6	21220	21225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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