MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014329	ATC	2	6	208089	208094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_014329	TCAC	2	8	208253	208260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_014329	GCT	2	6	208281	208286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_014329	TGT	2	6	208289	208294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014329	CGG	2	6	208316	208321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_014329	GGA	2	6	208347	208352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014329	CCA	2	6	208372	208377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_014329	CAG	2	6	208400	208405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_014329	ATCT	2	8	208438	208445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_014329	ATC	2	6	208514	208519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_014329	ACGA	2	8	208545	208552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_014329	GAC	2	6	208593	208598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_014329	AAG	2	6	208608	208613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014329	GC	3	6	208729	208734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_014329	TCG	2	6	208741	208746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_014329	CAT	2	6	208864	208869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_014329	G	6	6	208887	208892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014329	AGT	2	6	208956	208961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014329	TG	3	6	208965	208970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014329	AGC	2	6	208987	208992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_014329	GT	3	6	208997	209002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014329	TGA	2	6	209010	209015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014329	CA	3	6	209032	209037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_014329	TGAT	2	8	209158	209165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014329	CTA	2	6	209188	209193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_014329	CGG	2	6	209245	209250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857612
4027	NC_014329	GTG	2	6	209268	209273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857612
4028	NC_014329	CGG	2	6	209294	209299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857612
4029	NC_014329	ATTG	2	8	209349	209356	25 %	50 %	25 %	0 %	300857612
4030	NC_014329	CTC	2	6	209390	209395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857612
4031	NC_014329	TGC	2	6	209399	209404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857612
4032	NC_014329	GGC	2	6	209492	209497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_014329	ATC	2	6	209526	209531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_014329	GCA	2	6	209582	209587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857613
4035	NC_014329	CA	3	6	209630	209635	50 %	0 %	0 %	50 %	300857613
4036	NC_014329	TGG	2	6	209663	209668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857613
4037	NC_014329	TTG	2	6	209734	209739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857613
4038	NC_014329	CTT	2	6	209834	209839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857613
4039	NC_014329	GGT	2	6	209906	209911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857613
4040	NC_014329	TGA	2	6	209951	209956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857613
4041	NC_014329	TCA	2	6	209962	209967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857613
4042	NC_014329	ACT	2	6	210039	210044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_014329	CG	3	6	210125	210130	0 %	0 %	50 %	50 %	300857614
4044	NC_014329	GCA	2	6	210196	210201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857614
4045	NC_014329	TGG	2	6	210259	210264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857614
4046	NC_014329	TCA	2	6	210277	210282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857614
4047	NC_014329	CGG	2	6	210285	210290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_014329	TTC	2	6	210324	210329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_014329	TTG	2	6	210347	210352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014329	AAC	2	6	210465	210470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_014329	AC	3	6	210483	210488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_014329	CAAA	2	8	210506	210513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_014329	CGAA	2	8	210601	210608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_014329	GC	3	6	210609	210614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_014329	GTA	2	6	210667	210672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014329	AAC	2	6	210673	210678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_014329	GCAA	2	8	210869	210876	50 %	0 %	25 %	25 %	300857615
4058	NC_014329	ACA	2	6	210908	210913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857615
4059	NC_014329	GCA	2	6	210962	210967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857615
4060	NC_014329	TTC	2	6	211011	211016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857615
4061	NC_014329	GTC	2	6	211020	211025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857615
4062	NC_014329	GTG	2	6	211032	211037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857615
4063	NC_014329	GTC	2	6	211041	211046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857615
4064	NC_014329	GC	3	6	211135	211140	0 %	0 %	50 %	50 %	300857615
4065	NC_014329	AAT	2	6	211226	211231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857615
4066	NC_014329	TAA	2	6	211334	211339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857615
4067	NC_014329	TTC	2	6	211384	211389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857615
4068	NC_014329	AAC	2	6	211623	211628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_014329	AGA	2	6	211646	211651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857616
4070	NC_014329	ACC	2	6	211666	211671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857616
4071	NC_014329	GGA	2	6	211737	211742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857616
4072	NC_014329	TCGC	2	8	211793	211800	0 %	25 %	25 %	50 %	300857616
4073	NC_014329	GAC	2	6	211918	211923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857616
4074	NC_014329	CGC	2	6	211932	211937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857616
4075	NC_014329	GAA	2	6	211957	211962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857616
4076	NC_014329	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	300857616
4077	NC_014329	GCG	2	6	212077	212082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857616
4078	NC_014329	GCT	2	6	212103	212108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_014329	AGC	2	6	212127	212132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4080	NC_014329	TGT	2	6	212133	212138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
4081	NC_014329	GTC	2	6	212153	212158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4082	NC_014329	GTT	2	6	212174	212179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
4083	NC_014329	TGG	2	6	212215	212220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
4084	NC_014329	TCT	2	6	212421	212426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857617
4085	NC_014329	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	300857617
4086	NC_014329	TGC	2	6	212474	212479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4087	NC_014329	GCG	2	6	212496	212501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4088	NC_014329	CGGG	2	8	212514	212521	0 %	0 %	75 %	25 %	300857617
4089	NC_014329	TCG	2	6	212523	212528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4090	NC_014329	CCG	2	6	212529	212534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857617
4091	NC_014329	GA	3	6	212557	212562	50 %	0 %	50 %	0 %	300857617
4092	NC_014329	GTT	2	6	212589	212594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
4093	NC_014329	AT	3	6	212607	212612	50 %	50 %	0 %	0 %	300857617
4094	NC_014329	GTG	2	6	212670	212675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
4095	NC_014329	GGC	2	6	212684	212689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4096	NC_014329	TGA	2	6	212740	212745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857617
4097	NC_014329	GGTC	2	8	212842	212849	0 %	25 %	50 %	25 %	300857617
4098	NC_014329	CAC	2	6	212874	212879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857617
4099	NC_014329	AGC	2	6	212900	212905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4100	NC_014329	GCC	2	6	213200	213205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857617
4101	NC_014329	GGC	2	6	213278	213283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4102	NC_014329	CCA	2	6	213325	213330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857617
4103	NC_014329	GGA	2	6	213332	213337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857617
4104	NC_014329	GAA	2	6	213346	213351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857617
4105	NC_014329	GAA	2	6	213390	213395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857617
4106	NC_014329	GAT	2	6	213434	213439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857617
4107	NC_014329	GGT	2	6	213527	213532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
4108	NC_014329	T	6	6	213578	213583	0 %	100 %	0 %	0 %	300857617
4109	NC_014329	GCG	2	6	213630	213635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4110	NC_014329	G	6	6	213658	213663	0 %	0 %	100 %	0 %	300857617
4111	NC_014329	CTT	3	9	213703	213711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857617
4112	NC_014329	TCA	2	6	213727	213732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857617
4113	NC_014329	AGG	2	6	213799	213804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857617
4114	NC_014329	TGC	3	9	213881	213889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4115	NC_014329	GTT	2	6	213905	213910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
4116	NC_014329	GCG	2	6	214026	214031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4117	NC_014329	TCG	2	6	214038	214043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4118	NC_014329	AAG	2	6	214061	214066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857617
4119	NC_014329	CG	3	6	214145	214150	0 %	0 %	50 %	50 %	300857617
4120	NC_014329	GAC	2	6	214208	214213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4121	NC_014329	CTGT	2	8	214225	214232	0 %	50 %	25 %	25 %	300857617
4122	NC_014329	TGG	2	6	214309	214314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
4123	NC_014329	TTG	2	6	214363	214368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
4124	NC_014329	GTGC	2	8	214374	214381	0 %	25 %	50 %	25 %	300857617
4125	NC_014329	CTG	2	6	214438	214443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
4126	NC_014329	GCG	2	6	214452	214457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
4127	NC_014329	GTTC	2	8	214647	214654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_014329	AGG	2	6	214668	214673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014329	TCA	2	6	214677	214682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_014329	TGA	2	6	214695	214700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014329	ACGT	2	8	214701	214708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_014329	TGA	2	6	214869	214874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857618
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4143	NC_014329	AGT	2	6	215806	215811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_014329	GGT	2	6	215894	215899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857621
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4154	NC_014329	T	7	7	216260	216266	0 %	100 %	0 %	0 %	300857621
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4163	NC_014329	GACT	2	8	216781	216788	25 %	25 %	25 %	25 %	300857622
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4231	NC_014329	TCC	2	6	220287	220292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4232	NC_014329	ATC	2	6	220324	220329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857627
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4373	NC_014329	CAA	2	6	227028	227033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857634
4374	NC_014329	CGA	2	6	227034	227039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857634
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4376	NC_014329	GAT	2	6	227098	227103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857634
4377	NC_014329	TGCGC	2	10	227104	227113	0 %	20 %	40 %	40 %	300857634
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4411	NC_014329	CATTG	2	10	228953	228962	20 %	40 %	20 %	20 %	300857636
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4419	NC_014329	AAC	2	6	229108	229113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4482	NC_014329	GC	3	6	232187	232192	0 %	0 %	50 %	50 %	300857640
4483	NC_014329	TGGCT	2	10	232193	232202	0 %	40 %	40 %	20 %	300857640
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4485	NC_014329	ATT	2	6	232322	232327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_014329	AAT	2	6	232342	232347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_014329	T	7	7	232354	232360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4488	NC_014329	AC	3	6	232391	232396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4489	NC_014329	TGG	2	6	232428	232433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_014329	GTG	2	6	232478	232483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_014329	CAG	2	6	232742	232747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857641
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4493	NC_014329	TGG	2	6	232808	232813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4495	NC_014329	T	6	6	232838	232843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_014329	G	6	6	232864	232869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_014329	TTA	2	6	232893	232898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857642
4498	NC_014329	GTA	2	6	232932	232937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857642
4499	NC_014329	TCG	2	6	233038	233043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
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