MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014329	ACCTC	2	10	2327613	2327622	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44002	NC_014329	CTA	2	6	2327674	2327679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44003	NC_014329	TTC	2	6	2327732	2327737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44004	NC_014329	G	6	6	2327867	2327872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44005	NC_014329	CCA	2	6	2327897	2327902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859516
44006	NC_014329	ATG	2	6	2327912	2327917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859516
44007	NC_014329	TGG	2	6	2328040	2328045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859516
44008	NC_014329	CGA	2	6	2328081	2328086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859516
44009	NC_014329	CAT	2	6	2328087	2328092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859516
44010	NC_014329	TTC	2	6	2328144	2328149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859516
44011	NC_014329	TGC	2	6	2328335	2328340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859516
44012	NC_014329	ACG	2	6	2328386	2328391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859516
44013	NC_014329	CGGGCG	2	12	2328445	2328456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859516
44014	NC_014329	TCT	2	6	2328474	2328479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859516
44015	NC_014329	TA	3	6	2328516	2328521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_014329	AAAG	2	8	2328577	2328584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44017	NC_014329	AT	3	6	2328678	2328683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_014329	ACA	2	6	2328705	2328710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44019	NC_014329	ACG	2	6	2328759	2328764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859517
44020	NC_014329	CAT	2	6	2328769	2328774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859517
44021	NC_014329	CAG	2	6	2328798	2328803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859517
44022	NC_014329	GGT	2	6	2328860	2328865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859517
44023	NC_014329	TGA	2	6	2328870	2328875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859517
44024	NC_014329	CCA	2	6	2328876	2328881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859517
44025	NC_014329	CAT	2	6	2328916	2328921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859517
44026	NC_014329	ACA	2	6	2328939	2328944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859517
44027	NC_014329	AAG	2	6	2329022	2329027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859517
44028	NC_014329	CGA	2	6	2329036	2329041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859517
44029	NC_014329	CTT	2	6	2329121	2329126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859517
44030	NC_014329	TTC	3	9	2329163	2329171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859517
44031	NC_014329	CGG	3	9	2329195	2329203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859517
44032	NC_014329	GAA	2	6	2329274	2329279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859517
44033	NC_014329	CAT	2	6	2329294	2329299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859517
44034	NC_014329	GAGC	2	8	2329304	2329311	25 %	0 %	50 %	25 %	300859517
44035	NC_014329	A	6	6	2329312	2329317	100 %	0 %	0 %	0 %	300859517
44036	NC_014329	CAA	2	6	2329342	2329347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859517
44037	NC_014329	AGT	2	6	2329489	2329494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859517
44038	NC_014329	ATG	2	6	2329503	2329508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859517
44039	NC_014329	AGA	2	6	2329525	2329530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859517
44040	NC_014329	CAG	2	6	2329595	2329600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859517
44041	NC_014329	CCG	2	6	2329608	2329613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859517
44042	NC_014329	AC	3	6	2329706	2329711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44043	NC_014329	AAC	2	6	2329774	2329779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859518
44044	NC_014329	TCG	2	6	2329806	2329811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859518
44045	NC_014329	GCT	2	6	2329871	2329876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859518
44046	NC_014329	CGA	2	6	2329885	2329890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859518
44047	NC_014329	TTG	2	6	2330004	2330009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859518
44048	NC_014329	GT	3	6	2330146	2330151	0 %	50 %	50 %	0 %	300859519
44049	NC_014329	CG	3	6	2330182	2330187	0 %	0 %	50 %	50 %	300859519
44050	NC_014329	ACTT	2	8	2330286	2330293	25 %	50 %	0 %	25 %	300859519
44051	NC_014329	CAT	2	6	2330342	2330347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859519
44052	NC_014329	AAT	2	6	2330436	2330441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859519
44053	NC_014329	CGA	2	6	2330453	2330458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859519
44054	NC_014329	CGG	2	6	2330642	2330647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859519
44055	NC_014329	GAA	3	9	2330787	2330795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859519
44056	NC_014329	ATT	2	6	2330856	2330861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859519
44057	NC_014329	TTTG	2	8	2330938	2330945	0 %	75 %	25 %	0 %	300859519
44058	NC_014329	GA	3	6	2331058	2331063	50 %	0 %	50 %	0 %	300859519
44059	NC_014329	CCA	2	6	2331139	2331144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859519
44060	NC_014329	ACG	2	6	2331178	2331183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859519
44061	NC_014329	GTG	2	6	2331234	2331239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859519
44062	NC_014329	GAT	4	12	2331264	2331275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859519
44063	NC_014329	TGG	2	6	2331338	2331343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44064	NC_014329	ACC	2	6	2331360	2331365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44065	NC_014329	T	6	6	2331367	2331372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44066	NC_014329	GAT	2	6	2331475	2331480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859520
44067	NC_014329	CAG	2	6	2331499	2331504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859520
44068	NC_014329	AAT	2	6	2331510	2331515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859520
44069	NC_014329	TCA	2	6	2331523	2331528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859520
44070	NC_014329	TCC	2	6	2331537	2331542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859520
44071	NC_014329	TCG	2	6	2331591	2331596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859520
44072	NC_014329	CCA	2	6	2331697	2331702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859520
44073	NC_014329	AG	3	6	2331720	2331725	50 %	0 %	50 %	0 %	300859520
44074	NC_014329	CTT	2	6	2331907	2331912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859520
44075	NC_014329	CAG	3	9	2331931	2331939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859520
44076	NC_014329	GCT	2	6	2331951	2331956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859520
44077	NC_014329	TTC	2	6	2331959	2331964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859520
44078	NC_014329	AAG	2	6	2332068	2332073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44079	NC_014329	TTA	2	6	2332086	2332091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859521
44080	NC_014329	ACC	2	6	2332143	2332148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859521
44081	NC_014329	CAA	2	6	2332157	2332162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859521
44082	NC_014329	CTT	2	6	2332269	2332274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859521
44083	NC_014329	CAC	2	6	2332289	2332294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859521
44084	NC_014329	TCA	2	6	2332298	2332303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859521
44085	NC_014329	CTT	2	6	2332313	2332318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859521
44086	NC_014329	CGA	2	6	2332346	2332351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44087	NC_014329	GCT	2	6	2332559	2332564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44088	NC_014329	GCT	2	6	2332573	2332578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44089	NC_014329	AG	3	6	2332619	2332624	50 %	0 %	50 %	0 %	300859521
44090	NC_014329	GCA	2	6	2332631	2332636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44091	NC_014329	GTC	2	6	2332644	2332649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44092	NC_014329	GGA	2	6	2332692	2332697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859521
44093	NC_014329	ACG	2	6	2332707	2332712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859521
44094	NC_014329	ATG	2	6	2332720	2332725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859521
44095	NC_014329	ATC	2	6	2332737	2332742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859521
44096	NC_014329	AGT	2	6	2332771	2332776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859521
44097	NC_014329	TCA	2	6	2332819	2332824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859521
44098	NC_014329	AAT	2	6	2332854	2332859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859521
44099	NC_014329	GGTA	2	8	2332880	2332887	25 %	25 %	50 %	0 %	300859521
44100	NC_014329	CAC	2	6	2333024	2333029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859521
44101	NC_014329	GC	3	6	2333093	2333098	0 %	0 %	50 %	50 %	300859521
44102	NC_014329	ACC	2	6	2333115	2333120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859521
44103	NC_014329	TCTT	2	8	2333141	2333148	0 %	75 %	0 %	25 %	300859521
44104	NC_014329	TTG	2	6	2333204	2333209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859522
44105	NC_014329	TGC	2	6	2333291	2333296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859522
44106	NC_014329	TAC	2	6	2333405	2333410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859522
44107	NC_014329	GAG	2	6	2333490	2333495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859522
44108	NC_014329	ATC	2	6	2333526	2333531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859522
44109	NC_014329	TGT	2	6	2333536	2333541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859522
44110	NC_014329	AGC	2	6	2333544	2333549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859522
44111	NC_014329	TCA	2	6	2333601	2333606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859522
44112	NC_014329	CGG	2	6	2333608	2333613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859522
44113	NC_014329	G	6	6	2333645	2333650	0 %	0 %	100 %	0 %	300859522
44114	NC_014329	CTG	2	6	2333681	2333686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859522
44115	NC_014329	CCG	2	6	2333726	2333731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859522
44116	NC_014329	AGA	2	6	2333788	2333793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859522
44117	NC_014329	TGT	2	6	2333807	2333812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859522
44118	NC_014329	TCT	2	6	2333826	2333831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859522
44119	NC_014329	GGT	2	6	2333881	2333886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859522
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44121	NC_014329	GGT	2	6	2333987	2333992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859522
44122	NC_014329	CG	3	6	2334086	2334091	0 %	0 %	50 %	50 %	300859522
44123	NC_014329	GCA	3	9	2334099	2334107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859522
44124	NC_014329	GTC	2	6	2334131	2334136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859522
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44126	NC_014329	CACC	2	8	2334294	2334301	25 %	0 %	0 %	75 %	300859523
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44152	NC_014329	AGA	2	6	2335618	2335623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859524
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44154	NC_014329	CAT	2	6	2335808	2335813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859524
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44175	NC_014329	CTG	2	6	2336743	2336748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859526
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44188	NC_014329	ATG	2	6	2337146	2337151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44191	NC_014329	CTAG	2	8	2337269	2337276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44192	NC_014329	GCT	2	6	2337337	2337342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44193	NC_014329	TC	3	6	2337367	2337372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44194	NC_014329	CA	3	6	2337499	2337504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.