MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_014329	CCA	2	6	2300492	2300497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859495
43503	NC_014329	CCAG	2	8	2300517	2300524	25 %	0 %	25 %	50 %	300859495
43504	NC_014329	CGC	2	6	2300543	2300548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859495
43505	NC_014329	ATC	2	6	2300560	2300565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859495
43506	NC_014329	CAG	2	6	2300582	2300587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859495
43507	NC_014329	CCAATC	2	12	2300774	2300785	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300859495
43508	NC_014329	TCT	2	6	2300824	2300829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859495
43509	NC_014329	CT	3	6	2300909	2300914	0 %	50 %	0 %	50 %	300859495
43510	NC_014329	GCT	2	6	2300941	2300946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859495
43511	NC_014329	CCTT	2	8	2300949	2300956	0 %	50 %	0 %	50 %	300859495
43512	NC_014329	GGA	2	6	2300988	2300993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859495
43513	NC_014329	T	6	6	2301283	2301288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43514	NC_014329	GAT	2	6	2301292	2301297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_014329	ATA	2	6	2301306	2301311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43516	NC_014329	GGGCC	2	10	2301314	2301323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43517	NC_014329	CA	3	6	2301327	2301332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43518	NC_014329	CCAGC	2	10	2301336	2301345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43519	NC_014329	TTTA	2	8	2301348	2301355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43520	NC_014329	ATC	2	6	2301494	2301499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859496
43521	NC_014329	CGT	2	6	2301502	2301507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859496
43522	NC_014329	CCA	3	9	2301547	2301555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859496
43523	NC_014329	AGC	2	6	2301617	2301622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859496
43524	NC_014329	TCA	2	6	2301642	2301647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859496
43525	NC_014329	GGA	2	6	2301662	2301667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859496
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43532	NC_014329	AAG	2	6	2302040	2302045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859496
43533	NC_014329	ATAG	2	8	2302148	2302155	50 %	25 %	25 %	0 %	300859496
43534	NC_014329	GCA	2	6	2302156	2302161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859496
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43543	NC_014329	CA	3	6	2302623	2302628	50 %	0 %	0 %	50 %	300859496
43544	NC_014329	GAT	2	6	2302637	2302642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859496
43545	NC_014329	CAG	2	6	2302661	2302666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859496
43546	NC_014329	GAA	2	6	2302671	2302676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859496
43547	NC_014329	AGG	2	6	2302714	2302719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43548	NC_014329	GCC	2	6	2302755	2302760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43549	NC_014329	AACT	2	8	2302770	2302777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43550	NC_014329	AT	3	6	2302818	2302823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_014329	TCCA	2	8	2302866	2302873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43552	NC_014329	A	6	6	2302898	2302903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43553	NC_014329	A	6	6	2303020	2303025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43554	NC_014329	CGGC	2	8	2303056	2303063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43555	NC_014329	CAG	2	6	2303124	2303129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43556	NC_014329	AGGA	2	8	2303251	2303258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43557	NC_014329	CCAT	2	8	2303260	2303267	25 %	25 %	0 %	50 %	300859497
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43583	NC_014329	AAAGAT	2	12	2304479	2304490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300859498
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43585	NC_014329	CTG	2	6	2304550	2304555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859498
43586	NC_014329	A	7	7	2304595	2304601	100 %	0 %	0 %	0 %	300859498
43587	NC_014329	TTA	2	6	2304632	2304637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859498
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43592	NC_014329	TCTT	2	8	2305093	2305100	0 %	75 %	0 %	25 %	300859498
43593	NC_014329	TCC	2	6	2305101	2305106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859498
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43596	NC_014329	AT	3	6	2305209	2305214	50 %	50 %	0 %	0 %	300859498
43597	NC_014329	AC	3	6	2305275	2305280	50 %	0 %	0 %	50 %	300859498
43598	NC_014329	ATG	2	6	2305447	2305452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859498
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43601	NC_014329	ATTT	2	8	2305543	2305550	25 %	75 %	0 %	0 %	300859498
43602	NC_014329	T	6	6	2305548	2305553	0 %	100 %	0 %	0 %	300859498
43603	NC_014329	ATCT	2	8	2305619	2305626	25 %	50 %	0 %	25 %	300859498
43604	NC_014329	CA	4	8	2305642	2305649	50 %	0 %	0 %	50 %	300859498
43605	NC_014329	TTG	2	6	2305834	2305839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859498
43606	NC_014329	A	6	6	2305843	2305848	100 %	0 %	0 %	0 %	300859498
43607	NC_014329	A	6	6	2305967	2305972	100 %	0 %	0 %	0 %	300859498
43608	NC_014329	ACT	2	6	2305992	2305997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859498
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43842	NC_014329	TTC	2	6	2319810	2319815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43843	NC_014329	CTTTT	2	10	2319873	2319882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43844	NC_014329	AAG	2	6	2319884	2319889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43847	NC_014329	CAACG	2	10	2320129	2320138	40 %	0 %	20 %	40 %	300859513
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43850	NC_014329	TGC	2	6	2320299	2320304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859513
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43853	NC_014329	TCCACA	2	12	2320435	2320446	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300859513
43854	NC_014329	A	6	6	2320494	2320499	100 %	0 %	0 %	0 %	300859513
43855	NC_014329	AAAT	2	8	2320538	2320545	75 %	25 %	0 %	0 %	300859513
43856	NC_014329	TGA	2	6	2320551	2320556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859513
43857	NC_014329	GGT	2	6	2320567	2320572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859513
43858	NC_014329	AAC	2	6	2320606	2320611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859513
43859	NC_014329	GGC	2	6	2320652	2320657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859513
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43862	NC_014329	GATT	2	8	2320794	2320801	25 %	50 %	25 %	0 %	300859513
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43868	NC_014329	CGA	2	6	2321107	2321112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859514
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43879	NC_014329	CT	3	6	2321685	2321690	0 %	50 %	0 %	50 %	300859514
43880	NC_014329	AGGCG	2	10	2321792	2321801	20 %	0 %	60 %	20 %	300859514
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43893	NC_014329	C	6	6	2322374	2322379	0 %	0 %	0 %	100 %	300859514
43894	NC_014329	CAC	2	6	2322521	2322526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859514
43895	NC_014329	ATA	2	6	2322568	2322573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859514
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43913	NC_014329	TGGC	2	8	2323551	2323558	0 %	25 %	50 %	25 %	300859514
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43917	NC_014329	CAA	2	6	2323729	2323734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859514
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43958	NC_014329	TC	3	6	2325643	2325648	0 %	50 %	0 %	50 %	300859515
43959	NC_014329	GCT	2	6	2325665	2325670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859515
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43964	NC_014329	TTCT	2	8	2325969	2325976	0 %	75 %	0 %	25 %	300859515
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43970	NC_014329	TTG	2	6	2326226	2326231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859515
43971	NC_014329	GCT	3	9	2326358	2326366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859515
43972	NC_014329	AGC	2	6	2326372	2326377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859515
43973	NC_014329	GCTA	2	8	2326402	2326409	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
43974	NC_014329	ATC	2	6	2326416	2326421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859515
43975	NC_014329	TGG	2	6	2326470	2326475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859515
43976	NC_014329	TGC	2	6	2326537	2326542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859515
43977	NC_014329	TCAG	2	8	2326563	2326570	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
43978	NC_014329	CACG	2	8	2326619	2326626	25 %	0 %	25 %	50 %	300859515
43979	NC_014329	TCC	2	6	2326685	2326690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859515
43980	NC_014329	CGCAC	2	10	2326715	2326724	20 %	0 %	20 %	60 %	300859515
43981	NC_014329	CTA	2	6	2326772	2326777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859515
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43983	NC_014329	ATT	2	6	2326934	2326939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859515
43984	NC_014329	TTG	2	6	2326959	2326964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859515
43985	NC_014329	CTC	2	6	2327025	2327030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859515
43986	NC_014329	TTG	2	6	2327088	2327093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859515
43987	NC_014329	AGCT	2	8	2327166	2327173	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
43988	NC_014329	AGCT	2	8	2327266	2327273	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
43989	NC_014329	GTA	2	6	2327279	2327284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859515
43990	NC_014329	TCTA	2	8	2327312	2327319	25 %	50 %	0 %	25 %	300859515
43991	NC_014329	AGA	2	6	2327326	2327331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859515
43992	NC_014329	TCTT	2	8	2327338	2327345	0 %	75 %	0 %	25 %	300859515
43993	NC_014329	AGA	2	6	2327368	2327373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859515
43994	NC_014329	TCT	2	6	2327384	2327389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859515
43995	NC_014329	GGT	2	6	2327494	2327499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859515
43996	NC_014329	CTT	2	6	2327505	2327510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859515
43997	NC_014329	TAC	2	6	2327516	2327521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43998	NC_014329	TGG	2	6	2327531	2327536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43999	NC_014329	CAC	2	6	2327559	2327564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44000	NC_014329	TTTTCT	2	12	2327567	2327578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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