MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_014329	ACT	2	6	2225393	2225398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859434
42003	NC_014329	A	6	6	2225497	2225502	100 %	0 %	0 %	0 %	300859434
42004	NC_014329	GAAA	2	8	2225503	2225510	75 %	0 %	25 %	0 %	300859434
42005	NC_014329	GAG	2	6	2225539	2225544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42006	NC_014329	TTG	2	6	2225563	2225568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42007	NC_014329	CAAG	2	8	2225618	2225625	50 %	0 %	25 %	25 %	300859435
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42013	NC_014329	ACC	2	6	2225790	2225795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859435
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42016	NC_014329	TAC	2	6	2225903	2225908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42017	NC_014329	AGGCT	2	10	2225914	2225923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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42020	NC_014329	CGA	2	6	2226062	2226067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42021	NC_014329	ATA	2	6	2226132	2226137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42119	NC_014329	GCT	2	6	2230629	2230634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42121	NC_014329	CAAC	2	8	2230828	2230835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42123	NC_014329	TTCGCT	2	12	2231071	2231082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42124	NC_014329	CCA	2	6	2231091	2231096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42127	NC_014329	CTCCC	2	10	2231214	2231223	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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42133	NC_014329	CAC	2	6	2231412	2231417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42134	NC_014329	CA	3	6	2231467	2231472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42135	NC_014329	CA	3	6	2231484	2231489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42136	NC_014329	CGTT	2	8	2231536	2231543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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42142	NC_014329	CAAA	2	8	2231807	2231814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42143	NC_014329	A	6	6	2231812	2231817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42155	NC_014329	CAACA	2	10	2232016	2232025	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42156	NC_014329	CA	3	6	2232024	2232029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42157	NC_014329	ACA	3	9	2232027	2232035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42158	NC_014329	CA	3	6	2232042	2232047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42162	NC_014329	A	7	7	2232111	2232117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42251	NC_014329	GGT	2	6	2235276	2235281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859438
42252	NC_014329	CGA	2	6	2235317	2235322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859438
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42281	NC_014329	A	6	6	2236822	2236827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42282	NC_014329	CGA	2	6	2236843	2236848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42329	NC_014329	AT	3	6	2239583	2239588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42330	NC_014329	ATT	2	6	2239691	2239696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42332	NC_014329	GAA	2	6	2239714	2239719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42333	NC_014329	TA	3	6	2239722	2239727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42334	NC_014329	CG	3	6	2239915	2239920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42335	NC_014329	ATT	4	12	2239929	2239940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859443
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42355	NC_014329	GAATAG	2	12	2240758	2240769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300859445
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42358	NC_014329	CTC	2	6	2241091	2241096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859445
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42361	NC_014329	CTTC	2	8	2241322	2241329	0 %	50 %	0 %	50 %	300859445
42362	NC_014329	TTA	2	6	2241343	2241348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859445
42363	NC_014329	CGG	2	6	2241455	2241460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859445
42364	NC_014329	ATTT	2	8	2241471	2241478	25 %	75 %	0 %	0 %	300859445
42365	NC_014329	TGT	2	6	2241491	2241496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859445
42366	NC_014329	AGC	2	6	2241549	2241554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859445
42367	NC_014329	CCG	2	6	2241718	2241723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859445
42368	NC_014329	ACT	2	6	2241815	2241820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859445
42369	NC_014329	ATC	2	6	2241957	2241962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859445
42370	NC_014329	CGC	2	6	2242019	2242024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859445
42371	NC_014329	ATC	2	6	2242041	2242046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859445
42372	NC_014329	TTA	2	6	2242086	2242091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859445
42373	NC_014329	GCAAG	2	10	2242202	2242211	40 %	0 %	40 %	20 %	300859445
42374	NC_014329	CACG	2	8	2242220	2242227	25 %	0 %	25 %	50 %	300859445
42375	NC_014329	TC	3	6	2242228	2242233	0 %	50 %	0 %	50 %	300859445
42376	NC_014329	CAG	2	6	2242373	2242378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859445
42377	NC_014329	GCC	2	6	2242447	2242452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859445
42378	NC_014329	CTG	2	6	2242513	2242518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859445
42379	NC_014329	TGGA	2	8	2242543	2242550	25 %	25 %	50 %	0 %	300859445
42380	NC_014329	TTA	2	6	2242564	2242569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859445
42381	NC_014329	AAAG	2	8	2242587	2242594	75 %	0 %	25 %	0 %	300859445
42382	NC_014329	AAG	2	6	2242619	2242624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859445
42383	NC_014329	GGC	2	6	2242667	2242672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859445
42384	NC_014329	GTG	2	6	2242773	2242778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859445
42385	NC_014329	CGC	3	9	2242805	2242813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859445
42386	NC_014329	TGC	2	6	2243006	2243011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859445
42387	NC_014329	AGC	2	6	2243042	2243047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859445
42388	NC_014329	CAG	2	6	2243137	2243142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42389	NC_014329	CAT	2	6	2243163	2243168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42390	NC_014329	GCTT	2	8	2243218	2243225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42391	NC_014329	AAT	2	6	2243271	2243276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42392	NC_014329	ATC	2	6	2243307	2243312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42393	NC_014329	AC	3	6	2243360	2243365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42394	NC_014329	CCG	2	6	2243448	2243453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859446
42395	NC_014329	GCT	2	6	2243454	2243459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859446
42396	NC_014329	GTTG	2	8	2243473	2243480	0 %	50 %	50 %	0 %	300859446
42397	NC_014329	TCG	2	6	2243531	2243536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859446
42398	NC_014329	CAT	2	6	2243564	2243569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859446
42399	NC_014329	TGG	2	6	2243616	2243621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859446
42400	NC_014329	TTG	2	6	2243668	2243673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859446
42401	NC_014329	TCG	2	6	2243828	2243833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859446
42402	NC_014329	TGGC	2	8	2243913	2243920	0 %	25 %	50 %	25 %	300859446
42403	NC_014329	CT	3	6	2243951	2243956	0 %	50 %	0 %	50 %	300859446
42404	NC_014329	CTAT	2	8	2243960	2243967	25 %	50 %	0 %	25 %	300859446
42405	NC_014329	GAA	2	6	2244064	2244069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859446
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42408	NC_014329	ATT	2	6	2244187	2244192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859446
42409	NC_014329	CTA	2	6	2244213	2244218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859446
42410	NC_014329	ATC	2	6	2244439	2244444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859446
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42412	NC_014329	CTT	2	6	2244465	2244470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859446
42413	NC_014329	CT	3	6	2244491	2244496	0 %	50 %	0 %	50 %	300859446
42414	NC_014329	GCT	2	6	2244550	2244555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859446
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42423	NC_014329	TTGTCC	2	12	2244848	2244859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	300859447
42424	NC_014329	AG	3	6	2244908	2244913	50 %	0 %	50 %	0 %	300859447
42425	NC_014329	ACG	2	6	2245106	2245111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859447
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42430	NC_014329	CTTCCG	2	12	2245290	2245301	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300859447
42431	NC_014329	A	6	6	2245347	2245352	100 %	0 %	0 %	0 %	300859447
42432	NC_014329	GAAC	2	8	2245385	2245392	50 %	0 %	25 %	25 %	300859447
42433	NC_014329	GAT	2	6	2245441	2245446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859447
42434	NC_014329	CCG	2	6	2245454	2245459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859447
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42439	NC_014329	CG	3	6	2245695	2245700	0 %	0 %	50 %	50 %	300859447
42440	NC_014329	CGA	2	6	2245740	2245745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859447
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42444	NC_014329	GATC	2	8	2245869	2245876	25 %	25 %	25 %	25 %	300859447
42445	NC_014329	TTG	2	6	2245880	2245885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859447
42446	NC_014329	ATC	2	6	2245901	2245906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859447
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42450	NC_014329	TCA	2	6	2246150	2246155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859447
42451	NC_014329	GGA	2	6	2246159	2246164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859447
42452	NC_014329	CAT	3	9	2246172	2246180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859447
42453	NC_014329	ACC	2	6	2246217	2246222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42454	NC_014329	GACGC	2	10	2246253	2246262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42455	NC_014329	CTA	2	6	2246273	2246278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42456	NC_014329	CTT	2	6	2246310	2246315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859448
42457	NC_014329	CTT	2	6	2246471	2246476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859448
42458	NC_014329	ATC	2	6	2246649	2246654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859448
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42461	NC_014329	CTC	2	6	2246739	2246744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859448
42462	NC_014329	TAA	2	6	2246757	2246762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859448
42463	NC_014329	TTC	2	6	2246826	2246831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859448
42464	NC_014329	CAT	2	6	2246865	2246870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859448
42465	NC_014329	TGA	2	6	2246932	2246937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859448
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42468	NC_014329	CAGT	2	8	2247269	2247276	25 %	25 %	25 %	25 %	300859448
42469	NC_014329	GCA	2	6	2247277	2247282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859448
42470	NC_014329	CCA	2	6	2247322	2247327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859448
42471	NC_014329	GCC	2	6	2247355	2247360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859448
42472	NC_014329	CCA	2	6	2247367	2247372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859448
42473	NC_014329	GC	4	8	2247389	2247396	0 %	0 %	50 %	50 %	300859448
42474	NC_014329	AGCG	2	8	2247406	2247413	25 %	0 %	50 %	25 %	300859448
42475	NC_014329	CACCGG	2	12	2247507	2247518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300859448
42476	NC_014329	AGG	2	6	2247530	2247535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859448
42477	NC_014329	GAG	2	6	2247599	2247604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859448
42478	NC_014329	GAG	2	6	2247675	2247680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859448
42479	NC_014329	CGG	2	6	2247858	2247863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859448
42480	NC_014329	AT	3	6	2247934	2247939	50 %	50 %	0 %	0 %	300859448
42481	NC_014329	TCA	2	6	2247988	2247993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859448
42482	NC_014329	CGC	2	6	2248008	2248013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859448
42483	NC_014329	AGGC	2	8	2248038	2248045	25 %	0 %	50 %	25 %	300859448
42484	NC_014329	GA	3	6	2248070	2248075	50 %	0 %	50 %	0 %	300859448
42485	NC_014329	T	6	6	2248194	2248199	0 %	100 %	0 %	0 %	300859448
42486	NC_014329	TGGT	2	8	2248221	2248228	0 %	50 %	50 %	0 %	300859448
42487	NC_014329	TGC	2	6	2248270	2248275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42488	NC_014329	TCCC	2	8	2248277	2248284	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42489	NC_014329	TC	3	6	2248318	2248323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42490	NC_014329	GTG	2	6	2248362	2248367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42491	NC_014329	GCA	2	6	2248374	2248379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42492	NC_014329	AGA	2	6	2248424	2248429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42493	NC_014329	AAAT	2	8	2248560	2248567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42494	NC_014329	ATA	2	6	2248620	2248625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42495	NC_014329	ATGCA	2	10	2248715	2248724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42496	NC_014329	AATA	2	8	2248746	2248753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42497	NC_014329	CAT	2	6	2248765	2248770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42499	NC_014329	A	6	6	2248800	2248805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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