MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_014329	TCC	2	6	2016906	2016911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859257
38003	NC_014329	CCA	2	6	2016919	2016924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859257
38004	NC_014329	GCT	2	6	2016927	2016932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859257
38005	NC_014329	AGG	2	6	2016943	2016948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859257
38006	NC_014329	AAT	2	6	2016952	2016957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859257
38007	NC_014329	CTT	2	6	2016973	2016978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859258
38008	NC_014329	TTG	2	6	2017005	2017010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859258
38009	NC_014329	CGG	2	6	2017030	2017035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859258
38010	NC_014329	CTC	2	6	2017065	2017070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859258
38011	NC_014329	AAG	2	6	2017097	2017102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859258
38012	NC_014329	TCC	2	6	2017172	2017177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859258
38013	NC_014329	A	6	6	2017201	2017206	100 %	0 %	0 %	0 %	300859258
38014	NC_014329	ACG	2	6	2017237	2017242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859259
38015	NC_014329	GCA	3	9	2017251	2017259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859259
38016	NC_014329	CAG	2	6	2017264	2017269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859259
38017	NC_014329	ACG	2	6	2017276	2017281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859259
38018	NC_014329	TCC	2	6	2017362	2017367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859259
38019	NC_014329	AGA	2	6	2017388	2017393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859259
38020	NC_014329	CTT	2	6	2017421	2017426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859259
38021	NC_014329	CCA	2	6	2017427	2017432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859259
38022	NC_014329	ACC	2	6	2017440	2017445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859259
38023	NC_014329	AGG	2	6	2017515	2017520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38024	NC_014329	CCT	2	6	2017536	2017541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38025	NC_014329	CTT	2	6	2017559	2017564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859260
38026	NC_014329	TCG	2	6	2017617	2017622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859260
38027	NC_014329	CAC	2	6	2017625	2017630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859260
38028	NC_014329	AGG	2	6	2017657	2017662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859260
38029	NC_014329	CG	3	6	2017675	2017680	0 %	0 %	50 %	50 %	300859260
38030	NC_014329	ACC	2	6	2017764	2017769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859260
38031	NC_014329	AGC	2	6	2017874	2017879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859260
38032	NC_014329	CTT	2	6	2017927	2017932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859260
38033	NC_014329	TCT	2	6	2017980	2017985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859260
38034	NC_014329	T	6	6	2018054	2018059	0 %	100 %	0 %	0 %	300859260
38035	NC_014329	GAA	2	6	2018105	2018110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859261
38036	NC_014329	ATG	2	6	2018151	2018156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859261
38037	NC_014329	AGC	2	6	2018157	2018162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859261
38038	NC_014329	CAC	2	6	2018192	2018197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859261
38039	NC_014329	ATG	2	6	2018316	2018321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859261
38040	NC_014329	GCT	2	6	2018343	2018348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859261
38041	NC_014329	TCG	2	6	2018364	2018369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859261
38042	NC_014329	ACGC	2	8	2018445	2018452	25 %	0 %	25 %	50 %	300859261
38043	NC_014329	ACC	2	6	2018574	2018579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859261
38044	NC_014329	AAC	2	6	2018585	2018590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859261
38045	NC_014329	GTTG	2	8	2018677	2018684	0 %	50 %	50 %	0 %	300859261
38046	NC_014329	CAA	2	6	2018749	2018754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859261
38047	NC_014329	CCTT	2	8	2018896	2018903	0 %	50 %	0 %	50 %	300859262
38048	NC_014329	GT	3	6	2018963	2018968	0 %	50 %	50 %	0 %	300859262
38049	NC_014329	TTG	2	6	2018970	2018975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859262
38050	NC_014329	CGT	2	6	2018999	2019004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38051	NC_014329	AGC	2	6	2019067	2019072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38052	NC_014329	TGG	2	6	2019122	2019127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859262
38053	NC_014329	GTT	2	6	2019134	2019139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859262
38054	NC_014329	GCT	2	6	2019219	2019224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38055	NC_014329	TGG	2	6	2019242	2019247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859262
38056	NC_014329	CGA	2	6	2019290	2019295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38057	NC_014329	CAG	2	6	2019315	2019320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38058	NC_014329	CGA	2	6	2019332	2019337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38059	NC_014329	CTT	2	6	2019378	2019383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859262
38060	NC_014329	GCA	2	6	2019424	2019429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859262
38061	NC_014329	TGG	2	6	2019445	2019450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859262
38062	NC_014329	CAA	2	6	2019467	2019472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859262
38063	NC_014329	TCA	2	6	2019577	2019582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859262
38064	NC_014329	TGC	2	6	2019711	2019716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859262
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38066	NC_014329	AG	3	6	2019838	2019843	50 %	0 %	50 %	0 %	300859262
38067	NC_014329	AGT	2	6	2019940	2019945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859262
38068	NC_014329	ATG	2	6	2019973	2019978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859262
38069	NC_014329	A	6	6	2020032	2020037	100 %	0 %	0 %	0 %	300859262
38070	NC_014329	AGT	2	6	2020043	2020048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859262
38071	NC_014329	CAGC	2	8	2020092	2020099	25 %	0 %	25 %	50 %	300859262
38072	NC_014329	CCG	2	6	2020122	2020127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859262
38073	NC_014329	GAT	2	6	2020185	2020190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859262
38074	NC_014329	TTC	2	6	2020270	2020275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859262
38075	NC_014329	AGT	2	6	2020285	2020290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38076	NC_014329	CTT	2	6	2020297	2020302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859263
38077	NC_014329	GAG	2	6	2020305	2020310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859263
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38083	NC_014329	CTG	2	6	2020716	2020721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859263
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38087	NC_014329	TGGT	2	8	2020867	2020874	0 %	50 %	50 %	0 %	300859263
38088	NC_014329	CCA	2	6	2020887	2020892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859263
38089	NC_014329	CTTC	2	8	2020910	2020917	0 %	50 %	0 %	50 %	300859263
38090	NC_014329	GCC	2	6	2020940	2020945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859263
38091	NC_014329	CTC	2	6	2020993	2020998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300859263
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38097	NC_014329	GAA	2	6	2021379	2021384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859264
38098	NC_014329	ATT	2	6	2021405	2021410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300859264
38099	NC_014329	AGC	2	6	2021418	2021423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859264
38100	NC_014329	GAT	2	6	2021434	2021439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859264
38101	NC_014329	CTT	2	6	2021450	2021455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859264
38102	NC_014329	CA	3	6	2021529	2021534	50 %	0 %	0 %	50 %	300859264
38103	NC_014329	TAA	2	6	2021613	2021618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859264
38104	NC_014329	GTCTT	2	10	2021667	2021676	0 %	60 %	20 %	20 %	300859264
38105	NC_014329	TAA	2	6	2021803	2021808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859264
38106	NC_014329	TCAT	2	8	2021955	2021962	25 %	50 %	0 %	25 %	300859264
38107	NC_014329	ATC	2	6	2022041	2022046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859264
38108	NC_014329	TCT	2	6	2022126	2022131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859264
38109	NC_014329	CTTT	2	8	2022186	2022193	0 %	75 %	0 %	25 %	300859264
38110	NC_014329	AGT	2	6	2022209	2022214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859264
38111	NC_014329	ATA	2	6	2022351	2022356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859264
38112	NC_014329	TGA	2	6	2022358	2022363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859264
38113	NC_014329	AAC	2	6	2022398	2022403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859264
38114	NC_014329	CGTG	2	8	2022448	2022455	0 %	25 %	50 %	25 %	300859264
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38116	NC_014329	TG	3	6	2022506	2022511	0 %	50 %	50 %	0 %	300859265
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38468	NC_014329	GC	3	6	2040317	2040322	0 %	0 %	50 %	50 %	300859284
38469	NC_014329	CCG	2	6	2040352	2040357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859284
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38495	NC_014329	GTC	2	6	2041471	2041476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38497	NC_014329	TAG	2	6	2041531	2041536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38498	NC_014329	GGT	2	6	2041620	2041625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859285
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