MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29004	NC_014329	GGA	2	6	1537645	1537650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858819
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29006	NC_014329	TCG	2	6	1537695	1537700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858819
29007	NC_014329	GA	3	6	1537724	1537729	50 %	0 %	50 %	0 %	300858819
29008	NC_014329	GCA	2	6	1537745	1537750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858819
29009	NC_014329	CAC	2	6	1537804	1537809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858819
29010	NC_014329	GAT	2	6	1538011	1538016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858819
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29012	NC_014329	CAG	2	6	1538136	1538141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858819
29013	NC_014329	GCT	2	6	1538159	1538164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858819
29014	NC_014329	TCC	2	6	1538224	1538229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858819
29015	NC_014329	TTCCT	2	10	1538360	1538369	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29016	NC_014329	ACG	2	6	1538516	1538521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858820
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29019	NC_014329	TGC	2	6	1538692	1538697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858820
29020	NC_014329	TAC	2	6	1538832	1538837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858820
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29024	NC_014329	GCA	2	6	1538960	1538965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858820
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29032	NC_014329	GGA	2	6	1539260	1539265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858820
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29042	NC_014329	CGT	2	6	1539906	1539911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858820
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29054	NC_014329	GAG	2	6	1540421	1540426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858820
29055	NC_014329	TGC	2	6	1540521	1540526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858821
29056	NC_014329	CAT	2	6	1540703	1540708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858821
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29084	NC_014329	GAA	2	6	1542354	1542359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29088	NC_014329	TGC	2	6	1542610	1542615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858823
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29096	NC_014329	CAC	2	6	1543182	1543187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29097	NC_014329	CCA	2	6	1543212	1543217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29098	NC_014329	TCC	2	6	1543263	1543268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29099	NC_014329	GCCA	2	8	1543332	1543339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29100	NC_014329	CATA	2	8	1543343	1543350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29101	NC_014329	A	6	6	1543350	1543355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29102	NC_014329	ACT	2	6	1543389	1543394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858824
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29107	NC_014329	ACAA	2	8	1543577	1543584	75 %	0 %	0 %	25 %	300858824
29108	NC_014329	TCC	2	6	1543669	1543674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858824
29109	NC_014329	TC	3	6	1543746	1543751	0 %	50 %	0 %	50 %	300858824
29110	NC_014329	GCT	2	6	1543761	1543766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858824
29111	NC_014329	TAG	2	6	1543844	1543849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29112	NC_014329	A	6	6	1543909	1543914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29113	NC_014329	CAG	2	6	1543915	1543920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29114	NC_014329	CCA	2	6	1544098	1544103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858825
29115	NC_014329	CGC	2	6	1544177	1544182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858825
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29117	NC_014329	GTA	2	6	1544319	1544324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858825
29118	NC_014329	TTAAG	2	10	1544395	1544404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29119	NC_014329	A	7	7	1544512	1544518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29120	NC_014329	TCCATT	2	12	1544538	1544549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300858826
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29160	NC_014329	CGT	2	6	1547728	1547733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858829
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29226	NC_014329	ACA	2	6	1551055	1551060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858831
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29231	NC_014329	AAG	2	6	1551338	1551343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858831
29232	NC_014329	GCT	2	6	1551358	1551363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858831
29233	NC_014329	CGC	2	6	1551440	1551445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858831
29234	NC_014329	TTCC	2	8	1551512	1551519	0 %	50 %	0 %	50 %	300858831
29235	NC_014329	GAAA	2	8	1551527	1551534	75 %	0 %	25 %	0 %	300858831
29236	NC_014329	A	6	6	1551547	1551552	100 %	0 %	0 %	0 %	300858831
29237	NC_014329	GAA	2	6	1551558	1551563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858831
29238	NC_014329	CTGTGC	2	12	1551755	1551766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29239	NC_014329	GCA	2	6	1551793	1551798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858832
29240	NC_014329	A	6	6	1551989	1551994	100 %	0 %	0 %	0 %	300858832
29241	NC_014329	TCA	2	6	1552005	1552010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858832
29242	NC_014329	ATA	2	6	1552122	1552127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858832
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29244	NC_014329	CTT	2	6	1552228	1552233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858832
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29262	NC_014329	CA	3	6	1553337	1553342	50 %	0 %	0 %	50 %	300858833
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29269	NC_014329	GTA	2	6	1553707	1553712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858833
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29272	NC_014329	CAC	3	9	1553879	1553887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29300	NC_014329	AAAGC	2	10	1555287	1555296	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29301	NC_014329	AACC	2	8	1555352	1555359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29302	NC_014329	CAT	2	6	1555396	1555401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29337	NC_014329	CG	3	6	1557199	1557204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29338	NC_014329	CG	3	6	1557298	1557303	0 %	0 %	50 %	50 %	300858837
29339	NC_014329	CT	3	6	1557337	1557342	0 %	50 %	0 %	50 %	300858837
29340	NC_014329	CTCCC	2	10	1557382	1557391	0 %	20 %	0 %	80 %	300858837
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29465	NC_014329	AATGC	2	10	1562811	1562820	40 %	20 %	20 %	20 %	300858841
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29467	NC_014329	AG	3	6	1562874	1562879	50 %	0 %	50 %	0 %	300858841
29468	NC_014329	GTA	2	6	1562920	1562925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858841
29469	NC_014329	CAA	2	6	1562961	1562966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858841
29470	NC_014329	CGT	2	6	1563078	1563083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858841
29471	NC_014329	GCA	3	9	1563122	1563130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
29472	NC_014329	GGC	2	6	1563159	1563164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858841
29473	NC_014329	GTGCT	2	10	1563200	1563209	0 %	40 %	40 %	20 %	300858841
29474	NC_014329	CTT	2	6	1563319	1563324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
29475	NC_014329	TTC	2	6	1563332	1563337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
29476	NC_014329	ACC	2	6	1563343	1563348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858841
29477	NC_014329	AAT	2	6	1563358	1563363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858841
29478	NC_014329	ACC	2	6	1563382	1563387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858841
29479	NC_014329	ACG	2	6	1563415	1563420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
29480	NC_014329	ACG	2	6	1563469	1563474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
29481	NC_014329	TTC	2	6	1563481	1563486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
29482	NC_014329	CTG	2	6	1563522	1563527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858841
29483	NC_014329	ATG	2	6	1563530	1563535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858841
29484	NC_014329	ACCAA	2	10	1563712	1563721	60 %	0 %	0 %	40 %	300858841
29485	NC_014329	TTTC	2	8	1563871	1563878	0 %	75 %	0 %	25 %	300858841
29486	NC_014329	ATTGCT	2	12	1563880	1563891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300858841
29487	NC_014329	ATCCA	2	10	1563902	1563911	40 %	20 %	0 %	40 %	300858841
29488	NC_014329	AGC	2	6	1563915	1563920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858842
29489	NC_014329	CCA	2	6	1563923	1563928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858842
29490	NC_014329	GCC	2	6	1563996	1564001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858842
29491	NC_014329	AAT	2	6	1564038	1564043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858842
29492	NC_014329	TCTT	2	8	1564045	1564052	0 %	75 %	0 %	25 %	300858842
29493	NC_014329	TCA	2	6	1564054	1564059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858842
29494	NC_014329	CAC	2	6	1564178	1564183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858842
29495	NC_014329	AAG	2	6	1564205	1564210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858842
29496	NC_014329	GATC	2	8	1564256	1564263	25 %	25 %	25 %	25 %	300858842
29497	NC_014329	CAC	2	6	1564280	1564285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858842
29498	NC_014329	TA	3	6	1564319	1564324	50 %	50 %	0 %	0 %	300858842
29499	NC_014329	GCC	2	6	1564335	1564340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858842
29500	NC_014329	GCA	2	6	1564427	1564432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858842

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