MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_014329	CGAT	2	8	1510255	1510262	25 %	25 %	25 %	25 %	300858796
28503	NC_014329	GT	3	6	1510384	1510389	0 %	50 %	50 %	0 %	300858796
28504	NC_014329	TCC	2	6	1510390	1510395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858796
28505	NC_014329	TAT	2	6	1510439	1510444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858796
28506	NC_014329	TC	3	6	1510475	1510480	0 %	50 %	0 %	50 %	300858796
28507	NC_014329	TAA	2	6	1510504	1510509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858796
28508	NC_014329	GCAC	2	8	1510562	1510569	25 %	0 %	25 %	50 %	300858796
28509	NC_014329	TGG	2	6	1510632	1510637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858796
28510	NC_014329	AAT	2	6	1510721	1510726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858796
28511	NC_014329	ACG	2	6	1510907	1510912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858796
28512	NC_014329	AGA	2	6	1510928	1510933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858796
28513	NC_014329	CAT	2	6	1511000	1511005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858796
28514	NC_014329	AAT	2	6	1511085	1511090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858796
28515	NC_014329	TTC	2	6	1511107	1511112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858796
28516	NC_014329	CTT	2	6	1511192	1511197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858796
28517	NC_014329	CAGT	2	8	1511289	1511296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28518	NC_014329	ATT	3	9	1511360	1511368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28520	NC_014329	AAT	3	9	1511382	1511390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_014329	TTA	2	6	1511427	1511432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28522	NC_014329	AG	3	6	1511459	1511464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28523	NC_014329	TCC	2	6	1511473	1511478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28524	NC_014329	CTT	2	6	1511490	1511495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858797
28525	NC_014329	CCTG	2	8	1511541	1511548	0 %	25 %	25 %	50 %	300858797
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28527	NC_014329	AGT	2	6	1511592	1511597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858797
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28536	NC_014329	A	6	6	1511946	1511951	100 %	0 %	0 %	0 %	300858797
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28538	NC_014329	TGC	2	6	1512125	1512130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858797
28539	NC_014329	GCA	2	6	1512142	1512147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858797
28540	NC_014329	TGC	2	6	1512176	1512181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858797
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28542	NC_014329	GGTG	2	8	1512251	1512258	0 %	25 %	75 %	0 %	300858797
28543	NC_014329	AGG	2	6	1512405	1512410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858798
28544	NC_014329	CGT	3	9	1512467	1512475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858798
28545	NC_014329	ACG	2	6	1512478	1512483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858798
28546	NC_014329	CTG	2	6	1512525	1512530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858798
28547	NC_014329	TG	3	6	1512529	1512534	0 %	50 %	50 %	0 %	300858798
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28551	NC_014329	AAGCA	2	10	1512843	1512852	60 %	0 %	20 %	20 %	300858798
28552	NC_014329	AAT	2	6	1512902	1512907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28553	NC_014329	AT	3	6	1512984	1512989	50 %	50 %	0 %	0 %	300858799
28554	NC_014329	ATC	2	6	1513006	1513011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858799
28555	NC_014329	TCCA	2	8	1513031	1513038	25 %	25 %	0 %	50 %	300858799
28556	NC_014329	TC	3	6	1513105	1513110	0 %	50 %	0 %	50 %	300858799
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28602	NC_014329	CGC	2	6	1515545	1515550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28603	NC_014329	TGG	2	6	1515556	1515561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28604	NC_014329	GCG	2	6	1515623	1515628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858802
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28608	NC_014329	TCT	2	6	1515980	1515985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858802
28609	NC_014329	CAG	2	6	1516035	1516040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858802
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28612	NC_014329	TGC	2	6	1516159	1516164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858802
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28614	NC_014329	GGTTC	2	10	1516209	1516218	0 %	40 %	40 %	20 %	300858802
28615	NC_014329	GCAC	2	8	1516228	1516235	25 %	0 %	25 %	50 %	300858802
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28617	NC_014329	CGG	2	6	1516432	1516437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28759	NC_014329	T	6	6	1524139	1524144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28760	NC_014329	CAA	2	6	1524145	1524150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28762	NC_014329	A	6	6	1524177	1524182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28763	NC_014329	ATT	2	6	1524224	1524229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28829	NC_014329	A	6	6	1527678	1527683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28830	NC_014329	GCG	2	6	1527703	1527708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858812
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28842	NC_014329	GCA	2	6	1528614	1528619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858813
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28844	NC_014329	GAT	2	6	1528744	1528749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858813
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28849	NC_014329	GGC	2	6	1528924	1528929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858813
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28852	NC_014329	CGA	2	6	1529071	1529076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858813
28853	NC_014329	T	6	6	1529104	1529109	0 %	100 %	0 %	0 %	300858813
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28860	NC_014329	TGC	2	6	1529470	1529475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858813
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28863	NC_014329	ACT	2	6	1529583	1529588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858813
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28960	NC_014329	TGC	3	9	1535778	1535786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858818
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28964	NC_014329	CGG	2	6	1535921	1535926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858818
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28967	NC_014329	CG	3	6	1535957	1535962	0 %	0 %	50 %	50 %	300858818
28968	NC_014329	GTT	2	6	1536249	1536254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858818
28969	NC_014329	AGG	2	6	1536264	1536269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858818
28970	NC_014329	CTG	2	6	1536284	1536289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858818
28971	NC_014329	AGA	2	6	1536293	1536298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858818
28972	NC_014329	CAT	2	6	1536306	1536311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858818
28973	NC_014329	TGG	2	6	1536317	1536322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858818
28974	NC_014329	CTA	4	12	1536350	1536361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858818
28975	NC_014329	GCT	2	6	1536424	1536429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858818
28976	NC_014329	CAT	2	6	1536443	1536448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858818
28977	NC_014329	GGGA	2	8	1536492	1536499	25 %	0 %	75 %	0 %	300858818
28978	NC_014329	GCA	2	6	1536583	1536588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858818
28979	NC_014329	CG	3	6	1536605	1536610	0 %	0 %	50 %	50 %	300858818
28980	NC_014329	CAG	2	6	1536638	1536643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858818
28981	NC_014329	CCG	2	6	1536715	1536720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858818
28982	NC_014329	GCA	2	6	1536804	1536809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28983	NC_014329	GCTA	2	8	1536843	1536850	25 %	25 %	25 %	25 %	300858819
28984	NC_014329	CTT	2	6	1536885	1536890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858819
28985	NC_014329	TCA	2	6	1536893	1536898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858819
28986	NC_014329	TGA	2	6	1536902	1536907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858819
28987	NC_014329	AAT	2	6	1536952	1536957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858819
28988	NC_014329	GCTT	2	8	1536989	1536996	0 %	50 %	25 %	25 %	300858819
28989	NC_014329	CGA	2	6	1537007	1537012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858819
28990	NC_014329	GTT	2	6	1537037	1537042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858819
28991	NC_014329	GCTT	2	8	1537167	1537174	0 %	50 %	25 %	25 %	300858819
28992	NC_014329	CAC	2	6	1537185	1537190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858819
28993	NC_014329	GCT	2	6	1537220	1537225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858819
28994	NC_014329	GAC	2	6	1537227	1537232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858819
28995	NC_014329	CCG	2	6	1537257	1537262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858819
28996	NC_014329	A	6	6	1537292	1537297	100 %	0 %	0 %	0 %	300858819
28997	NC_014329	CAA	2	6	1537356	1537361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858819
28998	NC_014329	GCT	2	6	1537384	1537389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858819
28999	NC_014329	TCA	2	6	1537460	1537465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858819
29000	NC_014329	CAG	2	6	1537497	1537502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858819

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