MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_014329	C	6	6	1154863	1154868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22003	NC_014329	GGC	2	6	1154986	1154991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22004	NC_014329	TG	3	6	1155050	1155055	0 %	50 %	50 %	0 %	300858482
22005	NC_014329	TTC	2	6	1155062	1155067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858482
22006	NC_014329	TGATC	2	10	1155074	1155083	20 %	40 %	20 %	20 %	300858482
22007	NC_014329	AGCTG	2	10	1155091	1155100	20 %	20 %	40 %	20 %	300858482
22008	NC_014329	GC	3	6	1155228	1155233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22009	NC_014329	TTGG	2	8	1155238	1155245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22010	NC_014329	TGC	2	6	1155285	1155290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22011	NC_014329	CCA	2	6	1155298	1155303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22012	NC_014329	GAT	2	6	1155343	1155348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22013	NC_014329	ATT	2	6	1155444	1155449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858483
22014	NC_014329	GCTGTT	2	12	1155516	1155527	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300858483
22015	NC_014329	CTC	2	6	1155546	1155551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858483
22016	NC_014329	CGA	2	6	1155554	1155559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858483
22017	NC_014329	ATA	2	6	1155714	1155719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22018	NC_014329	CGG	2	6	1155779	1155784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858484
22019	NC_014329	GAT	2	6	1155856	1155861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858484
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22033	NC_014329	AAG	2	6	1156889	1156894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858485
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22039	NC_014329	TA	3	6	1157223	1157228	50 %	50 %	0 %	0 %	300858485
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22051	NC_014329	CA	3	6	1157925	1157930	50 %	0 %	0 %	50 %	300858485
22052	NC_014329	AGC	2	6	1157942	1157947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858485
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22117	NC_014329	ATC	2	6	1161456	1161461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858487
22118	NC_014329	CAG	2	6	1161545	1161550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858487
22119	NC_014329	TGG	2	6	1161593	1161598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858487
22120	NC_014329	ATC	2	6	1161674	1161679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858488
22121	NC_014329	AGCC	2	8	1161703	1161710	25 %	0 %	25 %	50 %	300858488
22122	NC_014329	CAT	2	6	1161769	1161774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858488
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22125	NC_014329	TGT	2	6	1161919	1161924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858488
22126	NC_014329	ACG	2	6	1162031	1162036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858488
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22128	NC_014329	GCT	2	6	1162197	1162202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858488
22129	NC_014329	ACC	2	6	1162208	1162213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858488
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22131	NC_014329	GCC	2	6	1162289	1162294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858488
22132	NC_014329	GATC	2	8	1162300	1162307	25 %	25 %	25 %	25 %	300858488
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22143	NC_014329	CAG	2	6	1162726	1162731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858488
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22145	NC_014329	TTG	2	6	1162822	1162827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858488
22146	NC_014329	ATCC	2	8	1162873	1162880	25 %	25 %	0 %	50 %	300858488
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22150	NC_014329	GTTC	2	8	1163104	1163111	0 %	50 %	25 %	25 %	300858488
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22154	NC_014329	TA	3	6	1163239	1163244	50 %	50 %	0 %	0 %	300858488
22155	NC_014329	TGC	2	6	1163370	1163375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858488
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22159	NC_014329	ATC	2	6	1163543	1163548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22161	NC_014329	TG	3	6	1163596	1163601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22162	NC_014329	TAAAG	2	10	1163631	1163640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22163	NC_014329	T	7	7	1163653	1163659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22164	NC_014329	A	7	7	1163720	1163726	100 %	0 %	0 %	0 %	300858489
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22177	NC_014329	ATTT	2	8	1164405	1164412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22178	NC_014329	GC	3	6	1164476	1164481	0 %	0 %	50 %	50 %	300858490
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22185	NC_014329	GAAG	2	8	1164825	1164832	50 %	0 %	50 %	0 %	300858490
22186	NC_014329	CAA	2	6	1164838	1164843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858490
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22190	NC_014329	T	7	7	1165045	1165051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22191	NC_014329	ATC	2	6	1165113	1165118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858491
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22197	NC_014329	ATC	2	6	1165420	1165425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858491
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22200	NC_014329	GCA	2	6	1165657	1165662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858491
22201	NC_014329	GCTT	2	8	1165672	1165679	0 %	50 %	25 %	25 %	300858491
22202	NC_014329	ACG	2	6	1165710	1165715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858491
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22213	NC_014329	TC	3	6	1166101	1166106	0 %	50 %	0 %	50 %	300858491
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22217	NC_014329	GATT	2	8	1166229	1166236	25 %	50 %	25 %	0 %	300858491
22218	NC_014329	ACC	4	12	1166260	1166271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858491
22219	NC_014329	A	7	7	1166275	1166281	100 %	0 %	0 %	0 %	300858491
22220	NC_014329	CTTC	2	8	1166297	1166304	0 %	50 %	0 %	50 %	300858492
22221	NC_014329	GAC	2	6	1166307	1166312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858492
22222	NC_014329	CTT	2	6	1166511	1166516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858492
22223	NC_014329	GATG	2	8	1166550	1166557	25 %	25 %	50 %	0 %	300858492
22224	NC_014329	GCT	2	6	1166572	1166577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858492
22225	NC_014329	AGCA	2	8	1166661	1166668	50 %	0 %	25 %	25 %	300858492
22226	NC_014329	CAT	2	6	1166726	1166731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22227	NC_014329	GAA	2	6	1166843	1166848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858493
22228	NC_014329	AAG	2	6	1166862	1166867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858493
22229	NC_014329	AC	3	6	1166926	1166931	50 %	0 %	0 %	50 %	300858493
22230	NC_014329	TGC	2	6	1167125	1167130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858493
22231	NC_014329	ATC	2	6	1167139	1167144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858493
22232	NC_014329	ACT	2	6	1167188	1167193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858493
22233	NC_014329	CGC	2	6	1167235	1167240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858493
22234	NC_014329	T	6	6	1167296	1167301	0 %	100 %	0 %	0 %	300858493
22235	NC_014329	TTG	2	6	1167328	1167333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858493
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22262	NC_014329	CTT	2	6	1168994	1168999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858495
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22338	NC_014329	ATG	2	6	1173419	1173424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858498
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22342	NC_014329	CCGG	2	8	1173598	1173605	0 %	0 %	50 %	50 %	300858498
22343	NC_014329	TGT	2	6	1173621	1173626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858498
22344	NC_014329	CGA	2	6	1173780	1173785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858498
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22347	NC_014329	CCT	2	6	1174256	1174261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858498
22348	NC_014329	TGA	2	6	1174286	1174291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858498
22349	NC_014329	CG	3	6	1174308	1174313	0 %	0 %	50 %	50 %	300858498
22350	NC_014329	TAC	2	6	1174393	1174398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858498
22351	NC_014329	CGT	2	6	1174399	1174404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858498
22352	NC_014329	TC	3	6	1174443	1174448	0 %	50 %	0 %	50 %	300858498
22353	NC_014329	CAC	2	6	1174461	1174466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858498
22354	NC_014329	GAA	2	6	1174495	1174500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858498
22355	NC_014329	TCT	2	6	1174703	1174708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858498
22356	NC_014329	GAA	2	6	1174732	1174737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858498
22357	NC_014329	CGA	2	6	1174809	1174814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858498
22358	NC_014329	TCT	2	6	1174867	1174872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858498
22359	NC_014329	CAT	2	6	1175000	1175005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858498
22360	NC_014329	CTG	2	6	1175024	1175029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858498
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22362	NC_014329	ATG	2	6	1175107	1175112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858498
22363	NC_014329	CTC	2	6	1175198	1175203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858498
22364	NC_014329	GCT	2	6	1175239	1175244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858498
22365	NC_014329	ACT	2	6	1175497	1175502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858498
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22367	NC_014329	ACT	2	6	1175594	1175599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858498
22368	NC_014329	CGG	2	6	1175607	1175612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858498
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22370	NC_014329	GC	3	6	1175656	1175661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22371	NC_014329	GAA	2	6	1175859	1175864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858499
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22383	NC_014329	AGT	2	6	1176385	1176390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22384	NC_014329	GC	4	8	1176450	1176457	0 %	0 %	50 %	50 %	300858500
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22432	NC_014329	GGT	2	6	1178789	1178794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858502
22433	NC_014329	TACC	2	8	1178876	1178883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22434	NC_014329	ACT	2	6	1178890	1178895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22436	NC_014329	A	7	7	1178913	1178919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22437	NC_014329	TCC	2	6	1178934	1178939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22438	NC_014329	CAGCCA	2	12	1178955	1178966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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22440	NC_014329	TTA	2	6	1179125	1179130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22442	NC_014329	TGG	2	6	1179249	1179254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22457	NC_014329	CGTA	2	8	1179771	1179778	25 %	25 %	25 %	25 %	300858503
22458	NC_014329	AATAT	2	10	1179782	1179791	60 %	40 %	0 %	0 %	300858503
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22462	NC_014329	TGA	2	6	1179900	1179905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858503
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22464	NC_014329	TCCC	2	8	1180081	1180088	0 %	25 %	0 %	75 %	300858503
22465	NC_014329	ACA	2	6	1180110	1180115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858503
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22467	NC_014329	AGCC	2	8	1180237	1180244	25 %	0 %	25 %	50 %	300858503
22468	NC_014329	CTT	2	6	1180264	1180269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858503
22469	NC_014329	GGACGT	2	12	1180294	1180305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300858503
22470	NC_014329	CCCA	2	8	1180493	1180500	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22471	NC_014329	TAAT	2	8	1180593	1180600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22472	NC_014329	AT	3	6	1180599	1180604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22473	NC_014329	CAA	2	6	1180630	1180635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22474	NC_014329	TAAT	2	8	1180714	1180721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22475	NC_014329	ATT	2	6	1180736	1180741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858504
22476	NC_014329	CTTGG	2	10	1180785	1180794	0 %	40 %	40 %	20 %	300858504
22477	NC_014329	TGC	2	6	1180797	1180802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858504
22478	NC_014329	CGG	2	6	1180879	1180884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858504
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22480	NC_014329	AGC	2	6	1181271	1181276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858504
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22490	NC_014329	AGA	2	6	1182040	1182045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858504
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22492	NC_014329	GAA	2	6	1182149	1182154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858504
22493	NC_014329	GGT	2	6	1182200	1182205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858504
22494	NC_014329	AAG	2	6	1182218	1182223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858504
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22496	NC_014329	TGA	2	6	1182277	1182282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858504
22497	NC_014329	GAG	2	6	1182302	1182307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858504
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22499	NC_014329	TTA	2	6	1182498	1182503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858504
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