MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014329	CTAG	2	8	939842	939849	25 %	25 %	25 %	25 %	300858302
18003	NC_014329	CAA	2	6	939876	939881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858302
18004	NC_014329	CTC	2	6	940032	940037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858302
18005	NC_014329	AAG	2	6	940038	940043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858302
18006	NC_014329	GAT	2	6	940073	940078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858302
18007	NC_014329	TC	3	6	940094	940099	0 %	50 %	0 %	50 %	300858302
18008	NC_014329	CGA	2	6	940105	940110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858302
18009	NC_014329	GTT	2	6	940244	940249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858302
18010	NC_014329	CAT	2	6	940270	940275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858302
18011	NC_014329	CGG	2	6	940330	940335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858302
18012	NC_014329	GAA	2	6	940336	940341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858302
18013	NC_014329	GAA	2	6	940486	940491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858302
18014	NC_014329	AAC	2	6	940591	940596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858302
18015	NC_014329	GC	3	6	940690	940695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18016	NC_014329	CTT	2	6	940710	940715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_014329	TGA	2	6	940780	940785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858303
18018	NC_014329	CGT	2	6	940815	940820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18019	NC_014329	GCA	2	6	940910	940915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18020	NC_014329	CTC	2	6	941079	941084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858303
18021	NC_014329	AGC	2	6	941098	941103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18022	NC_014329	GAT	2	6	941105	941110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858303
18023	NC_014329	GAA	2	6	941147	941152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858303
18024	NC_014329	AGA	2	6	941272	941277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858303
18025	NC_014329	GCT	2	6	941297	941302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18026	NC_014329	TCT	2	6	941333	941338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858303
18027	NC_014329	GAA	2	6	941357	941362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858303
18028	NC_014329	CG	3	6	941459	941464	0 %	0 %	50 %	50 %	300858303
18029	NC_014329	CCG	2	6	941490	941495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858303
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18032	NC_014329	TCC	2	6	941587	941592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858303
18033	NC_014329	TGCCGC	2	12	941641	941652	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300858303
18034	NC_014329	GTTT	2	8	941676	941683	0 %	75 %	25 %	0 %	300858303
18035	NC_014329	TGC	2	6	941685	941690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18036	NC_014329	GGA	2	6	941756	941761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858303
18037	NC_014329	GCA	2	6	941840	941845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858303
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18039	NC_014329	TCCT	2	8	941909	941916	0 %	50 %	0 %	50 %	300858303
18040	NC_014329	CAC	2	6	941995	942000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858303
18041	NC_014329	TGC	2	6	942012	942017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858303
18042	NC_014329	TGG	2	6	942131	942136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858303
18043	NC_014329	AATAA	2	10	942170	942179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_014329	CG	3	6	942282	942287	0 %	0 %	50 %	50 %	300858304
18045	NC_014329	ACG	2	6	942357	942362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858304
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18050	NC_014329	ACC	2	6	942634	942639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858304
18051	NC_014329	TTTA	2	8	942660	942667	25 %	75 %	0 %	0 %	300858304
18052	NC_014329	GAT	2	6	942669	942674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858304
18053	NC_014329	CTT	2	6	942686	942691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858304
18054	NC_014329	TAC	2	6	942756	942761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_014329	TCC	2	6	942801	942806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_014329	ATGC	2	8	942818	942825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18057	NC_014329	CAT	2	6	942830	942835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_014329	TGG	2	6	942848	942853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_014329	TGG	2	6	942899	942904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858305
18060	NC_014329	CTT	2	6	942944	942949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858305
18061	NC_014329	ATG	2	6	942998	943003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858305
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18064	NC_014329	TG	3	6	943145	943150	0 %	50 %	50 %	0 %	300858305
18065	NC_014329	TCA	2	6	943156	943161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858305
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18069	NC_014329	ACCC	2	8	943232	943239	25 %	0 %	0 %	75 %	300858305
18070	NC_014329	CTT	2	6	943274	943279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858305
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18072	NC_014329	GTA	2	6	943323	943328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858305
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18074	NC_014329	TTGT	2	8	943514	943521	0 %	75 %	25 %	0 %	300858305
18075	NC_014329	TCG	2	6	943528	943533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858305
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18078	NC_014329	CTG	2	6	943780	943785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858305
18079	NC_014329	CAT	2	6	943826	943831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858305
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18082	NC_014329	AGG	2	6	944179	944184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_014329	TG	3	6	944208	944213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_014329	TGGG	2	8	944223	944230	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_014329	GCA	2	6	944235	944240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18086	NC_014329	CTCAT	2	10	944268	944277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18087	NC_014329	T	6	6	944306	944311	0 %	100 %	0 %	0 %	300858306
18088	NC_014329	CGC	2	6	944321	944326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858306
18089	NC_014329	TTC	2	6	944332	944337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858306
18090	NC_014329	CTT	2	6	944398	944403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858306
18091	NC_014329	ATC	2	6	944605	944610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858306
18092	NC_014329	ATA	2	6	944639	944644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858306
18093	NC_014329	TGC	2	6	944686	944691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858306
18094	NC_014329	ATG	2	6	944696	944701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858306
18095	NC_014329	TGCG	2	8	944741	944748	0 %	25 %	50 %	25 %	300858306
18096	NC_014329	A	6	6	944757	944762	100 %	0 %	0 %	0 %	300858306
18097	NC_014329	G	6	6	944788	944793	0 %	0 %	100 %	0 %	300858306
18098	NC_014329	TAC	2	6	944887	944892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858307
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18100	NC_014329	CGT	2	6	944913	944918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858307
18101	NC_014329	GCC	2	6	944923	944928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858307
18102	NC_014329	TTC	2	6	945007	945012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858307
18103	NC_014329	TTG	2	6	945043	945048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858307
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18105	NC_014329	TGG	2	6	945142	945147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858307
18106	NC_014329	CGT	2	6	945207	945212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858307
18107	NC_014329	ACA	2	6	945260	945265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858307
18108	NC_014329	TCC	2	6	945292	945297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858307
18109	NC_014329	TGT	2	6	945319	945324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858307
18110	NC_014329	TTGG	2	8	945383	945390	0 %	50 %	50 %	0 %	300858307
18111	NC_014329	ATT	2	6	945403	945408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858307
18112	NC_014329	TCT	2	6	945452	945457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858307
18113	NC_014329	TGG	2	6	945504	945509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858307
18114	NC_014329	GCT	2	6	945539	945544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858307
18115	NC_014329	TGA	2	6	945648	945653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858307
18116	NC_014329	TGA	2	6	945691	945696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858307
18117	NC_014329	TCA	2	6	945761	945766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858307
18118	NC_014329	ACGC	2	8	945942	945949	25 %	0 %	25 %	50 %	300858307
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18120	NC_014329	AATGG	2	10	946004	946013	40 %	20 %	40 %	0 %	300858307
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18238	NC_014329	CAT	2	6	951817	951822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18241	NC_014329	TAA	2	6	952203	952208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858314
18242	NC_014329	TCG	2	6	952218	952223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858314
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18244	NC_014329	GGC	2	6	952336	952341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858314
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18247	NC_014329	GAT	2	6	952444	952449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858314
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18253	NC_014329	TGC	2	6	952629	952634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858314
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18356	NC_014329	AT	3	6	958386	958391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18357	NC_014329	GGC	2	6	958437	958442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858319
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18360	NC_014329	GAT	2	6	958686	958691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858319
18361	NC_014329	GAT	2	6	958729	958734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858319
18362	NC_014329	TTTCT	2	10	958773	958782	0 %	80 %	0 %	20 %	300858319
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18364	NC_014329	TGAC	2	8	958991	958998	25 %	25 %	25 %	25 %	300858319
18365	NC_014329	GCA	2	6	959009	959014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858319
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18379	NC_014329	GT	3	6	959578	959583	0 %	50 %	50 %	0 %	300858319
18380	NC_014329	GCCTT	2	10	959588	959597	0 %	40 %	20 %	40 %	300858319
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18400	NC_014329	TAAAA	2	10	960890	960899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18401	NC_014329	TGCA	2	8	960953	960960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18402	NC_014329	CTTT	2	8	960980	960987	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18403	NC_014329	TAC	2	6	961008	961013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18405	NC_014329	ATT	2	6	961086	961091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18406	NC_014329	GAG	2	6	961155	961160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18407	NC_014329	TTGC	2	8	961235	961242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18408	NC_014329	A	6	6	961247	961252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18411	NC_014329	TGC	2	6	961544	961549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858321
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18422	NC_014329	T	7	7	962190	962196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18423	NC_014329	A	6	6	962197	962202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18424	NC_014329	TACCG	2	10	962205	962214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18425	NC_014329	TTG	2	6	962238	962243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18426	NC_014329	AG	3	6	962276	962281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18427	NC_014329	GC	3	6	962321	962326	0 %	0 %	50 %	50 %	300858322
18428	NC_014329	CTGCAT	2	12	962364	962375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300858322
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18431	NC_014329	ACC	2	6	962487	962492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858322
18432	NC_014329	GCG	2	6	962512	962517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858322
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18434	NC_014329	GGGGT	2	10	962579	962588	0 %	20 %	80 %	0 %	300858322
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18441	NC_014329	CAG	2	6	962940	962945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858322
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18449	NC_014329	GGAT	2	8	963661	963668	25 %	25 %	50 %	0 %	300858323
18450	NC_014329	GCG	2	6	963795	963800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858323
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18461	NC_014329	CTG	2	6	964455	964460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858323
18462	NC_014329	AGA	2	6	964466	964471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858323
18463	NC_014329	CGC	2	6	964550	964555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858323
18464	NC_014329	TGA	2	6	964643	964648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858323
18465	NC_014329	AAG	2	6	964659	964664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858323
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18467	NC_014329	GCG	2	6	964752	964757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858323
18468	NC_014329	CCG	2	6	964848	964853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858323
18469	NC_014329	TGGC	2	8	965010	965017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18470	NC_014329	AAC	2	6	965023	965028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18471	NC_014329	AATG	2	8	965109	965116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18472	NC_014329	GC	3	6	965235	965240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18473	NC_014329	TCG	2	6	965262	965267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18474	NC_014329	TAA	2	6	965270	965275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18475	NC_014329	CTTT	2	8	965320	965327	0 %	75 %	0 %	25 %	300858324
18476	NC_014329	TGA	2	6	965403	965408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858324
18477	NC_014329	TGC	3	9	965424	965432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858324
18478	NC_014329	GGC	2	6	965440	965445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858324
18479	NC_014329	CATC	2	8	965506	965513	25 %	25 %	0 %	50 %	300858324
18480	NC_014329	A	6	6	965592	965597	100 %	0 %	0 %	0 %	300858324
18481	NC_014329	TGG	2	6	965880	965885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858324
18482	NC_014329	TCT	2	6	965947	965952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858324
18483	NC_014329	GTG	2	6	966031	966036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858324
18484	NC_014329	GCG	2	6	966094	966099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858324
18485	NC_014329	GT	3	6	966206	966211	0 %	50 %	50 %	0 %	300858324
18486	NC_014329	CTG	3	9	966251	966259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858324
18487	NC_014329	T	6	6	966267	966272	0 %	100 %	0 %	0 %	300858324
18488	NC_014329	GTGGTT	2	12	966325	966336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18489	NC_014329	AAG	2	6	966375	966380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18490	NC_014329	TCAA	2	8	966384	966391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18491	NC_014329	CAG	2	6	966461	966466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18492	NC_014329	ACC	2	6	966574	966579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18493	NC_014329	T	6	6	966602	966607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_014329	TTC	2	6	966685	966690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18495	NC_014329	TA	3	6	966710	966715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_014329	TTCG	2	8	966745	966752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18497	NC_014329	TGATG	2	10	966788	966797	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18498	NC_014329	GGA	2	6	966804	966809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18499	NC_014329	GTG	2	6	966825	966830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858325
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