MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014329	AGA	2	6	886089	886094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858251
17003	NC_014329	GAA	2	6	886168	886173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858251
17004	NC_014329	A	6	6	886232	886237	100 %	0 %	0 %	0 %	300858251
17005	NC_014329	CAG	2	6	886278	886283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858251
17006	NC_014329	AGT	2	6	886304	886309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858251
17007	NC_014329	TCC	2	6	886369	886374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858252
17008	NC_014329	AGT	2	6	886443	886448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858252
17009	NC_014329	TGC	2	6	886449	886454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858252
17010	NC_014329	TTG	2	6	886517	886522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858252
17011	NC_014329	GC	3	6	886533	886538	0 %	0 %	50 %	50 %	300858252
17012	NC_014329	AGC	2	6	886548	886553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858252
17013	NC_014329	GTG	2	6	886579	886584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858252
17014	NC_014329	CGG	2	6	886628	886633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858252
17015	NC_014329	TCT	2	6	886708	886713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858252
17016	NC_014329	CGGA	2	8	886798	886805	25 %	0 %	50 %	25 %	300858252
17017	NC_014329	TCCT	2	8	886904	886911	0 %	50 %	0 %	50 %	300858252
17018	NC_014329	TGA	2	6	886961	886966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858252
17019	NC_014329	GCA	2	6	886977	886982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858252
17020	NC_014329	CG	3	6	887009	887014	0 %	0 %	50 %	50 %	300858252
17021	NC_014329	TGC	2	6	887045	887050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858252
17022	NC_014329	GCT	2	6	887095	887100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858252
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17024	NC_014329	CTG	2	6	887377	887382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858253
17025	NC_014329	GAGACG	2	12	887460	887471	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300858253
17026	NC_014329	TGACC	2	10	887519	887528	20 %	20 %	20 %	40 %	300858253
17027	NC_014329	GT	3	6	887564	887569	0 %	50 %	50 %	0 %	300858253
17028	NC_014329	TGT	2	6	887633	887638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858253
17029	NC_014329	GGT	2	6	887874	887879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858253
17030	NC_014329	GGGCG	2	10	887881	887890	0 %	0 %	80 %	20 %	300858253
17031	NC_014329	TGT	2	6	888010	888015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_014329	TAT	2	6	888067	888072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858254
17033	NC_014329	AG	3	6	888106	888111	50 %	0 %	50 %	0 %	300858254
17034	NC_014329	CAA	2	6	888194	888199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858254
17035	NC_014329	ATC	2	6	888217	888222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858254
17036	NC_014329	CTG	2	6	888263	888268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858254
17037	NC_014329	GA	3	6	888293	888298	50 %	0 %	50 %	0 %	300858254
17038	NC_014329	GCC	2	6	888376	888381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858254
17039	NC_014329	CGC	2	6	888419	888424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858254
17040	NC_014329	CAAC	2	8	888504	888511	50 %	0 %	0 %	50 %	300858254
17041	NC_014329	CTT	2	6	888581	888586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858254
17042	NC_014329	GTGA	2	8	888593	888600	25 %	25 %	50 %	0 %	300858254
17043	NC_014329	TAG	2	6	888601	888606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858254
17044	NC_014329	GTT	2	6	888610	888615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858254
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17046	NC_014329	CGGT	2	8	888652	888659	0 %	25 %	50 %	25 %	300858254
17047	NC_014329	AAC	2	6	888684	888689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858254
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17049	NC_014329	GCGA	2	8	888771	888778	25 %	0 %	50 %	25 %	300858254
17050	NC_014329	TAC	2	6	888819	888824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858254
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17053	NC_014329	GTG	2	6	889046	889051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858254
17054	NC_014329	GCA	2	6	889110	889115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858254
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17056	NC_014329	AAC	2	6	889200	889205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858254
17057	NC_014329	AGT	2	6	889221	889226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858254
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17060	NC_014329	CTG	2	6	889294	889299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858254
17061	NC_014329	ATC	2	6	889365	889370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858254
17062	NC_014329	ACGGA	2	10	889387	889396	40 %	0 %	40 %	20 %	300858254
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17064	NC_014329	TCA	2	6	889505	889510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858254
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17069	NC_014329	CAC	2	6	889956	889961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17070	NC_014329	AAT	2	6	889990	889995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_014329	TG	3	6	890007	890012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_014329	GTG	2	6	890096	890101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_014329	ACA	3	9	890172	890180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858255
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17103	NC_014329	TGG	2	6	891637	891642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858255
17104	NC_014329	CGA	2	6	891650	891655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858255
17105	NC_014329	GAA	2	6	891663	891668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858255
17106	NC_014329	CTG	2	6	891742	891747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858255
17107	NC_014329	AAC	2	6	891846	891851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858255
17108	NC_014329	CT	3	6	891901	891906	0 %	50 %	0 %	50 %	300858255
17109	NC_014329	TCC	2	6	891908	891913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858255
17110	NC_014329	TGG	2	6	891950	891955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858255
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17117	NC_014329	ACTT	2	8	892213	892220	25 %	50 %	0 %	25 %	300858255
17118	NC_014329	AGC	2	6	892225	892230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858255
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17229	NC_014329	CGAAA	2	10	898412	898421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17230	NC_014329	GACG	2	8	898433	898440	25 %	0 %	50 %	25 %	300858263
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17232	NC_014329	GGA	2	6	898478	898483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858263
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17237	NC_014329	CTGA	2	8	898596	898603	25 %	25 %	25 %	25 %	300858263
17238	NC_014329	G	6	6	898622	898627	0 %	0 %	100 %	0 %	300858263
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17240	NC_014329	AG	3	6	898787	898792	50 %	0 %	50 %	0 %	300858263
17241	NC_014329	ATC	2	6	898800	898805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858263
17242	NC_014329	GTC	2	6	898845	898850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858263
17243	NC_014329	CGC	2	6	898860	898865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858263
17244	NC_014329	CGT	2	6	899122	899127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17245	NC_014329	AGCG	2	8	899141	899148	25 %	0 %	50 %	25 %	300858264
17246	NC_014329	ACG	2	6	899180	899185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17247	NC_014329	GGTTT	2	10	899201	899210	0 %	60 %	40 %	0 %	300858264
17248	NC_014329	CTG	2	6	899211	899216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17249	NC_014329	GCA	2	6	899264	899269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17250	NC_014329	AAGGAC	2	12	899349	899360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	300858264
17251	NC_014329	GCT	2	6	899428	899433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17252	NC_014329	TGA	2	6	899437	899442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858264
17253	NC_014329	CTG	2	6	899474	899479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17254	NC_014329	CCGTT	2	10	899608	899617	0 %	40 %	20 %	40 %	300858264
17255	NC_014329	TGT	2	6	899623	899628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858264
17256	NC_014329	CTG	2	6	899631	899636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858264
17257	NC_014329	CCT	2	6	899731	899736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858264
17258	NC_014329	ATC	2	6	899747	899752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858264
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17260	NC_014329	AATT	2	8	899841	899848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17261	NC_014329	AAT	2	6	899849	899854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17262	NC_014329	GAA	2	6	899859	899864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17263	NC_014329	GAA	2	6	899879	899884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17264	NC_014329	TCC	2	6	899904	899909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858265
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17271	NC_014329	GAG	2	6	900321	900326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858265
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17274	NC_014329	GCT	2	6	900591	900596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858265
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17282	NC_014329	ACG	2	6	900889	900894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858265
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17284	NC_014329	CT	3	6	901058	901063	0 %	50 %	0 %	50 %	300858265
17285	NC_014329	CGC	2	6	901076	901081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858265
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17288	NC_014329	GCGG	2	8	901344	901351	0 %	0 %	75 %	25 %	300858265
17289	NC_014329	GAG	2	6	901365	901370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858265
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17292	NC_014329	AAG	2	6	901506	901511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858265
17293	NC_014329	CA	3	6	901538	901543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17294	NC_014329	AAG	2	6	901549	901554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17295	NC_014329	CTA	2	6	901616	901621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858266
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17297	NC_014329	AGCT	2	8	901743	901750	25 %	25 %	25 %	25 %	300858266
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17300	NC_014329	TGG	2	6	901833	901838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858266
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17318	NC_014329	CGT	2	6	902607	902612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858267
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17347	NC_014329	T	6	6	904503	904508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17348	NC_014329	TG	3	6	904582	904587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17353	NC_014329	GTT	2	6	904684	904689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858269
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17359	NC_014329	TAC	2	6	905031	905036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858269
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