MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014329	TGG	2	6	675386	675391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858053
13002	NC_014329	TTG	2	6	675410	675415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858054
13003	NC_014329	TTTCA	2	10	675575	675584	20 %	60 %	0 %	20 %	300858054
13004	NC_014329	GAG	2	6	675934	675939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858054
13005	NC_014329	GTTTT	2	10	675957	675966	0 %	80 %	20 %	0 %	300858054
13006	NC_014329	CG	4	8	675983	675990	0 %	0 %	50 %	50 %	300858054
13007	NC_014329	CGA	2	6	675996	676001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858054
13008	NC_014329	TGC	2	6	676100	676105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_014329	GAA	2	6	676253	676258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858055
13010	NC_014329	GGA	2	6	676277	676282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858055
13011	NC_014329	CGAT	2	8	676337	676344	25 %	25 %	25 %	25 %	300858055
13012	NC_014329	CA	3	6	676359	676364	50 %	0 %	0 %	50 %	300858055
13013	NC_014329	CTG	2	6	676380	676385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858055
13014	NC_014329	GGT	2	6	676415	676420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858055
13015	NC_014329	ACA	2	6	676752	676757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858055
13016	NC_014329	TCC	2	6	676834	676839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858055
13017	NC_014329	CGA	2	6	676853	676858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858055
13018	NC_014329	CTC	2	6	676862	676867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858055
13019	NC_014329	ATT	2	6	676881	676886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858055
13020	NC_014329	TGG	2	6	676887	676892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858055
13021	NC_014329	GCCA	2	8	676903	676910	25 %	0 %	25 %	50 %	300858055
13022	NC_014329	TCT	2	6	676987	676992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858056
13023	NC_014329	TGG	2	6	677005	677010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858056
13024	NC_014329	TGCA	2	8	677050	677057	25 %	25 %	25 %	25 %	300858056
13025	NC_014329	TGT	2	6	677134	677139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858056
13026	NC_014329	AGTA	2	8	677173	677180	50 %	25 %	25 %	0 %	300858056
13027	NC_014329	TTG	2	6	677196	677201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858056
13028	NC_014329	CAT	2	6	677257	677262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858056
13029	NC_014329	GAT	2	6	677293	677298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858056
13030	NC_014329	GCGAT	2	10	677340	677349	20 %	20 %	40 %	20 %	300858056
13031	NC_014329	TAAT	2	8	677381	677388	50 %	50 %	0 %	0 %	300858056
13032	NC_014329	CT	3	6	677406	677411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_014329	TAA	2	6	677416	677421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_014329	TCG	2	6	677494	677499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858057
13035	NC_014329	AGA	2	6	677502	677507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858057
13036	NC_014329	TGT	2	6	677563	677568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858057
13037	NC_014329	GTT	2	6	677698	677703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858057
13038	NC_014329	CGGA	2	8	677744	677751	25 %	0 %	50 %	25 %	300858057
13039	NC_014329	CAG	2	6	677774	677779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858057
13040	NC_014329	AAG	2	6	677812	677817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858057
13041	NC_014329	TCA	2	6	677822	677827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858057
13042	NC_014329	GAA	2	6	677937	677942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858057
13043	NC_014329	TC	3	6	677981	677986	0 %	50 %	0 %	50 %	300858057
13044	NC_014329	CGG	2	6	678016	678021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858057
13045	NC_014329	AAG	2	6	678121	678126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858057
13046	NC_014329	TGCGG	2	10	678183	678192	0 %	20 %	60 %	20 %	300858057
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13048	NC_014329	CAA	2	6	678380	678385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858057
13049	NC_014329	AGC	2	6	678427	678432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858057
13050	NC_014329	GGT	2	6	678471	678476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858057
13051	NC_014329	CGA	2	6	678491	678496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858057
13052	NC_014329	TCA	2	6	678523	678528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858057
13053	NC_014329	CCA	2	6	678640	678645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858057
13054	NC_014329	GCT	2	6	678757	678762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858057
13055	NC_014329	GGA	2	6	678818	678823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858057
13056	NC_014329	GTG	2	6	678925	678930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858057
13057	NC_014329	GGC	2	6	678969	678974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858057
13058	NC_014329	CGGA	2	8	679143	679150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_014329	CAA	2	6	679151	679156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_014329	CTG	2	6	679215	679220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_014329	CAT	2	6	679241	679246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_014329	T	6	6	679255	679260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_014329	TGAC	2	8	679282	679289	25 %	25 %	25 %	25 %	300858058
13064	NC_014329	GAC	2	6	679316	679321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13065	NC_014329	CGG	2	6	679355	679360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858058
13066	NC_014329	GCA	2	6	679417	679422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13067	NC_014329	GCAA	2	8	679443	679450	50 %	0 %	25 %	25 %	300858058
13068	NC_014329	ATG	2	6	679453	679458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858058
13069	NC_014329	GGA	2	6	679460	679465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858058
13070	NC_014329	GC	3	6	679515	679520	0 %	0 %	50 %	50 %	300858058
13071	NC_014329	TCT	2	6	679556	679561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858058
13072	NC_014329	GCG	2	6	679644	679649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858058
13073	NC_014329	T	6	6	679653	679658	0 %	100 %	0 %	0 %	300858058
13074	NC_014329	GGA	2	6	679670	679675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858058
13075	NC_014329	GATT	2	8	679726	679733	25 %	50 %	25 %	0 %	300858058
13076	NC_014329	TCA	2	6	679736	679741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858058
13077	NC_014329	GCC	2	6	679824	679829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858058
13078	NC_014329	GC	3	6	679887	679892	0 %	0 %	50 %	50 %	300858058
13079	NC_014329	TTC	2	6	679949	679954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858058
13080	NC_014329	CTG	2	6	679968	679973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13081	NC_014329	GAT	2	6	679974	679979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858058
13082	NC_014329	GCT	2	6	680043	680048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13083	NC_014329	GTAT	2	8	680172	680179	25 %	50 %	25 %	0 %	300858058
13084	NC_014329	TGC	2	6	680180	680185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13085	NC_014329	TGC	2	6	680294	680299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858058
13086	NC_014329	ACG	2	6	680344	680349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858058
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13088	NC_014329	GAT	2	6	680514	680519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858058
13089	NC_014329	TAA	2	6	680540	680545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858058
13090	NC_014329	TGG	2	6	680629	680634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858058
13091	NC_014329	TAA	2	6	680639	680644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858058
13092	NC_014329	GCCT	2	8	680826	680833	0 %	25 %	25 %	50 %	300858059
13093	NC_014329	TCCT	2	8	680869	680876	0 %	50 %	0 %	50 %	300858059
13094	NC_014329	TGA	2	6	680901	680906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858059
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13096	NC_014329	CCA	2	6	680939	680944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858059
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13098	NC_014329	ATC	2	6	681070	681075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858059
13099	NC_014329	CCAAC	2	10	681281	681290	40 %	0 %	0 %	60 %	300858060
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13101	NC_014329	CAG	2	6	681407	681412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13102	NC_014329	TGA	2	6	681436	681441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858060
13103	NC_014329	CAA	2	6	681464	681469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858060
13104	NC_014329	AGCA	2	8	681471	681478	50 %	0 %	25 %	25 %	300858060
13105	NC_014329	CAG	2	6	681534	681539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13106	NC_014329	CAG	2	6	681673	681678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13107	NC_014329	TCCAC	2	10	681696	681705	20 %	20 %	0 %	60 %	300858060
13108	NC_014329	GAT	2	6	681779	681784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858060
13109	NC_014329	GAT	2	6	681802	681807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858060
13110	NC_014329	CGC	2	6	681843	681848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858060
13111	NC_014329	GAC	2	6	681943	681948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13112	NC_014329	TGA	2	6	682009	682014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858060
13113	NC_014329	GA	3	6	682023	682028	50 %	0 %	50 %	0 %	300858060
13114	NC_014329	CGA	2	6	682099	682104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13115	NC_014329	ACCA	2	8	682115	682122	50 %	0 %	0 %	50 %	300858060
13116	NC_014329	CGA	2	6	682358	682363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858060
13117	NC_014329	A	6	6	682363	682368	100 %	0 %	0 %	0 %	300858060
13118	NC_014329	ATG	2	6	682431	682436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858060
13119	NC_014329	GGA	2	6	682583	682588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858060
13120	NC_014329	TC	3	6	682667	682672	0 %	50 %	0 %	50 %	300858060
13121	NC_014329	ATT	2	6	682679	682684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858060
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13157	NC_014329	GTT	2	6	684771	684776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13158	NC_014329	GAT	2	6	684820	684825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13202	NC_014329	TGG	2	6	686618	686623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13227	NC_014329	GCTG	2	8	687788	687795	0 %	25 %	50 %	25 %	300858064
13228	NC_014329	GGA	2	6	687872	687877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858064
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13231	NC_014329	TCA	2	6	687941	687946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858064
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13233	NC_014329	AAC	2	6	688000	688005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858064
13234	NC_014329	ACA	2	6	688027	688032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858064
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13237	NC_014329	GGC	2	6	688194	688199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858064
13238	NC_014329	GCA	2	6	688238	688243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858064
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13240	NC_014329	GAA	2	6	688287	688292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858064
13241	NC_014329	CTT	2	6	688305	688310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858064
13242	NC_014329	AGA	3	9	688315	688323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858064
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13245	NC_014329	CGG	2	6	688385	688390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858064
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13248	NC_014329	CGTG	2	8	688514	688521	0 %	25 %	50 %	25 %	300858064
13249	NC_014329	GC	3	6	688622	688627	0 %	0 %	50 %	50 %	300858064
13250	NC_014329	TAGCC	2	10	688631	688640	20 %	20 %	20 %	40 %	300858064
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13256	NC_014329	GTTTT	2	10	688910	688919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_014329	CG	3	6	689004	689009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13263	NC_014329	A	6	6	689463	689468	100 %	0 %	0 %	0 %	300858065
13264	NC_014329	GCT	2	6	689492	689497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858065
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13272	NC_014329	GAAA	2	8	689901	689908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13273	NC_014329	CTG	2	6	689956	689961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858066
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13282	NC_014329	AAG	2	6	690721	690726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858066
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13330	NC_014329	CTT	2	6	693414	693419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858070
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13335	NC_014329	GACA	2	8	693582	693589	50 %	0 %	25 %	25 %	300858070
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13344	NC_014329	T	6	6	694205	694210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13345	NC_014329	AAACT	2	10	694254	694263	60 %	20 %	0 %	20 %	300858071
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13350	NC_014329	GGA	2	6	694439	694444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858071
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13353	NC_014329	TGG	2	6	694632	694637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858071
13354	NC_014329	TGAT	2	8	694642	694649	25 %	50 %	25 %	0 %	300858071
13355	NC_014329	TCA	2	6	694864	694869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858071
13356	NC_014329	GA	3	6	695003	695008	50 %	0 %	50 %	0 %	300858071
13357	NC_014329	GTT	2	6	695357	695362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_014329	GCT	3	9	695444	695452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858072
13359	NC_014329	ACG	2	6	695472	695477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858072
13360	NC_014329	TTC	2	6	695569	695574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858072
13361	NC_014329	GCG	2	6	695580	695585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858072
13362	NC_014329	CTT	2	6	695604	695609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858072
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13380	NC_014329	GCC	2	6	696372	696377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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