MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014329	CTTA	2	8	233074	233081	25 %	50 %	0 %	25 %	300857642
4502	NC_014329	CGA	2	6	233084	233089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4503	NC_014329	AAG	3	9	233238	233246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4504	NC_014329	CGA	2	6	233282	233287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4505	NC_014329	CTTG	2	8	233339	233346	0 %	50 %	25 %	25 %	300857642
4506	NC_014329	GCT	2	6	233415	233420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4507	NC_014329	TCG	2	6	233471	233476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4508	NC_014329	CTGTG	2	10	233512	233521	0 %	40 %	40 %	20 %	300857642
4509	NC_014329	GAA	2	6	233522	233527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4510	NC_014329	CTG	2	6	233545	233550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4511	NC_014329	GAGCGT	2	12	233592	233603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300857642
4512	NC_014329	CCG	2	6	233617	233622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857642
4513	NC_014329	GGT	2	6	233774	233779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857642
4514	NC_014329	AGA	2	6	233849	233854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4515	NC_014329	TCG	2	6	233867	233872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4516	NC_014329	GCA	2	6	233903	233908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4517	NC_014329	ACG	2	6	234009	234014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4518	NC_014329	CGT	2	6	234093	234098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4519	NC_014329	AGG	2	6	234124	234129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
4520	NC_014329	TCCG	2	8	234142	234149	0 %	25 %	25 %	50 %	300857642
4521	NC_014329	GC	3	6	234350	234355	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4522	NC_014329	CGA	2	6	234467	234472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4523	NC_014329	CCA	2	6	234478	234483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
4524	NC_014329	GC	3	6	234492	234497	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4525	NC_014329	CGT	2	6	234508	234513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4526	NC_014329	A	7	7	234519	234525	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4527	NC_014329	GGA	2	6	234527	234532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
4528	NC_014329	ATC	2	6	234567	234572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857642
4529	NC_014329	AGA	2	6	234661	234666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4530	NC_014329	TCG	2	6	234699	234704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4531	NC_014329	GAT	2	6	234720	234725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857642
4532	NC_014329	CGC	2	6	234728	234733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857642
4533	NC_014329	CGG	2	6	234824	234829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857642
4534	NC_014329	CG	3	6	234869	234874	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4535	NC_014329	GCCGT	2	10	234913	234922	0 %	20 %	40 %	40 %	300857642
4536	NC_014329	GC	3	6	235001	235006	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4537	NC_014329	TC	3	6	235010	235015	0 %	50 %	0 %	50 %	300857642
4538	NC_014329	ACC	3	9	235020	235028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
4539	NC_014329	AAGG	2	8	235131	235138	50 %	0 %	50 %	0 %	300857642
4540	NC_014329	GAT	2	6	235173	235178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857642
4541	NC_014329	TCG	2	6	235213	235218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4542	NC_014329	AGC	2	6	235243	235248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4543	NC_014329	TGC	2	6	235250	235255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4544	NC_014329	AGAA	2	8	235303	235310	75 %	0 %	25 %	0 %	300857642
4545	NC_014329	TCG	2	6	235327	235332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4546	NC_014329	AGCC	2	8	235378	235385	25 %	0 %	25 %	50 %	300857642
4547	NC_014329	CGCT	2	8	235518	235525	0 %	25 %	25 %	50 %	300857642
4548	NC_014329	CCG	2	6	235568	235573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857642
4549	NC_014329	ACG	2	6	235592	235597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4550	NC_014329	CGTG	2	8	235670	235677	0 %	25 %	50 %	25 %	300857642
4551	NC_014329	CTT	2	6	235720	235725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857642
4552	NC_014329	CGA	2	6	235728	235733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4553	NC_014329	CGA	2	6	235736	235741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4554	NC_014329	AGG	2	6	235798	235803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
4555	NC_014329	AGAAA	2	10	235820	235829	80 %	0 %	20 %	0 %	300857642
4556	NC_014329	A	6	6	235836	235841	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4557	NC_014329	GAA	2	6	235847	235852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4558	NC_014329	CCA	2	6	235855	235860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
4559	NC_014329	A	6	6	235875	235880	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4560	NC_014329	A	6	6	235887	235892	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4561	NC_014329	TTCA	2	8	236049	236056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_014329	TGC	2	6	236089	236094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4563	NC_014329	GAAC	2	8	236125	236132	50 %	0 %	25 %	25 %	300857643
4564	NC_014329	ATG	2	6	236136	236141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4565	NC_014329	TCC	2	6	236204	236209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857643
4566	NC_014329	ATG	2	6	236358	236363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4567	NC_014329	ATGCCC	2	12	236388	236399	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300857643
4568	NC_014329	GA	3	6	236403	236408	50 %	0 %	50 %	0 %	300857643
4569	NC_014329	TCG	2	6	236445	236450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4570	NC_014329	ATG	3	9	236451	236459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4571	NC_014329	AGT	2	6	236541	236546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4572	NC_014329	GCC	2	6	236547	236552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4573	NC_014329	GAG	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857643
4574	NC_014329	CAAAGC	2	12	236596	236607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300857643
4575	NC_014329	GGGA	2	8	236630	236637	25 %	0 %	75 %	0 %	300857643
4576	NC_014329	TGA	2	6	236638	236643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4577	NC_014329	GAT	2	6	236663	236668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4578	NC_014329	CTG	2	6	236678	236683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4579	NC_014329	ACC	2	6	236763	236768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4580	NC_014329	ACC	2	6	236832	236837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4581	NC_014329	AAC	2	6	236861	236866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857643
4582	NC_014329	GAT	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4583	NC_014329	TG	3	6	236993	236998	0 %	50 %	50 %	0 %	300857643
4584	NC_014329	TGAA	2	8	237018	237025	50 %	25 %	25 %	0 %	300857643
4585	NC_014329	GCA	2	6	237049	237054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4586	NC_014329	CAA	2	6	237073	237078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857643
4587	NC_014329	CCT	2	6	237120	237125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857643
4588	NC_014329	GAT	2	6	237182	237187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4589	NC_014329	GCACCG	2	12	237222	237233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300857643
4590	NC_014329	CGA	2	6	237250	237255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4591	NC_014329	CGC	2	6	237283	237288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4592	NC_014329	AGC	2	6	237302	237307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4593	NC_014329	ATA	2	6	237322	237327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857643
4594	NC_014329	CCA	2	6	237435	237440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4595	NC_014329	AGT	2	6	237455	237460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4596	NC_014329	CAG	2	6	237494	237499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4597	NC_014329	AG	3	6	237498	237503	50 %	0 %	50 %	0 %	300857643
4598	NC_014329	T	6	6	237548	237553	0 %	100 %	0 %	0 %	300857643
4599	NC_014329	TTC	2	6	237566	237571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857643
4600	NC_014329	CGT	2	6	237583	237588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4601	NC_014329	CGC	2	6	237694	237699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4602	NC_014329	CCA	2	6	237743	237748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4603	NC_014329	ATG	2	6	237756	237761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4604	NC_014329	GGA	2	6	237769	237774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857643
4605	NC_014329	ACG	2	6	237822	237827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4606	NC_014329	ACG	2	6	237857	237862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4607	NC_014329	CAG	2	6	237883	237888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4608	NC_014329	GGC	2	6	237941	237946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857643
4609	NC_014329	GCC	2	6	237968	237973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4610	NC_014329	GAT	2	6	237974	237979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4611	NC_014329	GC	3	6	237984	237989	0 %	0 %	50 %	50 %	300857643
4612	NC_014329	AAGT	2	8	237991	237998	50 %	25 %	25 %	0 %	300857643
4613	NC_014329	TCCT	2	8	238055	238062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_014329	GATA	2	8	238170	238177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014329	GTAG	2	8	238184	238191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014329	CCTA	2	8	238213	238220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_014329	TCA	2	6	238303	238308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857644
4618	NC_014329	TGC	2	6	238309	238314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4619	NC_014329	GC	3	6	238349	238354	0 %	0 %	50 %	50 %	300857644
4620	NC_014329	CTT	2	6	238373	238378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857644
4621	NC_014329	CCG	2	6	238491	238496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857644
4622	NC_014329	CAA	2	6	238507	238512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4623	NC_014329	GCG	2	6	238581	238586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4624	NC_014329	GCG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4625	NC_014329	TGC	2	6	238669	238674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857644
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4681	NC_014329	GCC	2	6	241682	241687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4746	NC_014329	TAG	2	6	245254	245259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857649
4747	NC_014329	ATC	2	6	245260	245265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857649
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4768	NC_014329	GATG	2	8	246701	246708	25 %	25 %	50 %	0 %	300857650
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4805	NC_014329	GGCT	2	8	248711	248718	0 %	25 %	50 %	25 %	300857652
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4810	NC_014329	CTG	2	6	248907	248912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857652
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4822	NC_014329	TGA	2	6	249684	249689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857653
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4824	NC_014329	CGGT	2	8	249704	249711	0 %	25 %	50 %	25 %	300857653
4825	NC_014329	CATGC	2	10	249730	249739	20 %	20 %	20 %	40 %	300857653
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4839	NC_014329	AAGC	2	8	250396	250403	50 %	0 %	25 %	25 %	300857653
4840	NC_014329	GT	3	6	250458	250463	0 %	50 %	50 %	0 %	300857653
4841	NC_014329	CGA	2	6	250485	250490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857653
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4843	NC_014329	GC	3	6	250840	250845	0 %	0 %	50 %	50 %	300857653
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4846	NC_014329	CTG	2	6	251060	251065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857653
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4849	NC_014329	CGCC	2	8	251251	251258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4850	NC_014329	TTA	2	6	251310	251315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857654
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4852	NC_014329	AAG	2	6	251338	251343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857654
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4858	NC_014329	AGAA	2	8	251761	251768	75 %	0 %	25 %	0 %	300857654
4859	NC_014329	CGT	2	6	251776	251781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857654
4860	NC_014329	AGC	3	9	251805	251813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857654
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4862	NC_014329	GACATG	2	12	251826	251837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300857654
4863	NC_014329	GAT	2	6	251840	251845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857654
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4865	NC_014329	TTG	2	6	251853	251858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857654
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4990	NC_014329	CAG	2	6	258471	258476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857659
4991	NC_014329	CAA	2	6	258479	258484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857659
4992	NC_014329	GGC	2	6	258669	258674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857659
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4994	NC_014329	ACT	2	6	258829	258834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857659
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