MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014328	CTG	2	6	599664	599669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853753
15002	NC_014328	CTAT	2	8	599681	599688	25 %	50 %	0 %	25 %	300853753
15003	NC_014328	TA	3	6	599735	599740	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15004	NC_014328	TGA	2	6	599750	599755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853753
15005	NC_014328	TTA	2	6	599776	599781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15006	NC_014328	ATT	2	6	599798	599803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15007	NC_014328	ATT	2	6	599816	599821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15008	NC_014328	AGC	2	6	599825	599830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853753
15009	NC_014328	AT	3	6	599850	599855	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15010	NC_014328	TTG	2	6	599880	599885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853753
15011	NC_014328	TAT	2	6	599891	599896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15012	NC_014328	ATTA	2	8	599928	599935	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15013	NC_014328	TAA	2	6	599948	599953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15014	NC_014328	AAT	2	6	599985	599990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15015	NC_014328	TAT	2	6	599992	599997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15016	NC_014328	TAA	2	6	600007	600012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15017	NC_014328	AT	3	6	600036	600041	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15018	NC_014328	A	6	6	600129	600134	100 %	0 %	0 %	0 %	300853753
15019	NC_014328	TAA	2	6	600148	600153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15020	NC_014328	TA	4	8	600173	600180	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15021	NC_014328	AAC	2	6	600200	600205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853753
15022	NC_014328	TGA	2	6	600217	600222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853753
15023	NC_014328	AATT	2	8	600224	600231	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15024	NC_014328	T	6	6	600230	600235	0 %	100 %	0 %	0 %	300853753
15025	NC_014328	TAC	2	6	600255	600260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853753
15026	NC_014328	GTTTT	2	10	600309	600318	0 %	80 %	20 %	0 %	300853753
15027	NC_014328	TAT	2	6	600321	600326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15028	NC_014328	AAT	2	6	600360	600365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15029	NC_014328	AGT	2	6	600425	600430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853753
15030	NC_014328	TAA	2	6	600454	600459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15031	NC_014328	AT	4	8	600505	600512	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15032	NC_014328	TGG	2	6	600527	600532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853753
15033	NC_014328	A	6	6	600582	600587	100 %	0 %	0 %	0 %	300853753
15034	NC_014328	AT	3	6	600591	600596	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15035	NC_014328	GCA	3	9	600624	600632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853753
15036	NC_014328	TGA	2	6	600697	600702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853753
15037	NC_014328	AT	3	6	600706	600711	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15038	NC_014328	GCA	2	6	600725	600730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853753
15039	NC_014328	AT	3	6	600735	600740	50 %	50 %	0 %	0 %	300853753
15040	NC_014328	CAT	2	6	600805	600810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853753
15041	NC_014328	TATAAA	2	12	600839	600850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853753
15042	NC_014328	TATAT	2	10	600854	600863	40 %	60 %	0 %	0 %	300853753
15043	NC_014328	TAT	2	6	600878	600883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853753
15044	NC_014328	TTTAT	2	10	600888	600897	20 %	80 %	0 %	0 %	300853753
15045	NC_014328	TAG	2	6	600942	600947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853753
15046	NC_014328	AGC	2	6	600967	600972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_014328	AGGG	2	8	600981	600988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_014328	TAA	2	6	601004	601009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853754
15049	NC_014328	GTGGAA	2	12	601019	601030	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	300853754
15050	NC_014328	GCA	2	6	601052	601057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853754
15051	NC_014328	TTA	2	6	601073	601078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
15052	NC_014328	GTA	2	6	601088	601093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
15053	NC_014328	TTA	2	6	601129	601134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
15054	NC_014328	GAT	2	6	601147	601152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
15055	NC_014328	AT	4	8	601151	601158	50 %	50 %	0 %	0 %	300853754
15056	NC_014328	GTA	2	6	601159	601164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
15057	NC_014328	GAA	2	6	601204	601209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853754
15058	NC_014328	AATAT	2	10	601229	601238	60 %	40 %	0 %	0 %	300853754
15059	NC_014328	TTG	2	6	601241	601246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853754
15060	NC_014328	AGT	2	6	601320	601325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
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15063	NC_014328	ATT	2	6	601559	601564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
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15065	NC_014328	AGT	2	6	601651	601656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
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15068	NC_014328	ATT	2	6	601846	601851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
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15070	NC_014328	AGTT	2	8	601889	601896	25 %	50 %	25 %	0 %	300853754
15071	NC_014328	ATA	2	6	601931	601936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853754
15072	NC_014328	A	6	6	601957	601962	100 %	0 %	0 %	0 %	300853754
15073	NC_014328	AGAA	2	8	602004	602011	75 %	0 %	25 %	0 %	300853754
15074	NC_014328	TAG	2	6	602016	602021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853754
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15076	NC_014328	ATTAA	2	10	602107	602116	60 %	40 %	0 %	0 %	300853754
15077	NC_014328	AGTTA	2	10	602129	602138	40 %	40 %	20 %	0 %	300853754
15078	NC_014328	ATT	2	6	602147	602152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
15079	NC_014328	GTT	2	6	602173	602178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853754
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15081	NC_014328	ATT	2	6	602299	602304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
15082	NC_014328	ATT	2	6	602321	602326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853754
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15085	NC_014328	A	6	6	602397	602402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15089	NC_014328	GCA	2	6	602664	602669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853755
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15091	NC_014328	A	6	6	602796	602801	100 %	0 %	0 %	0 %	300853755
15092	NC_014328	AAG	2	6	602845	602850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853755
15093	NC_014328	A	6	6	602863	602868	100 %	0 %	0 %	0 %	300853755
15094	NC_014328	TTC	2	6	602894	602899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853755
15095	NC_014328	CTG	2	6	602911	602916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853755
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15099	NC_014328	TA	3	6	603195	603200	50 %	50 %	0 %	0 %	300853755
15100	NC_014328	AAT	2	6	603209	603214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853755
15101	NC_014328	AT	3	6	603218	603223	50 %	50 %	0 %	0 %	300853755
15102	NC_014328	ATA	2	6	603369	603374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853755
15103	NC_014328	ATA	2	6	603397	603402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853755
15104	NC_014328	AAT	2	6	603414	603419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853755
15105	NC_014328	AAG	2	6	603438	603443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853755
15106	NC_014328	ATA	2	6	603484	603489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_014328	TCC	2	6	603587	603592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15108	NC_014328	ATTT	2	8	603609	603616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_014328	TTGC	2	8	603684	603691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15110	NC_014328	CTT	2	6	603702	603707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_014328	A	7	7	603714	603720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_014328	TTAAA	2	10	603733	603742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_014328	A	7	7	603876	603882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_014328	CTGG	2	8	603914	603921	0 %	25 %	50 %	25 %	300853756
15115	NC_014328	AT	3	6	603980	603985	50 %	50 %	0 %	0 %	300853756
15116	NC_014328	TAT	2	6	604001	604006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853756
15117	NC_014328	TTA	2	6	604047	604052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853756
15118	NC_014328	ATA	2	6	604221	604226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853756
15119	NC_014328	TGA	2	6	604342	604347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853756
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15121	NC_014328	ATG	2	6	604431	604436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853756
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