MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_014328	TATC	2	8	542621	542628	25 %	50 %	0 %	25 %	300853700
13503	NC_014328	TAA	2	6	542741	542746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853700
13504	NC_014328	TTG	2	6	542752	542757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853700
13505	NC_014328	TGC	2	6	542771	542776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853700
13506	NC_014328	ATC	2	6	542829	542834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853700
13507	NC_014328	GAA	2	6	542842	542847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853700
13508	NC_014328	CCT	2	6	542851	542856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853700
13509	NC_014328	CTTA	2	8	542877	542884	25 %	50 %	0 %	25 %	300853700
13510	NC_014328	TA	3	6	542895	542900	50 %	50 %	0 %	0 %	300853700
13511	NC_014328	GAA	2	6	542914	542919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853700
13512	NC_014328	TAA	2	6	542937	542942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853700
13513	NC_014328	ATT	2	6	543000	543005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853700
13514	NC_014328	TAT	2	6	543015	543020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853700
13515	NC_014328	ATT	2	6	543048	543053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853700
13516	NC_014328	TGT	2	6	543080	543085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853700
13517	NC_014328	GCT	2	6	543157	543162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853700
13518	NC_014328	TTC	2	6	543181	543186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853700
13519	NC_014328	TA	4	8	543212	543219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_014328	A	7	7	543243	543249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_014328	GAG	2	6	543291	543296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_014328	TTAAT	2	10	543328	543337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_014328	AT	3	6	543400	543405	50 %	50 %	0 %	0 %	300853701
13524	NC_014328	T	6	6	543431	543436	0 %	100 %	0 %	0 %	300853701
13525	NC_014328	T	6	6	543500	543505	0 %	100 %	0 %	0 %	300853701
13526	NC_014328	AAAT	2	8	543507	543514	75 %	25 %	0 %	0 %	300853701
13527	NC_014328	CTT	2	6	543515	543520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853701
13528	NC_014328	ATTT	2	8	543627	543634	25 %	75 %	0 %	0 %	300853701
13529	NC_014328	TAA	2	6	543647	543652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853701
13530	NC_014328	TAT	2	6	543653	543658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853701
13531	NC_014328	T	6	6	543658	543663	0 %	100 %	0 %	0 %	300853701
13532	NC_014328	T	6	6	543689	543694	0 %	100 %	0 %	0 %	300853701
13533	NC_014328	TA	3	6	543756	543761	50 %	50 %	0 %	0 %	300853701
13534	NC_014328	TTTTA	2	10	543786	543795	20 %	80 %	0 %	0 %	300853701
13535	NC_014328	TCT	2	6	543802	543807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853701
13536	NC_014328	T	7	7	543807	543813	0 %	100 %	0 %	0 %	300853701
13537	NC_014328	TTC	2	6	543843	543848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853701
13538	NC_014328	ATT	2	6	543933	543938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853701
13539	NC_014328	ATC	2	6	544023	544028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853701
13540	NC_014328	ATT	2	6	544033	544038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853701
13541	NC_014328	TCA	2	6	544049	544054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853701
13542	NC_014328	CTT	2	6	544113	544118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853702
13543	NC_014328	CAA	2	6	544152	544157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853702
13544	NC_014328	CAAGAC	2	12	544173	544184	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300853702
13545	NC_014328	TTAT	2	8	544241	544248	25 %	75 %	0 %	0 %	300853702
13546	NC_014328	ATT	2	6	544289	544294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853702
13547	NC_014328	ATT	2	6	544303	544308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853702
13548	NC_014328	AT	3	6	544352	544357	50 %	50 %	0 %	0 %	300853702
13549	NC_014328	T	6	6	544357	544362	0 %	100 %	0 %	0 %	300853702
13550	NC_014328	ATT	2	6	544366	544371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853702
13551	NC_014328	ATA	2	6	544373	544378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853702
13552	NC_014328	ATC	2	6	544412	544417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853702
13553	NC_014328	ATTT	2	8	544428	544435	25 %	75 %	0 %	0 %	300853702
13554	NC_014328	ATTT	2	8	544467	544474	25 %	75 %	0 %	0 %	300853702
13555	NC_014328	GTC	2	6	544582	544587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853702
13556	NC_014328	ATC	2	6	544589	544594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853702
13557	NC_014328	ATC	2	6	544756	544761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853702
13558	NC_014328	T	6	6	544806	544811	0 %	100 %	0 %	0 %	300853702
13559	NC_014328	CAA	2	6	544854	544859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853702
13560	NC_014328	T	6	6	544901	544906	0 %	100 %	0 %	0 %	300853702
13561	NC_014328	AGTA	2	8	544921	544928	50 %	25 %	25 %	0 %	300853702
13562	NC_014328	ATAA	2	8	544941	544948	75 %	25 %	0 %	0 %	300853702
13563	NC_014328	ATA	3	9	544952	544960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853702
13564	NC_014328	TAT	2	6	544966	544971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853702
13565	NC_014328	TAA	2	6	545004	545009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853702
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13567	NC_014328	AC	3	6	545062	545067	50 %	0 %	0 %	50 %	300853702
13568	NC_014328	TATAAA	2	12	545071	545082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853702
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13571	NC_014328	T	6	6	545179	545184	0 %	100 %	0 %	0 %	300853703
13572	NC_014328	TAA	2	6	545195	545200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853703
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13575	NC_014328	A	6	6	545337	545342	100 %	0 %	0 %	0 %	300853703
13576	NC_014328	TAAT	2	8	545433	545440	50 %	50 %	0 %	0 %	300853703
13577	NC_014328	A	6	6	545442	545447	100 %	0 %	0 %	0 %	300853703
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13582	NC_014328	ATA	2	6	545574	545579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853703
13583	NC_014328	GA	3	6	545641	545646	50 %	0 %	50 %	0 %	300853703
13584	NC_014328	CTAT	2	8	545684	545691	25 %	50 %	0 %	25 %	300853703
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13593	NC_014328	TAG	2	6	545983	545988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853704
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13596	NC_014328	A	6	6	546074	546079	100 %	0 %	0 %	0 %	300853704
13597	NC_014328	ATCA	2	8	546125	546132	50 %	25 %	0 %	25 %	300853704
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13601	NC_014328	T	6	6	546247	546252	0 %	100 %	0 %	0 %	300853704
13602	NC_014328	TCA	2	6	546291	546296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853704
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13605	NC_014328	AC	3	6	546397	546402	50 %	0 %	0 %	50 %	300853704
13606	NC_014328	ATC	2	6	546422	546427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853704
13607	NC_014328	TAG	2	6	546496	546501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853704
13608	NC_014328	TTTA	2	8	546548	546555	25 %	75 %	0 %	0 %	300853704
13609	NC_014328	TA	3	6	546592	546597	50 %	50 %	0 %	0 %	300853704
13610	NC_014328	ATT	2	6	546608	546613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853704
13611	NC_014328	TCC	2	6	546642	546647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13612	NC_014328	TTAC	2	8	546774	546781	25 %	50 %	0 %	25 %	300853705
13613	NC_014328	AT	4	8	546815	546822	50 %	50 %	0 %	0 %	300853705
13614	NC_014328	TAA	2	6	546829	546834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853705
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13617	NC_014328	TTC	2	6	546947	546952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853705
13618	NC_014328	CTAT	2	8	546978	546985	25 %	50 %	0 %	25 %	300853705
13619	NC_014328	T	6	6	547015	547020	0 %	100 %	0 %	0 %	300853705
13620	NC_014328	ATC	2	6	547268	547273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853705
13621	NC_014328	ATT	2	6	547379	547384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853705
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13999	NC_014328	A	6	6	562967	562972	100 %	0 %	0 %	0 %	300853719
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