MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_014328	TAAA	2	8	520448	520455	75 %	25 %	0 %	0 %	300853685
13003	NC_014328	TAA	2	6	520481	520486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853685
13004	NC_014328	TGCC	2	8	520503	520510	0 %	25 %	25 %	50 %	300853685
13005	NC_014328	CCT	2	6	520695	520700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853686
13006	NC_014328	CAG	3	9	520734	520742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853686
13007	NC_014328	CAT	2	6	520765	520770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853686
13008	NC_014328	GTAG	2	8	520786	520793	25 %	25 %	50 %	0 %	300853686
13009	NC_014328	TG	3	6	520798	520803	0 %	50 %	50 %	0 %	300853686
13010	NC_014328	TGT	2	6	520870	520875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853686
13011	NC_014328	CTTG	2	8	520901	520908	0 %	50 %	25 %	25 %	300853686
13012	NC_014328	TAT	2	6	520981	520986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853686
13013	NC_014328	T	6	6	521045	521050	0 %	100 %	0 %	0 %	300853686
13014	NC_014328	TAC	2	6	521080	521085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853686
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13017	NC_014328	T	7	7	521160	521166	0 %	100 %	0 %	0 %	300853686
13018	NC_014328	GATA	2	8	521194	521201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_014328	ATG	2	6	521283	521288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_014328	ATT	2	6	521305	521310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853687
13021	NC_014328	AGC	2	6	521343	521348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853687
13022	NC_014328	A	9	9	521363	521371	100 %	0 %	0 %	0 %	300853687
13023	NC_014328	GCA	2	6	521485	521490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853687
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13025	NC_014328	AGA	2	6	521559	521564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853687
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13033	NC_014328	AAG	2	6	521933	521938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853687
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13035	NC_014328	GAATA	2	10	521975	521984	60 %	20 %	20 %	0 %	300853687
13036	NC_014328	TTGT	2	8	522078	522085	0 %	75 %	25 %	0 %	300853688
13037	NC_014328	TA	3	6	522121	522126	50 %	50 %	0 %	0 %	300853688
13038	NC_014328	ATC	2	6	522171	522176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853688
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13042	NC_014328	TC	3	6	522412	522417	0 %	50 %	0 %	50 %	300853688
13043	NC_014328	GCC	2	6	522474	522479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300853688
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13050	NC_014328	TAC	2	6	522692	522697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853688
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13055	NC_014328	ATT	2	6	523110	523115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853688
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13057	NC_014328	CTG	2	6	523136	523141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853688
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13060	NC_014328	CTT	2	6	523436	523441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853688
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13063	NC_014328	T	6	6	523539	523544	0 %	100 %	0 %	0 %	300853688
13064	NC_014328	AGT	2	6	523557	523562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853688
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13101	NC_014328	TAT	2	6	525124	525129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_014328	CTATA	2	10	525139	525148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13104	NC_014328	TAT	2	6	525184	525189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_014328	AT	3	6	525188	525193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_014328	TTA	2	6	525209	525214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_014328	ATT	2	6	525224	525229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13109	NC_014328	TAT	2	6	525325	525330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853689
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13493	NC_014328	TA	3	6	542277	542282	50 %	50 %	0 %	0 %	300853700
13494	NC_014328	T	7	7	542284	542290	0 %	100 %	0 %	0 %	300853700
13495	NC_014328	AT	3	6	542297	542302	50 %	50 %	0 %	0 %	300853700
13496	NC_014328	GTCA	2	8	542310	542317	25 %	25 %	25 %	25 %	300853700
13497	NC_014328	GTATC	2	10	542443	542452	20 %	40 %	20 %	20 %	300853700
13498	NC_014328	GGCT	2	8	542493	542500	0 %	25 %	50 %	25 %	300853700
13499	NC_014328	TAC	2	6	542520	542525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853700
13500	NC_014328	ATC	2	6	542526	542531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853700

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