MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 16485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	TA	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AT	3	6	121	126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014109	AAT	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	ATT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014109	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014109	ATGT	2	8	276	283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014109	T	6	6	283	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014109	A	6	6	296	301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	TTATT	2	10	308	317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014109	AACT	2	8	320	327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014109	A	7	7	341	347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014109	T	6	6	361	366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014109	T	6	6	372	377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014109	A	7	7	388	394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014109	T	8	8	533	540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	AT	3	6	558	563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	AAATT	2	10	571	580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	A	7	7	598	604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TCAA	2	8	622	629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014109	ATA	3	9	664	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	ATA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014109	A	6	6	749	754	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
25	NC_014109	GTAA	2	8	755	762	50 %	25 %	25 %	0 %	295698241
26	NC_014109	ACT	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698241
27	NC_014109	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
28	NC_014109	A	8	8	883	890	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
29	NC_014109	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
30	NC_014109	GTT	2	6	981	986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698241
31	NC_014109	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
32	NC_014109	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
33	NC_014109	GAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698241
34	NC_014109	GGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698241
35	NC_014109	ATT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
36	NC_014109	T	6	6	1209	1214	0 %	100 %	0 %	0 %	295698241
37	NC_014109	A	6	6	1217	1222	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
38	NC_014109	T	6	6	1226	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	295698241
39	NC_014109	A	7	7	1233	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
40	NC_014109	A	6	6	1266	1271	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
41	NC_014109	AT	3	6	1277	1282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014109	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014109	T	8	8	1335	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014109	TAAA	2	8	1349	1356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014109	TA	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014109	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014109	TCAA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014109	TAG	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014109	A	7	7	1613	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014109	T	6	6	1661	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014109	A	6	6	1675	1680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	TAT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	A	10	10	1713	1722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	TAG	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014109	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014109	AAG	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014109	GATC	2	8	1799	1806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014109	AGAT	2	8	1829	1836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	TAGG	2	8	1845	1852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014109	A	6	6	1865	1870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014109	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014109	AAAAT	2	10	1915	1924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014109	T	9	9	1931	1939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014109	A	9	9	1940	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014109	T	8	8	2012	2019	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
66	NC_014109	ATTA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	295698242
67	NC_014109	AGAA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	295698242
68	NC_014109	A	6	6	2076	2081	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
69	NC_014109	TCC	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698242
70	NC_014109	TTTC	2	8	2239	2246	0 %	75 %	0 %	25 %	295698242
71	NC_014109	CTA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
72	NC_014109	TTC	2	6	2340	2345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698242
73	NC_014109	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698242
74	NC_014109	TGT	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698242
75	NC_014109	GTA	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698242
76	NC_014109	TTTTC	2	10	2503	2512	0 %	80 %	0 %	20 %	295698242
77	NC_014109	TAA	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
78	NC_014109	T	9	9	2557	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
79	NC_014109	T	7	7	2593	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
80	NC_014109	A	6	6	2625	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
81	NC_014109	TAT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698242
82	NC_014109	CAT	2	6	2672	2677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
83	NC_014109	AAT	2	6	2680	2685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
84	NC_014109	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
85	NC_014109	T	7	7	2718	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
86	NC_014109	AATA	2	8	2726	2733	75 %	25 %	0 %	0 %	295698242
87	NC_014109	AAG	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698242
88	NC_014109	A	6	6	2785	2790	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
89	NC_014109	T	6	6	2848	2853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	TATC	2	8	2906	2913	25 %	50 %	0 %	25 %	295698243
91	NC_014109	TCT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
92	NC_014109	AAT	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
93	NC_014109	TAA	2	6	2997	3002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
94	NC_014109	CTC	3	9	3026	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
95	NC_014109	AT	3	6	3059	3064	50 %	50 %	0 %	0 %	295698243
96	NC_014109	TAA	2	6	3165	3170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
97	NC_014109	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
98	NC_014109	TGAT	2	8	3234	3241	25 %	50 %	25 %	0 %	295698243
99	NC_014109	CTG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698243
100	NC_014109	TCT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
101	NC_014109	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698243
102	NC_014109	TCC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
103	NC_014109	AGA	3	9	3360	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698243
104	NC_014109	AGT	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698243
105	NC_014109	CCT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
106	NC_014109	AGC	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698243
107	NC_014109	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
108	NC_014109	CT	3	6	3507	3512	0 %	50 %	0 %	50 %	295698243
109	NC_014109	TTC	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
110	NC_014109	GCT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014109	GATC	2	8	3781	3788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014109	T	6	6	3905	3910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014109	TTGA	2	8	3923	3930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014109	TAA	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014109	TTG	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014109	ATT	3	9	3968	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014109	AAATAG	2	12	4002	4013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014109	AAAT	2	8	4081	4088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014109	GAA	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014109	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014109	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014109	T	8	8	4161	4168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014109	ATT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014109	GAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014109	TATTTT	2	12	4327	4338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295698244
126	NC_014109	T	7	7	4369	4375	0 %	100 %	0 %	0 %	295698244
127	NC_014109	AT	3	6	4388	4393	50 %	50 %	0 %	0 %	295698244
128	NC_014109	CT	3	6	4412	4417	0 %	50 %	0 %	50 %	295698244
129	NC_014109	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
130	NC_014109	A	6	6	4483	4488	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
131	NC_014109	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
132	NC_014109	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698245
133	NC_014109	A	7	7	4606	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
134	NC_014109	TTTC	2	8	4650	4657	0 %	75 %	0 %	25 %	295698245
135	NC_014109	TCAT	2	8	4688	4695	25 %	50 %	0 %	25 %	295698245
136	NC_014109	AAG	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
137	NC_014109	ATTTT	2	10	4715	4724	20 %	80 %	0 %	0 %	295698245
138	NC_014109	ATCTT	2	10	4848	4857	20 %	60 %	0 %	20 %	295698245
139	NC_014109	GTTA	2	8	4953	4960	25 %	50 %	25 %	0 %	295698245
140	NC_014109	TA	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	295698245
141	NC_014109	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
142	NC_014109	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014109	A	6	6	5004	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	295698246
144	NC_014109	GAAATT	2	12	5042	5053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295698246
145	NC_014109	TAA	2	6	5070	5075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698246
146	NC_014109	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	295698246
147	NC_014109	GAAA	2	8	5162	5169	75 %	0 %	25 %	0 %	295698246
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288	NC_014109	GGT	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698250
289	NC_014109	ATT	2	6	9506	9511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698250
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291	NC_014109	T	7	7	9526	9532	0 %	100 %	0 %	0 %	295698250
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298	NC_014109	TGAT	2	8	9775	9782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_014109	TAT	2	6	13701	13706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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