MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 36098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013895	AGT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013895	TTAA	2	8	130	137	50 %	50 %	0 %	0 %	289450862
4	NC_013895	TTC	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289450862
5	NC_013895	ATTAA	2	10	319	328	60 %	40 %	0 %	0 %	289450862
6	NC_013895	GCA	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450862
7	NC_013895	CGG	2	6	513	518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289450862
8	NC_013895	ATT	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450862
9	NC_013895	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450862
10	NC_013895	TGA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
11	NC_013895	GTA	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
12	NC_013895	CA	3	6	815	820	50 %	0 %	0 %	50 %	289450862
13	NC_013895	GAA	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450862
14	NC_013895	TTG	2	6	872	877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450862
15	NC_013895	A	6	6	920	925	100 %	0 %	0 %	0 %	289450862
16	NC_013895	AT	3	6	969	974	50 %	50 %	0 %	0 %	289450862
17	NC_013895	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
18	NC_013895	GCT	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450862
19	NC_013895	AATTT	2	10	1090	1099	40 %	60 %	0 %	0 %	289450862
20	NC_013895	ATA	2	6	1135	1140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
21	NC_013895	A	6	6	1188	1193	100 %	0 %	0 %	0 %	289450862
22	NC_013895	CGG	2	6	1287	1292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289450862
23	NC_013895	CAT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450862
24	NC_013895	ATG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
25	NC_013895	AGG	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450862
26	NC_013895	AAT	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
27	NC_013895	CAG	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450862
28	NC_013895	GGT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450862
29	NC_013895	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013895	ATT	2	6	1521	1526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013895	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013895	TATAA	2	10	1562	1571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013895	ATA	2	6	1607	1612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013895	AGA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013895	TAAC	2	8	1623	1630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013895	AG	3	6	1637	1642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013895	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
38	NC_013895	AAC	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450447
39	NC_013895	TAATT	2	10	1769	1778	40 %	60 %	0 %	0 %	289450447
40	NC_013895	GAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450447
41	NC_013895	AAGGT	2	10	1840	1849	40 %	20 %	40 %	0 %	289450447
42	NC_013895	ATT	2	6	1866	1871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
43	NC_013895	GCT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450447
44	NC_013895	ATT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
45	NC_013895	TAAG	2	8	1954	1961	50 %	25 %	25 %	0 %	289450447
46	NC_013895	CTG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450447
47	NC_013895	TAG	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
48	NC_013895	TAA	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450447
49	NC_013895	A	7	7	2069	2075	100 %	0 %	0 %	0 %	289450447
50	NC_013895	T	6	6	2080	2085	0 %	100 %	0 %	0 %	289450447
51	NC_013895	AAAG	2	8	2132	2139	75 %	0 %	25 %	0 %	289450447
52	NC_013895	TTA	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
53	NC_013895	GAA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450447
54	NC_013895	A	6	6	2304	2309	100 %	0 %	0 %	0 %	289450447
55	NC_013895	TA	3	6	2373	2378	50 %	50 %	0 %	0 %	289450447
56	NC_013895	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
57	NC_013895	ATAA	2	8	2541	2548	75 %	25 %	0 %	0 %	289450447
58	NC_013895	ATT	2	6	2568	2573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
59	NC_013895	TTA	2	6	2618	2623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
60	NC_013895	GAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
61	NC_013895	A	6	6	2656	2661	100 %	0 %	0 %	0 %	289450447
62	NC_013895	TTA	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
63	NC_013895	ATAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	289450447
64	NC_013895	AAT	2	6	2752	2757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450447
65	NC_013895	GCC	2	6	2811	2816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013895	ATA	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
67	NC_013895	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
68	NC_013895	CAT	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
69	NC_013895	AAAT	2	8	2890	2897	75 %	25 %	0 %	0 %	289449549
70	NC_013895	T	6	6	2899	2904	0 %	100 %	0 %	0 %	289449549
71	NC_013895	ATCT	2	8	2946	2953	25 %	50 %	0 %	25 %	289449549
72	NC_013895	TTA	2	6	2998	3003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449549
73	NC_013895	AGC	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289449549
74	NC_013895	A	6	6	3084	3089	100 %	0 %	0 %	0 %	289449549
75	NC_013895	TCT	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449549
76	NC_013895	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
77	NC_013895	ATG	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
78	NC_013895	TTG	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289449549
79	NC_013895	GGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289449549
80	NC_013895	AAG	3	9	3233	3241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289449549
81	NC_013895	AAT	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
82	NC_013895	TA	3	6	3411	3416	50 %	50 %	0 %	0 %	289449549
83	NC_013895	CAA	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289449549
84	NC_013895	TCT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449549
85	NC_013895	TGAT	2	8	3499	3506	25 %	50 %	25 %	0 %	289449549
86	NC_013895	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
87	NC_013895	CAT	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
88	NC_013895	TAA	3	9	3662	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
89	NC_013895	TAT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449549
90	NC_013895	GAT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
91	NC_013895	GAA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289449549
92	NC_013895	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	289449549
93	NC_013895	TAAA	2	8	3962	3969	75 %	25 %	0 %	0 %	289449549
94	NC_013895	ATTA	2	8	4031	4038	50 %	50 %	0 %	0 %	289449682
95	NC_013895	T	8	8	4095	4102	0 %	100 %	0 %	0 %	289449682
96	NC_013895	A	7	7	4114	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	289449682
97	NC_013895	ATTG	2	8	4133	4140	25 %	50 %	25 %	0 %	289449682
98	NC_013895	GAT	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449682
99	NC_013895	A	7	7	4326	4332	100 %	0 %	0 %	0 %	289450191
100	NC_013895	TGA	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
101	NC_013895	ATG	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
102	NC_013895	TTAA	2	8	4392	4399	50 %	50 %	0 %	0 %	289450191
103	NC_013895	A	7	7	4441	4447	100 %	0 %	0 %	0 %	289450191
104	NC_013895	A	7	7	4465	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	289450191
105	NC_013895	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
106	NC_013895	TA	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	289450191
107	NC_013895	CAT	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450191
108	NC_013895	TTG	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
109	NC_013895	ATTT	2	8	4665	4672	25 %	75 %	0 %	0 %	289450191
110	NC_013895	ATG	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
111	NC_013895	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
112	NC_013895	GTT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
113	NC_013895	GGA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
114	NC_013895	TGG	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450191
115	NC_013895	TGGA	2	8	4875	4882	25 %	25 %	50 %	0 %	289450191
116	NC_013895	TGTA	2	8	4885	4892	25 %	50 %	25 %	0 %	289450191
117	NC_013895	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
118	NC_013895	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
119	NC_013895	TAA	2	6	5084	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
120	NC_013895	GAA	3	9	5124	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450191
121	NC_013895	GTA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
122	NC_013895	ATG	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
123	NC_013895	AAT	2	6	5165	5170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
124	NC_013895	TTG	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
125	NC_013895	TAG	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
126	NC_013895	ATAA	2	8	5241	5248	75 %	25 %	0 %	0 %	289450191
127	NC_013895	AAT	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
128	NC_013895	AGG	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
129	NC_013895	CA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	0 %	50 %	289450191
130	NC_013895	TAA	2	6	5377	5382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
131	NC_013895	TAG	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
132	NC_013895	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450191
133	NC_013895	TGC	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450191
134	NC_013895	A	6	6	5657	5662	100 %	0 %	0 %	0 %	289450191
135	NC_013895	A	6	6	5684	5689	100 %	0 %	0 %	0 %	289450191
136	NC_013895	TTG	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
137	NC_013895	GGA	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
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253	NC_013895	TAA	2	6	10241	10246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_013895	TA	3	6	10697	10702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013895	TGA	2	6	10728	10733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_013895	AAG	2	6	10751	10756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308513213
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267	NC_013895	ATTT	2	8	10783	10790	25 %	75 %	0 %	0 %	308513213
268	NC_013895	T	6	6	10930	10935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_013895	TTG	2	6	10958	10963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_013895	CTT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_013895	GAG	2	6	11021	11026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013895	ATA	2	6	11039	11044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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