MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013161	TAC	2	6	440872	440877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_013161	TG	3	6	440999	441004	0 %	50 %	50 %	0 %	257058350
9003	NC_013161	ATT	2	6	441104	441109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058350
9004	NC_013161	TGG	2	6	441126	441131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058350
9005	NC_013161	GCC	2	6	441173	441178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058350
9006	NC_013161	G	6	6	441292	441297	0 %	0 %	100 %	0 %	257058350
9007	NC_013161	TGC	2	6	441348	441353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058350
9008	NC_013161	TAA	2	6	441361	441366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058350
9009	NC_013161	AAC	2	6	441394	441399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058350
9010	NC_013161	AGG	2	6	441463	441468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058350
9011	NC_013161	G	6	6	441559	441564	0 %	0 %	100 %	0 %	257058350
9012	NC_013161	AGGTCC	2	12	441565	441576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257058350
9013	NC_013161	TGA	2	6	441637	441642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058350
9014	NC_013161	GTG	2	6	441644	441649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058350
9015	NC_013161	GAT	2	6	441659	441664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058350
9016	NC_013161	CGT	2	6	441683	441688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058350
9017	NC_013161	ATT	2	6	441706	441711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058350
9018	NC_013161	GCG	2	6	441740	441745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058350
9019	NC_013161	TCC	2	6	441853	441858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058350
9020	NC_013161	AAT	2	6	441876	441881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058350
9021	NC_013161	GTT	2	6	441948	441953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_013161	GCC	2	6	442118	442123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058351
9023	NC_013161	ATT	2	6	442136	442141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058351
9024	NC_013161	TGC	2	6	442150	442155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058351
9025	NC_013161	GCG	2	6	442183	442188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058351
9026	NC_013161	CAA	2	6	442199	442204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058351
9027	NC_013161	AAGA	2	8	442236	442243	75 %	0 %	25 %	0 %	257058351
9028	NC_013161	TAT	2	6	442262	442267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058351
9029	NC_013161	A	6	6	442290	442295	100 %	0 %	0 %	0 %	257058351
9030	NC_013161	ATT	2	6	442301	442306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058351
9031	NC_013161	TTA	2	6	442362	442367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058351
9032	NC_013161	TGA	2	6	442387	442392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058351
9033	NC_013161	TGA	3	9	442411	442419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058351
9034	NC_013161	AGA	2	6	442447	442452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058351
9035	NC_013161	AGCA	2	8	442470	442477	50 %	0 %	25 %	25 %	257058351
9036	NC_013161	ATCC	2	8	442503	442510	25 %	25 %	0 %	50 %	257058351
9037	NC_013161	GCT	2	6	442514	442519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058351
9038	NC_013161	AGC	2	6	442525	442530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058351
9039	NC_013161	TC	3	6	442532	442537	0 %	50 %	0 %	50 %	257058351
9040	NC_013161	TTTG	2	8	442542	442549	0 %	75 %	25 %	0 %	257058351
9041	NC_013161	TGA	2	6	442570	442575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058351
9042	NC_013161	ATG	2	6	442599	442604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058351
9043	NC_013161	ATT	2	6	442630	442635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058351
9044	NC_013161	TGAT	2	8	442674	442681	25 %	50 %	25 %	0 %	257058351
9045	NC_013161	AGC	2	6	442714	442719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058352
9046	NC_013161	TTC	2	6	442726	442731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058352
9047	NC_013161	CTT	2	6	442752	442757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058352
9048	NC_013161	CTG	2	6	442833	442838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058352
9049	NC_013161	TCC	2	6	442972	442977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058352
9050	NC_013161	TGA	4	12	442982	442993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058352
9051	NC_013161	TCT	2	6	443009	443014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058352
9052	NC_013161	AGT	2	6	443065	443070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058352
9053	NC_013161	TAT	2	6	443103	443108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_013161	ATC	2	6	443153	443158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058353
9055	NC_013161	TGA	2	6	443190	443195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058353
9056	NC_013161	TCT	2	6	443208	443213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058353
9057	NC_013161	AAC	2	6	443248	443253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058353
9058	NC_013161	TTG	2	6	443298	443303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058353
9059	NC_013161	T	6	6	443307	443312	0 %	100 %	0 %	0 %	257058353
9060	NC_013161	CTT	2	6	443326	443331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058353
9061	NC_013161	ATC	2	6	443357	443362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058353
9062	NC_013161	ATC	2	6	443397	443402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058353
9063	NC_013161	TCC	2	6	443450	443455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058353
9064	NC_013161	T	6	6	443486	443491	0 %	100 %	0 %	0 %	257058353
9065	NC_013161	GAC	2	6	443497	443502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058353
9066	NC_013161	TCC	2	6	443525	443530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058353
9067	NC_013161	TTG	2	6	443612	443617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058353
9068	NC_013161	AT	3	6	443625	443630	50 %	50 %	0 %	0 %	257058353
9069	NC_013161	GATTA	2	10	443676	443685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_013161	A	6	6	443698	443703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_013161	TTC	2	6	443792	443797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_013161	ATC	2	6	443850	443855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058354
9073	NC_013161	AGA	2	6	443875	443880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058354
9074	NC_013161	GA	3	6	443879	443884	50 %	0 %	50 %	0 %	257058354
9075	NC_013161	TTG	2	6	443956	443961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058354
9076	NC_013161	CTT	2	6	443997	444002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058354
9077	NC_013161	ATT	2	6	444037	444042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058354
9078	NC_013161	CAT	2	6	444072	444077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058354
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9080	NC_013161	TCTAAA	2	12	444131	444142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257058354
9081	NC_013161	GATG	2	8	444212	444219	25 %	25 %	50 %	0 %	257058354
9082	NC_013161	TAA	2	6	444241	444246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_013161	TGTCT	2	10	444255	444264	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9084	NC_013161	T	6	6	444270	444275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_013161	G	6	6	444399	444404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_013161	CAA	2	6	444416	444421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_013161	T	8	8	444501	444508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_013161	CAA	2	6	444540	444545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_013161	T	6	6	444599	444604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_013161	T	6	6	444790	444795	0 %	100 %	0 %	0 %	257058355
9091	NC_013161	TCA	2	6	444797	444802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058355
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9093	NC_013161	GAT	2	6	444861	444866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058355
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9096	NC_013161	CAT	2	6	444991	444996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058355
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9098	NC_013161	TTTC	2	8	445056	445063	0 %	75 %	0 %	25 %	257058355
9099	NC_013161	AACGA	2	10	445072	445081	60 %	0 %	20 %	20 %	257058355
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9102	NC_013161	CTA	2	6	445296	445301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058355
9103	NC_013161	ATA	2	6	445364	445369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058355
9104	NC_013161	GAC	2	6	445420	445425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058355
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9107	NC_013161	TAA	2	6	445507	445512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058355
9108	NC_013161	AATC	2	8	445513	445520	50 %	25 %	0 %	25 %	257058355
9109	NC_013161	CAGA	2	8	445521	445528	50 %	0 %	25 %	25 %	257058355
9110	NC_013161	TAA	2	6	445561	445566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058355
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9112	NC_013161	ATT	2	6	445657	445662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058355
9113	NC_013161	AAT	3	9	445678	445686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058355
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9116	NC_013161	AATTA	2	10	445741	445750	60 %	40 %	0 %	0 %	257058355
9117	NC_013161	TTG	2	6	445777	445782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058355
9118	NC_013161	A	6	6	445802	445807	100 %	0 %	0 %	0 %	257058355
9119	NC_013161	A	6	6	445843	445848	100 %	0 %	0 %	0 %	257058355
9120	NC_013161	TAA	2	6	445875	445880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058355
9121	NC_013161	CTT	2	6	446001	446006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058355
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9498	NC_013161	A	7	7	467297	467303	100 %	0 %	0 %	0 %	257058374
9499	NC_013161	TCC	2	6	467333	467338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058375
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