MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013161	A	6	6	361926	361931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_013161	GTTA	2	8	361990	361997	25 %	50 %	25 %	0 %	257058280
7503	NC_013161	CAC	2	6	362064	362069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058280
7504	NC_013161	CTG	2	6	362076	362081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7505	NC_013161	CGT	2	6	362153	362158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7506	NC_013161	CAGGA	2	10	362232	362241	40 %	0 %	40 %	20 %	257058280
7507	NC_013161	CCG	2	6	362285	362290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058280
7508	NC_013161	ATC	2	6	362311	362316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058280
7509	NC_013161	GCA	2	6	362431	362436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7510	NC_013161	CACTCC	2	12	362463	362474	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	257058280
7511	NC_013161	AGC	2	6	362496	362501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7512	NC_013161	CGG	2	6	362525	362530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058280
7513	NC_013161	TCA	2	6	362543	362548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058280
7514	NC_013161	GGGCAT	2	12	362592	362603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257058280
7515	NC_013161	ACA	2	6	362668	362673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058280
7516	NC_013161	CCG	2	6	362738	362743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058280
7517	NC_013161	GCT	2	6	362758	362763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7518	NC_013161	TAGGGT	2	12	362891	362902	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257058280
7519	NC_013161	CAT	2	6	362903	362908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058280
7520	NC_013161	CCAT	2	8	362992	362999	25 %	25 %	0 %	50 %	257058280
7521	NC_013161	GCC	2	6	363033	363038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058280
7522	NC_013161	TCG	2	6	363120	363125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280
7523	NC_013161	AAT	2	6	363144	363149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058280
7524	NC_013161	TTC	2	6	363248	363253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_013161	AATC	2	8	363298	363305	50 %	25 %	0 %	25 %	257058281
7526	NC_013161	GTA	2	6	363346	363351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058281
7527	NC_013161	ACA	2	6	363403	363408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058281
7528	NC_013161	CAA	2	6	363509	363514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058281
7529	NC_013161	TCA	2	6	363713	363718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058281
7530	NC_013161	TCC	2	6	363760	363765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058281
7531	NC_013161	TAA	2	6	363800	363805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058281
7532	NC_013161	ATT	4	12	363816	363827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058281
7533	NC_013161	TTC	2	6	363920	363925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058281
7534	NC_013161	TCCTG	2	10	363940	363949	0 %	40 %	20 %	40 %	257058281
7535	NC_013161	GTT	2	6	364006	364011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058281
7536	NC_013161	CAC	2	6	364014	364019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058281
7537	NC_013161	TCC	2	6	364029	364034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058281
7538	NC_013161	TAT	2	6	364073	364078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058281
7539	NC_013161	CTG	2	6	364153	364158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058281
7540	NC_013161	TTC	2	6	364171	364176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058281
7541	NC_013161	GAT	2	6	364267	364272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058281
7542	NC_013161	CTT	2	6	364291	364296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_013161	T	7	7	364295	364301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_013161	T	6	6	364318	364323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_013161	AT	3	6	364390	364395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_013161	ATTT	2	8	364431	364438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_013161	A	6	6	364444	364449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_013161	TTA	2	6	364496	364501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_013161	GAG	2	6	364564	364569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_013161	GTT	2	6	364617	364622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_013161	T	7	7	364628	364634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_013161	ATC	2	6	364707	364712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_013161	AGG	2	6	364754	364759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_013161	C	6	6	364767	364772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7555	NC_013161	TGA	2	6	364802	364807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_013161	AT	3	6	364853	364858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_013161	A	6	6	364874	364879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_013161	TTA	2	6	364882	364887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_013161	AT	3	6	364946	364951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_013161	AAC	2	6	364962	364967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_013161	TAA	2	6	364997	365002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013161	CA	3	6	365008	365013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7563	NC_013161	ATTA	2	8	365016	365023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_013161	ATA	3	9	365036	365044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_013161	GA	3	6	365092	365097	50 %	0 %	50 %	0 %	257058282
7566	NC_013161	TAA	2	6	365124	365129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058282
7567	NC_013161	AGTG	2	8	365233	365240	25 %	25 %	50 %	0 %	257058282
7568	NC_013161	A	6	6	365241	365246	100 %	0 %	0 %	0 %	257058282
7569	NC_013161	CTAT	2	8	365247	365254	25 %	50 %	0 %	25 %	257058282
7570	NC_013161	ATT	2	6	365284	365289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058282
7571	NC_013161	AAC	2	6	365340	365345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058282
7572	NC_013161	GAA	2	6	365372	365377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058282
7573	NC_013161	A	6	6	365390	365395	100 %	0 %	0 %	0 %	257058282
7574	NC_013161	AAT	2	6	365455	365460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058282
7575	NC_013161	A	6	6	365461	365466	100 %	0 %	0 %	0 %	257058282
7576	NC_013161	GAA	2	6	365516	365521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058282
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7578	NC_013161	A	6	6	365573	365578	100 %	0 %	0 %	0 %	257058282
7579	NC_013161	AT	3	6	365629	365634	50 %	50 %	0 %	0 %	257058282
7580	NC_013161	CAA	2	6	365661	365666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058282
7581	NC_013161	TCA	2	6	365722	365727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058282
7582	NC_013161	TAC	2	6	365735	365740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058282
7583	NC_013161	CAAA	2	8	365812	365819	75 %	0 %	0 %	25 %	257058282
7584	NC_013161	ATT	2	6	365825	365830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058282
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7587	NC_013161	CTTA	2	8	366013	366020	25 %	50 %	0 %	25 %	257058282
7588	NC_013161	A	6	6	366029	366034	100 %	0 %	0 %	0 %	257058282
7589	NC_013161	TAAT	2	8	366063	366070	50 %	50 %	0 %	0 %	257058282
7590	NC_013161	TCCTAT	2	12	366176	366187	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7591	NC_013161	GGA	2	6	366206	366211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_013161	CTC	2	6	366240	366245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_013161	AGG	2	6	366460	366465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_013161	ATA	2	6	366857	366862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_013161	TAT	2	6	366865	366870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_013161	C	7	7	366935	366941	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7597	NC_013161	GCA	2	6	367100	367105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_013161	GACG	2	8	367153	367160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7599	NC_013161	AGG	2	6	367218	367223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_013161	AGA	2	6	367254	367259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_013161	GAT	2	6	367336	367341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_013161	TGG	2	6	367377	367382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_013161	AAG	2	6	367415	367420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_013161	ATT	2	6	367528	367533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_013161	CAA	2	6	367567	367572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_013161	ATA	2	6	367592	367597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_013161	T	6	6	367631	367636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_013161	TCT	2	6	367804	367809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058283
7609	NC_013161	TAG	2	6	367867	367872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058283
7610	NC_013161	GA	3	6	367903	367908	50 %	0 %	50 %	0 %	257058283
7611	NC_013161	TGA	2	6	368001	368006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058283
7612	NC_013161	TAG	2	6	368141	368146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058283
7613	NC_013161	GA	3	6	368155	368160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_013161	GAG	2	6	368206	368211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_013161	TAAA	2	8	368267	368274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_013161	CAAT	2	8	368279	368286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7617	NC_013161	TGC	2	6	368300	368305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_013161	TACT	2	8	368362	368369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7619	NC_013161	TGC	2	6	368542	368547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058284
7620	NC_013161	ACAG	2	8	368664	368671	50 %	0 %	25 %	25 %	257058284
7621	NC_013161	GAGT	2	8	368763	368770	25 %	25 %	50 %	0 %	257058284
7622	NC_013161	TC	4	8	368799	368806	0 %	50 %	0 %	50 %	257058284
7623	NC_013161	AGGGTG	2	12	368856	368867	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	257058284
7624	NC_013161	G	6	6	368869	368874	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_013161	G	7	7	368892	368898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_013161	GGA	2	6	368916	368921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_013161	AG	3	6	368965	368970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_013161	ACG	2	6	369008	369013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058285
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